RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482458.1

STK40-208, Transcript of serine/threonine kinase 40, human

TSL 3

Gene STK40, Length 900 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STK40-208	ENST00000482458	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		44.66	■■■■■ 4.74
STK40-208	ENST00000482458	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	44.56	■■■■■ 4.72
STK40-208	ENST00000482458	IGF1R	P08069	1367 aa		44.53	■■■■■ 4.72
STK40-208	ENST00000482458	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		44.5	■■■■■ 4.71
STK40-208	ENST00000482458	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		44.5	■■■■■ 4.71
STK40-208	ENST00000482458	KIF27	Q86VH2	1401 aa		44.5	■■■■■ 4.71
STK40-208	ENST00000482458	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		44.49	■■■■■ 4.71
STK40-208	ENST00000482458	MAPKBP1	O60336	1514 aa		44.45	■■■■■ 4.71
STK40-208	ENST00000482458	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		44.44	■■■■■ 4.7
STK40-208	ENST00000482458	CUL7	Q14999	1698 aa		44.42	■■■■■ 4.7
STK40-208	ENST00000482458	DIP2B	Q9P265	1576 aa		44.35	■■■■■ 4.69
STK40-208	ENST00000482458	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		44.23	■■■■■ 4.67
STK40-208	ENST00000482458	PTPRG	P23470	1445 aa		44.19	■■■■■ 4.66
STK40-208	ENST00000482458	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	44.13	■■■■■ 4.65
STK40-208	ENST00000482458	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		44.09	■■■■■ 4.65
STK40-208	ENST00000482458	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		44.07	■■■■■ 4.65
STK40-208	ENST00000482458	KDM6B	O15054	1643 aa		44.07	■■■■■ 4.65
STK40-208	ENST00000482458	TSPOAP1	O95153	1857 aa		44.02	■■■■■ 4.64
STK40-208	ENST00000482458	IQGAP2	Q13576	1575 aa		44	■■■■■ 4.63
STK40-208	ENST00000482458	ABCC2	Q92887	1545 aa		43.99	■■■■■ 4.63
STK40-208	ENST00000482458	ASXL2	Q76L83	1435 aa		43.89	■■■■■ 4.62
STK40-208	ENST00000482458	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		43.86	■■■■■ 4.61
STK40-208	ENST00000482458	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		43.85	■■■■■ 4.61
STK40-208	ENST00000482458	DISP1	Q96F81	1524 aa		43.84	■■■■■ 4.61
STK40-208	ENST00000482458	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		43.84	■■■■■ 4.61
STK40-208	ENST00000482458	UACA	Q9BZF9	1416 aa		43.83	■■■■■ 4.61
STK40-208	ENST00000482458	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		43.77	■■■■■ 4.6
STK40-208	ENST00000482458	GLI2	P10070	1586 aa		43.77	■■■■■ 4.6
STK40-208	ENST00000482458	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		43.72	■■■■■ 4.59
STK40-208	ENST00000482458	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	43.69	■■■■■ 4.58
STK40-208	ENST00000482458	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		43.66	■■■■■ 4.58
STK40-208	ENST00000482458	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	43.61	■■■■■ 4.57
STK40-208	ENST00000482458	KIAA0556	O60303	1618 aa		43.61	■■■■■ 4.57
STK40-208	ENST00000482458	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	43.55	■■■■■ 4.56
STK40-208	ENST00000482458	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		43.51	■■■■■ 4.56
STK40-208	ENST00000482458	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	43.49	■■■■■ 4.55
STK40-208	ENST00000482458	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		43.45	■■■■■ 4.55
STK40-208	ENST00000482458	ADGRL1	O94910	1474 aa		43.39	■■■■■ 4.54
STK40-208	ENST00000482458	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		43.38	■■■■■ 4.54
STK40-208	ENST00000482458	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		43.37	■■■■■ 4.53
STK40-208	ENST00000482458	GOLGA3	Q08378	1498 aa		43.34	■■■■■ 4.53
STK40-208	ENST00000482458	ABCA8	O94911	1581 aa		43.24	■■■■■ 4.51
STK40-208	ENST00000482458	PRX	Q9BXM0	1461 aa		43.22	■■■■■ 4.51
STK40-208	ENST00000482458	KCNH8	Q96L42	1107 aa		43.19	■■■■■ 4.5
STK40-208	ENST00000482458	CD109	Q6YHK3	1445 aa		43.18	■■■■■ 4.5
STK40-208	ENST00000482458	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		43.14	■■■■■ 4.5
STK40-208	ENST00000482458	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		43.11	■■■■■ 4.49
STK40-208	ENST00000482458	P3H3	Q8IVL6	736 aa		42.98	■■■■■ 4.47
STK40-208	ENST00000482458	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	42.98	■■■■■ 4.47
STK40-208	ENST00000482458	ARID3C	A6NKF2	412 aa		42.97	■■■■■ 4.47
STK40-208	ENST00000482458	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	42.91	■■■■■ 4.46
STK40-208	ENST00000482458	ATP10B	O94823	1461 aa		42.9	■■■■■ 4.46
STK40-208	ENST00000482458	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.9	■■■■■ 4.46
STK40-208	ENST00000482458	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		42.81	■■■■■ 4.44
STK40-208	ENST00000482458	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		42.81	■■■■■ 4.44
STK40-208	ENST00000482458	KIF21B	O75037	1637 aa		42.76	■■■■■ 4.44
STK40-208	ENST00000482458	SAMD9	Q5K651	1589 aa		42.76	■■■■■ 4.44
STK40-208	ENST00000482458	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		42.73	■■■■■ 4.43
STK40-208	ENST00000482458	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		42.69	■■■■■ 4.42
STK40-208	ENST00000482458	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		42.69	■■■■■ 4.42
STK40-208	ENST00000482458	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	42.65	■■■■■ 4.42
STK40-208	ENST00000482458	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	42.65	■■■■■ 4.42
STK40-208	ENST00000482458	RAPGEF3	O95398	923 aa		42.59	■■■■■ 4.41
STK40-208	ENST00000482458	NEO1	Q92859	1461 aa		42.58	■■■■■ 4.41
STK40-208	ENST00000482458	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	42.58	■■■■■ 4.41
STK40-208	ENST00000482458	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	42.56	■■■■■ 4.4
STK40-208	ENST00000482458	EEA1	Q15075	1411 aa		42.53	■■■■■ 4.4
STK40-208	ENST00000482458	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		42.52	■■■■■ 4.4
STK40-208	ENST00000482458	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		42.43	■■■■■ 4.38
STK40-208	ENST00000482458	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		42.43	■■■■■ 4.38
STK40-208	ENST00000482458	PTPRM	P28827	1452 aa		42.43	■■■■■ 4.38
STK40-208	ENST00000482458	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		42.4	■■■■■ 4.38
STK40-208	ENST00000482458	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	42.36	■■■■■ 4.37
STK40-208	ENST00000482458	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		42.3	■■■■■ 4.36
STK40-208	ENST00000482458	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	42.3	■■■■■ 4.36
STK40-208	ENST00000482458	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		42.28	■■■■■ 4.36
STK40-208	ENST00000482458	AKNA	Q7Z591	1439 aa		42.27	■■■■■ 4.36
STK40-208	ENST00000482458	FANCA	O15360	1455 aa		42.24	■■■■■ 4.35
STK40-208	ENST00000482458	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	42.24	■■■■■ 4.35	2e-9	■■■□□ 19.1
STK40-208	ENST00000482458	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		42.24	■■■■■ 4.35
STK40-208	ENST00000482458	MADD	Q8WXG6	1647 aa		42.24	■■■■■ 4.35
STK40-208	ENST00000482458	RICTOR	Q6R327	1708 aa		42.2	■■■■■ 4.35
STK40-208	ENST00000482458	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		42.19	■■■■■ 4.34
STK40-208	ENST00000482458	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		42.17	■■■■■ 4.34
STK40-208	ENST00000482458	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	42.11	■■■■■ 4.33
STK40-208	ENST00000482458	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	42.1	■■■■■ 4.33
STK40-208	ENST00000482458	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		42.08	■■■■■ 4.33
STK40-208	ENST00000482458	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	42.06	■■■■■ 4.32
STK40-208	ENST00000482458	FBXO41	Q8TF61	875 aa		42.06	■■■■■ 4.32
STK40-208	ENST00000482458	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		42.05	■■■■■ 4.32
STK40-208	ENST00000482458	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		42.04	■■■■■ 4.32
STK40-208	ENST00000482458	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		42.03	■■■■■ 4.32
STK40-208	ENST00000482458	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		42.03	■■■■■ 4.32
STK40-208	ENST00000482458	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		42	■■■■■ 4.31
STK40-208	ENST00000482458	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		41.98	■■■■■ 4.31
STK40-208	ENST00000482458	PLCH2	O75038	1416 aa		41.98	■■■■■ 4.31
STK40-208	ENST00000482458	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	41.97	■■■■■ 4.31
STK40-208	ENST00000482458	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	41.97	■■■■■ 4.31
STK40-208	ENST00000482458	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		41.95	■■■■■ 4.31
STK40-208	ENST00000482458	HECW1	Q76N89	1606 aa		41.95	■■■■■ 4.31

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