RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481848.6

SOGA3-207, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P5 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 11,464 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-207ENST00000481848 TRIM52Q96A61 297 aa16.32■□□□□ 0.2
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SOGA3-207ENST00000481848 TONSLQ96HA7 1378 aa16.26■□□□□ 0.19
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SOGA3-207ENST00000481848 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
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SOGA3-207ENST00000481848 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
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SOGA3-207ENST00000481848 FGD1P98174 961 aa15.72■□□□□ 0.11
SOGA3-207ENST00000481848 NEFHP12036 1026 aa15.72■□□□□ 0.11
SOGA3-207ENST00000481848 TSPYL1Q9H0U9 437 aa15.71■□□□□ 0.11
SOGA3-207ENST00000481848 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.1
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SOGA3-207ENST00000481848 TPM3P06753 285 aa15.7■□□□□ 0.1
SOGA3-207ENST00000481848 CCDC191Q8NCU4 936 aa15.7■□□□□ 0.1
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SOGA3-207ENST00000481848 KIF16BQ96L93 1317 aa15.68■□□□□ 0.1
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SOGA3-207ENST00000481848 TPRNQ4KMQ1 711 aa15.62■□□□□ 0.09
SOGA3-207ENST00000481848 FAM13BQ9NYF5 915 aa15.61■□□□□ 0.09
SOGA3-207ENST00000481848 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SOGA3-207ENST00000481848 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.6■□□□□ 0.09
SOGA3-207ENST00000481848 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SOGA3-207ENST00000481848 HSP90B2PQ58FF3 399 aa15.59■□□□□ 0.09
SOGA3-207ENST00000481848 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa15.59■□□□□ 0.09
SOGA3-207ENST00000481848 INCENPQ9NQS7 918 aa15.58■□□□□ 0.09
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