RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480104.5

USP11-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 3

Gene USP11, Length 697 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-208ENST00000480104 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
USP11-208ENST00000480104 ADAMTS12P58397 1594 aa22.69■■□□□ 1.22
USP11-208ENST00000480104 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.68■■□□□ 1.22
USP11-208ENST00000480104 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
USP11-208ENST00000480104 TSPOAP1O95153 1857 aa22.67■■□□□ 1.22
USP11-208ENST00000480104 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.6■■□□□ 1.21
USP11-208ENST00000480104 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.58■■□□□ 1.2
USP11-208ENST00000480104 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.57■■□□□ 1.2
USP11-208ENST00000480104 JPH4Q96JJ6 628 aa22.55■■□□□ 1.2
USP11-208ENST00000480104 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
USP11-208ENST00000480104 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
USP11-208ENST00000480104 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.4■■□□□ 1.18
USP11-208ENST00000480104 SOCS7O14512 581 aa22.37■■□□□ 1.17
USP11-208ENST00000480104 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
USP11-208ENST00000480104 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.36■■□□□ 1.17
USP11-208ENST00000480104 ILDR2Q71H61 639 aa22.33■■□□□ 1.17
USP11-208ENST00000480104 GLI2P10070 1586 aa22.31■■□□□ 1.16
USP11-208ENST00000480104 TOP2BQ02880 1626 aa22.3■■□□□ 1.16
USP11-208ENST00000480104 ASXL2Q76L83 1435 aa22.28■■□□□ 1.16
USP11-208ENST00000480104 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.24■■□□□ 1.15
USP11-208ENST00000480104 ABCC2Q92887 1545 aa22.22■■□□□ 1.15
USP11-208ENST00000480104 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.21■■□□□ 1.15
USP11-208ENST00000480104 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.18■■□□□ 1.14
USP11-208ENST00000480104 PTPRGP23470 1445 aa22.17■■□□□ 1.14
USP11-208ENST00000480104 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.15■■□□□ 1.14
USP11-208ENST00000480104 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
USP11-208ENST00000480104 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
USP11-208ENST00000480104 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.13■■□□□ 1.13
USP11-208ENST00000480104 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.09■■□□□ 1.13
USP11-208ENST00000480104 CUL7Q14999 1698 aa22.07■■□□□ 1.12
USP11-208ENST00000480104 KIF21BO75037 1637 aa22.04■■□□□ 1.12
USP11-208ENST00000480104 PTPRMP28827 1452 aa22.03■■□□□ 1.12
USP11-208ENST00000480104 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.03■■□□□ 1.12
USP11-208ENST00000480104 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.02■■□□□ 1.12
USP11-208ENST00000480104 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
USP11-208ENST00000480104 CERKQ8TCT0 537 aa21.97■■□□□ 1.11
USP11-208ENST00000480104 UACAQ9BZF9 1416 aa21.97■■□□□ 1.11
USP11-208ENST00000480104 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.94■■□□□ 1.1
USP11-208ENST00000480104 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.94■■□□□ 1.1
USP11-208ENST00000480104 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.93■■□□□ 1.1
USP11-208ENST00000480104 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.91■■□□□ 1.1
USP11-208ENST00000480104 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
USP11-208ENST00000480104 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.87■■□□□ 1.09
USP11-208ENST00000480104 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.86■■□□□ 1.09
USP11-208ENST00000480104 CD109Q6YHK3 1445 aa21.84■■□□□ 1.09
USP11-208ENST00000480104 HSPA2P54652 639 aa21.84■■□□□ 1.09
USP11-208ENST00000480104 IGF1RP08069 1367 aa21.81■■□□□ 1.08
USP11-208ENST00000480104 MADDQ8WXG6 1647 aa21.79■■□□□ 1.08
USP11-208ENST00000480104 DISP1Q96F81 1524 aa21.77■■□□□ 1.08
USP11-208ENST00000480104 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.75■■□□□ 1.07
USP11-208ENST00000480104 IQGAP2Q13576 1575 aa21.74■■□□□ 1.07
USP11-208ENST00000480104 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.73■■□□□ 1.07
USP11-208ENST00000480104 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.73■■□□□ 1.07
USP11-208ENST00000480104 KCNH8Q96L42 1107 aa21.7■■□□□ 1.06
USP11-208ENST00000480104 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
USP11-208ENST00000480104 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
USP11-208ENST00000480104 KIF27Q86VH2 1401 aa21.64■■□□□ 1.06
USP11-208ENST00000480104 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.63■■□□□ 1.05
USP11-208ENST00000480104 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.61■■□□□ 1.05
USP11-208ENST00000480104 RAPGEF3O95398 923 aa21.6■■□□□ 1.05
USP11-208ENST00000480104 KIAA0556O60303 1618 aa21.58■■□□□ 1.04
USP11-208ENST00000480104 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.57■■□□□ 1.04
USP11-208ENST00000480104 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.52■■□□□ 1.04
USP11-208ENST00000480104 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.52■■□□□ 1.04
USP11-208ENST00000480104 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.49■■□□□ 1.03
USP11-208ENST00000480104 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.46■■□□□ 1.03
USP11-208ENST00000480104 ABCA8O94911 1581 aa21.45■■□□□ 1.02
USP11-208ENST00000480104 NEO1Q92859 1461 aa21.43■■□□□ 1.02
USP11-208ENST00000480104 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.41■■□□□ 1.02
USP11-208ENST00000480104 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.4■■□□□ 1.02
USP11-208ENST00000480104 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.39■■□□□ 1.02
USP11-208ENST00000480104 STRCQ7RTU9 1775 aa21.38■■□□□ 1.01
USP11-208ENST00000480104 FANCAO15360 1455 aa21.38■■□□□ 1.01
USP11-208ENST00000480104 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
USP11-208ENST00000480104 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.36■■□□□ 1.01
USP11-208ENST00000480104 ARID3CA6NKF2 412 aa21.35■■□□□ 1.01
USP11-208ENST00000480104 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.34■■□□□ 1.01
USP11-208ENST00000480104 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.33■■□□□ 1.01
USP11-208ENST00000480104 AKNAQ7Z591 1439 aa21.32■■□□□ 1
USP11-208ENST00000480104 MLECQ14165 292 aa21.32■■□□□ 1
USP11-208ENST00000480104 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.32■■□□□ 1
USP11-208ENST00000480104 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.32■■□□□ 1
USP11-208ENST00000480104 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.31■■□□□ 1
USP11-208ENST00000480104 PTPRTO14522 1441 aa21.29■■□□□ 1
USP11-208ENST00000480104 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
USP11-208ENST00000480104 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.28■■□□□ 1
USP11-208ENST00000480104 ATP10BO94823 1461 aa21.27■■□□□ 1
USP11-208ENST00000480104 GOLGA3Q08378 1498 aa21.27■■□□□ 1
USP11-208ENST00000480104 RICTORQ6R327 1708 aa21.26■□□□□ 0.99
USP11-208ENST00000480104 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.25■□□□□ 0.99
USP11-208ENST00000480104 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.24■□□□□ 0.99
USP11-208ENST00000480104 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.23■□□□□ 0.99
USP11-208ENST00000480104 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
USP11-208ENST00000480104 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.21■□□□□ 0.99
USP11-208ENST00000480104 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
USP11-208ENST00000480104 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.2■□□□□ 0.98
USP11-208ENST00000480104 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.2■□□□□ 0.98
USP11-208ENST00000480104 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.18■□□□□ 0.98
USP11-208ENST00000480104 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.13■□□□□ 0.97
USP11-208ENST00000480104 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.12■□□□□ 0.97
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