RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 SLC24A1O60721 1099 aa18.69■□□□□ 0.58
NISCH-207ENST00000479054 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
NISCH-207ENST00000479054 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.63■□□□□ 0.572e-6■□□□□ 9.1
NISCH-207ENST00000479054 VPS8Q8N3P4 1428 aa18.63■□□□□ 0.57
NISCH-207ENST00000479054 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.63■□□□□ 0.57
NISCH-207ENST00000479054 KCNH8Q96L42 1107 aa18.61■□□□□ 0.57
NISCH-207ENST00000479054 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.61■□□□□ 0.57
NISCH-207ENST00000479054 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.6■□□□□ 0.57
NISCH-207ENST00000479054 CADPSQ9ULU8 1353 aa18.59■□□□□ 0.57
NISCH-207ENST00000479054 CANXP27824 592 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
NISCH-207ENST00000479054 CCNB3Q8WWL7 1395 aa18.55■□□□□ 0.56
NISCH-207ENST00000479054 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
NISCH-207ENST00000479054 MIER1Q8N108 512 aa18.53■□□□□ 0.56
NISCH-207ENST00000479054 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
NISCH-207ENST00000479054 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
NISCH-207ENST00000479054 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
NISCH-207ENST00000479054 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
NISCH-207ENST00000479054 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa18.48■□□□□ 0.55
NISCH-207ENST00000479054 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
NISCH-207ENST00000479054 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
NISCH-207ENST00000479054 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa18.45■□□□□ 0.54
NISCH-207ENST00000479054 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18.43■□□□□ 0.54
NISCH-207ENST00000479054 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.43■□□□□ 0.54
NISCH-207ENST00000479054 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18.42■□□□□ 0.54
NISCH-207ENST00000479054 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
NISCH-207ENST00000479054 C14orf37Q86TY3 774 aa18.39■□□□□ 0.54
NISCH-207ENST00000479054 SIN3AQ96ST3 1273 aa18.39■□□□□ 0.53
NISCH-207ENST00000479054 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-207ENST00000479054 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.37■□□□□ 0.53
NISCH-207ENST00000479054 NCAPD3P42695 1498 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-207ENST00000479054 FMN1Q68DA7 1419 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-207ENST00000479054 FKBP8Q14318 412 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-207ENST00000479054 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-207ENST00000479054 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.32■□□□□ 0.52
NISCH-207ENST00000479054 SETD5Q9C0A6 1442 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-207ENST00000479054 TMC1Q8TDI8 760 aa18.3■□□□□ 0.52
NISCH-207ENST00000479054 MRS2Q9HD23 443 aa18.3■□□□□ 0.52
NISCH-207ENST00000479054 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
NISCH-207ENST00000479054 HDGFP51858 240 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
NISCH-207ENST00000479054 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
NISCH-207ENST00000479054 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.27■□□□□ 0.52
NISCH-207ENST00000479054 CDCA8Q53HL2 280 aa18.26■□□□□ 0.51
NISCH-207ENST00000479054 KANK1Q14678 1352 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-207ENST00000479054 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-207ENST00000479054 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
NISCH-207ENST00000479054 RGL3Q3MIN7 710 aa18.24■□□□□ 0.51
NISCH-207ENST00000479054 ANP32EQ9BTT0 268 aa18.22■□□□□ 0.51
NISCH-207ENST00000479054 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP18.21■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 54.5
NISCH-207ENST00000479054 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-207ENST00000479054 IGF1RP08069 1367 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-207ENST00000479054 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
NISCH-207ENST00000479054 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.18■□□□□ 0.5
NISCH-207ENST00000479054 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
NISCH-207ENST00000479054 CARD11Q9BXL7 1154 aa18.15■□□□□ 0.5
NISCH-207ENST00000479054 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
NISCH-207ENST00000479054 BCL11AQ9H165 835 aa18.13■□□□□ 0.49
NISCH-207ENST00000479054 A0A0G2JS52 829 aa18.12■□□□□ 0.49
NISCH-207ENST00000479054 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa18.12■□□□□ 0.49
NISCH-207ENST00000479054 CFTRP13569 1480 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-207ENST00000479054 ZBTB7CA1YPR0 619 aa18.1■□□□□ 0.49
NISCH-207ENST00000479054 CFAP53Q96M91 514 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-207ENST00000479054 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.09■□□□□ 0.49
NISCH-207ENST00000479054 POGKQ9P215 609 aa18.08■□□□□ 0.49
NISCH-207ENST00000479054 SYNJ1O43426 1573 aa18.08■□□□□ 0.49
NISCH-207ENST00000479054 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa18.08■□□□□ 0.48
NISCH-207ENST00000479054 JPH4Q96JJ6 628 aa18.06■□□□□ 0.48
NISCH-207ENST00000479054 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.05■□□□□ 0.48
NISCH-207ENST00000479054 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.05■□□□□ 0.48
NISCH-207ENST00000479054 FOXD1Q16676 465 aa18.03■□□□□ 0.48
NISCH-207ENST00000479054 HMGXB3Q12766 1538 aa18.03■□□□□ 0.48
NISCH-207ENST00000479054 PKD2Q13563 968 aa18.03■□□□□ 0.48
NISCH-207ENST00000479054 DCAF11Q8TEB1 546 aa18.02■□□□□ 0.48
NISCH-207ENST00000479054 KIF21BO75037 1637 aa18.02■□□□□ 0.48
NISCH-207ENST00000479054 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.02■□□□□ 0.48
NISCH-207ENST00000479054 MLECQ14165 292 aa18.01■□□□□ 0.47
NISCH-207ENST00000479054 NBR1Q14596 966 aa18.01■□□□□ 0.47
NISCH-207ENST00000479054 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.01■□□□□ 0.47
NISCH-207ENST00000479054 CCDC136Q96JN2 1154 aa18.01■□□□□ 0.47
NISCH-207ENST00000479054 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
NISCH-207ENST00000479054 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
NISCH-207ENST00000479054 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa17.98■□□□□ 0.47
NISCH-207ENST00000479054 KNSTRNQ9Y448 316 aa17.98■□□□□ 0.47
NISCH-207ENST00000479054 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
NISCH-207ENST00000479054 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.97■□□□□ 0.47
NISCH-207ENST00000479054 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
NISCH-207ENST00000479054 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
NISCH-207ENST00000479054 MYH16Q9H6N6 1097 aa17.96■□□□□ 0.47
NISCH-207ENST00000479054 OSCARQ8IYS5 282 aa17.96■□□□□ 0.47
NISCH-207ENST00000479054 TOP2BQ02880 1626 aa17.95■□□□□ 0.46
NISCH-207ENST00000479054 RSPH4AQ5TD94 716 aa17.95■□□□□ 0.46
NISCH-207ENST00000479054 PLEKHG5O94827 1062 aa17.94■□□□□ 0.46
NISCH-207ENST00000479054 NUP155O75694 1391 aa17.94■□□□□ 0.46
NISCH-207ENST00000479054 LMOD2Q6P5Q4 547 aa17.94■□□□□ 0.46
NISCH-207ENST00000479054 NUDCQ9Y266 331 aa17.93■□□□□ 0.46
NISCH-207ENST00000479054 GGT6Q6P531 493 aa17.92■□□□□ 0.46
NISCH-207ENST00000479054 CCER2I3L3R5 266 aa17.92■□□□□ 0.46
NISCH-207ENST00000479054 PRXQ9BXM0 1461 aa17.91■□□□□ 0.46
NISCH-207ENST00000479054 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.91■□□□□ 0.46
NISCH-207ENST00000479054 CUX1P39880 1505 aa17.91■□□□□ 0.46
NISCH-207ENST00000479054 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP17.9■□□□□ 0.463e-7■■■□□ 19.2
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