RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478849.1

OPN3-205, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 3

Gene OPN3, Length 880 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-205ENST00000478849 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.18■■■■■ 4.5
OPN3-205ENST00000478849 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.03■■■■■ 4.48
OPN3-205ENST00000478849 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.01■■■■■ 4.48
OPN3-205ENST00000478849 IGF1RP08069 1367 aa43.01■■■■■ 4.48
OPN3-205ENST00000478849 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.98■■■■■ 4.47
OPN3-205ENST00000478849 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.96■■■■■ 4.47
OPN3-205ENST00000478849 KIF27Q86VH2 1401 aa42.93■■■■■ 4.46
OPN3-205ENST00000478849 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.92■■■■■ 4.46
OPN3-205ENST00000478849 MAPKBP1O60336 1514 aa42.92■■■■■ 4.46
OPN3-205ENST00000478849 CUL7Q14999 1698 aa42.85■■■■■ 4.45
OPN3-205ENST00000478849 DIP2BQ9P265 1576 aa42.83■■■■■ 4.45
OPN3-205ENST00000478849 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.7■■■■■ 4.43
OPN3-205ENST00000478849 PTPRGP23470 1445 aa42.68■■■■■ 4.42
OPN3-205ENST00000478849 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.66■■■■■ 4.42
OPN3-205ENST00000478849 KDM6BO15054 1643 aa42.57■■■■■ 4.4
OPN3-205ENST00000478849 TSPOAP1O95153 1857 aa42.56■■■■■ 4.4
OPN3-205ENST00000478849 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.54■■■■■ 4.4
OPN3-205ENST00000478849 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.54■■■■■ 4.4
OPN3-205ENST00000478849 ABCC2Q92887 1545 aa42.47■■■■■ 4.39
OPN3-205ENST00000478849 IQGAP2Q13576 1575 aa42.46■■■■■ 4.39
OPN3-205ENST00000478849 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa42.41■■■■■ 4.38
OPN3-205ENST00000478849 ASXL2Q76L83 1435 aa42.38■■■■■ 4.38
OPN3-205ENST00000478849 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.34■■■■■ 4.37
OPN3-205ENST00000478849 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.33■■■■■ 4.37
OPN3-205ENST00000478849 DISP1Q96F81 1524 aa42.33■■■■■ 4.37
OPN3-205ENST00000478849 UACAQ9BZF9 1416 aa42.32■■■■■ 4.37
OPN3-205ENST00000478849 GLI2P10070 1586 aa42.27■■■■■ 4.36
OPN3-205ENST00000478849 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.23■■■■■ 4.35
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OPN3-205ENST00000478849 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.15■■■■■ 4.34
OPN3-205ENST00000478849 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
OPN3-205ENST00000478849 KIAA0556O60303 1618 aa42.09■■■■■ 4.33
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OPN3-205ENST00000478849 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
OPN3-205ENST00000478849 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.02■■■■■ 4.32
OPN3-205ENST00000478849 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.94■■■■■ 4.3
OPN3-205ENST00000478849 ADGRL1O94910 1474 aa41.92■■■■■ 4.3
OPN3-205ENST00000478849 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.88■■■■■ 4.29
OPN3-205ENST00000478849 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.85■■■■■ 4.29
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OPN3-205ENST00000478849 KCNH8Q96L42 1107 aa41.74■■■■■ 4.27
OPN3-205ENST00000478849 ABCA8O94911 1581 aa41.74■■■■■ 4.27
OPN3-205ENST00000478849 PRXQ9BXM0 1461 aa41.71■■■■■ 4.27
OPN3-205ENST00000478849 CD109Q6YHK3 1445 aa41.7■■■■■ 4.27
OPN3-205ENST00000478849 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.65■■■■■ 4.26
OPN3-205ENST00000478849 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.61■■■■■ 4.25
OPN3-205ENST00000478849 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
OPN3-205ENST00000478849 ARID3CA6NKF2 412 aa41.53■■■■■ 4.24
OPN3-205ENST00000478849 P3H3Q8IVL6 736 aa41.53■■■■■ 4.24
OPN3-205ENST00000478849 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.46■■■■■ 4.23
OPN3-205ENST00000478849 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
OPN3-205ENST00000478849 ATP10BO94823 1461 aa41.43■■■■■ 4.22
OPN3-205ENST00000478849 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.34■■■■■ 4.21
OPN3-205ENST00000478849 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.32■■■■■ 4.21
OPN3-205ENST00000478849 KIF21BO75037 1637 aa41.31■■■■■ 4.2
OPN3-205ENST00000478849 SAMD9Q5K651 1589 aa41.26■■■■■ 4.2
OPN3-205ENST00000478849 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.25■■■■■ 4.19
OPN3-205ENST00000478849 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.2■■■■■ 4.19
OPN3-205ENST00000478849 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.2■■■■■ 4.19
OPN3-205ENST00000478849 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
OPN3-205ENST00000478849 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.2■■■■■ 4.19
OPN3-205ENST00000478849 RAPGEF3O95398 923 aa41.16■■■■■ 4.18
OPN3-205ENST00000478849 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
OPN3-205ENST00000478849 NEO1Q92859 1461 aa41.09■■■■■ 4.17
OPN3-205ENST00000478849 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
OPN3-205ENST00000478849 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.04■■■■■ 4.16
OPN3-205ENST00000478849 ADAMTSL3P82987 1691 aa41■■■■■ 4.15
OPN3-205ENST00000478849 PTPRMP28827 1452 aa40.99■■■■■ 4.15
OPN3-205ENST00000478849 EEA1Q15075 1411 aa40.99■■■■■ 4.15
OPN3-205ENST00000478849 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.97■■■■■ 4.15
OPN3-205ENST00000478849 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.94■■■■■ 4.14
OPN3-205ENST00000478849 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
OPN3-205ENST00000478849 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.86■■■■■ 4.13
OPN3-205ENST00000478849 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
OPN3-205ENST00000478849 AKNAQ7Z591 1439 aa40.82■■■■■ 4.12
OPN3-205ENST00000478849 MADDQ8WXG6 1647 aa40.81■■■■■ 4.12
OPN3-205ENST00000478849 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.78■■■■■ 4.122e-7■■□□□ 11.4
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OPN3-205ENST00000478849 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.77■■■■■ 4.12
OPN3-205ENST00000478849 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.76■■■■■ 4.12
OPN3-205ENST00000478849 RICTORQ6R327 1708 aa40.75■■■■■ 4.11
OPN3-205ENST00000478849 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.71■■■■■ 4.11
OPN3-205ENST00000478849 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.69■■■■■ 4.11
OPN3-205ENST00000478849 FBXO41Q8TF61 875 aa40.67■■■■■ 4.1
OPN3-205ENST00000478849 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
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OPN3-205ENST00000478849 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.57■■■■■ 4.09
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OPN3-205ENST00000478849 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.57■■■■■ 4.08
OPN3-205ENST00000478849 PLCH2O75038 1416 aa40.53■■■■■ 4.08
OPN3-205ENST00000478849 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
OPN3-205ENST00000478849 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.53■■■■■ 4.08
OPN3-205ENST00000478849 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.52■■■■■ 4.08
OPN3-205ENST00000478849 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.51■■■■■ 4.08
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