RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475170.5

ITGB2-209, Transcript of integrin subunit beta 2, humanhuman

TSL 2

Gene ITGB2, Length 2,125 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2-209ENST00000475170 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
ITGB2-209ENST00000475170 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
ITGB2-209ENST00000475170 GRIN2AQ12879 1464 aa26.17■■□□□ 1.78
ITGB2-209ENST00000475170 SYNJ2O15056 1496 aa26.17■■□□□ 1.78
ITGB2-209ENST00000475170 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
ITGB2-209ENST00000475170 P3H3Q8IVL6 736 aa26.1■■□□□ 1.77
ITGB2-209ENST00000475170 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.1■■□□□ 1.77
ITGB2-209ENST00000475170 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.09■■□□□ 1.77
ITGB2-209ENST00000475170 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.76
ITGB2-209ENST00000475170 FBLN2P98095 1184 aa26.06■■□□□ 1.76
ITGB2-209ENST00000475170 IQGAP2Q13576 1575 aa26.06■■□□□ 1.76
ITGB2-209ENST00000475170 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.05■■□□□ 1.76
ITGB2-209ENST00000475170 SAMD9Q5K651 1589 aa26.04■■□□□ 1.76
ITGB2-209ENST00000475170 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.04■■□□□ 1.76
ITGB2-209ENST00000475170 CEP170Q5SW79 1584 aa26.02■■□□□ 1.76
ITGB2-209ENST00000475170 NUP160Q12769 1436 aa26■■□□□ 1.75
ITGB2-209ENST00000475170 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
ITGB2-209ENST00000475170 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.95■■□□□ 1.75
ITGB2-209ENST00000475170 APLP2Q06481 763 aa25.93■■□□□ 1.74
ITGB2-209ENST00000475170 CHD1O14646 1710 aa25.89■■□□□ 1.73
ITGB2-209ENST00000475170 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
ITGB2-209ENST00000475170 DISP1Q96F81 1524 aa25.87■■□□□ 1.73
ITGB2-209ENST00000475170 FMN1Q68DA7 1419 aa25.87■■□□□ 1.73
ITGB2-209ENST00000475170 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
ITGB2-209ENST00000475170 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.84■■□□□ 1.73
ITGB2-209ENST00000475170 JPH4Q96JJ6 628 aa25.82■■□□□ 1.72
ITGB2-209ENST00000475170 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.81■■□□□ 1.72
ITGB2-209ENST00000475170 KIAA0556O60303 1618 aa25.81■■□□□ 1.72
ITGB2-209ENST00000475170 MAP3K1Q13233 1512 aa25.79■■□□□ 1.72
ITGB2-209ENST00000475170 TIAM1Q13009 1591 aa25.77■■□□□ 1.72
ITGB2-209ENST00000475170 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
ITGB2-209ENST00000475170 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.69■■□□□ 1.7
ITGB2-209ENST00000475170 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.68■■□□□ 1.7
ITGB2-209ENST00000475170 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.68■■□□□ 1.7
ITGB2-209ENST00000475170 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.67■■□□□ 1.7
ITGB2-209ENST00000475170 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
ITGB2-209ENST00000475170 SHROOM2Q13796 1616 aa25.62■■□□□ 1.69
ITGB2-209ENST00000475170 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.61■■□□□ 1.69
ITGB2-209ENST00000475170 HECW1Q76N89 1606 aa25.58■■□□□ 1.69
ITGB2-209ENST00000475170 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
ITGB2-209ENST00000475170 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.54■■□□□ 1.68
ITGB2-209ENST00000475170 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.53■■□□□ 1.68
ITGB2-209ENST00000475170 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
ITGB2-209ENST00000475170 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.53■■□□□ 1.68
ITGB2-209ENST00000475170 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.52■■□□□ 1.68
ITGB2-209ENST00000475170 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
ITGB2-209ENST00000475170 ARID3CA6NKF2 412 aa25.5■■□□□ 1.67
ITGB2-209ENST00000475170 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.49■■□□□ 1.67
ITGB2-209ENST00000475170 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.49■■□□□ 1.67
ITGB2-209ENST00000475170 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
ITGB2-209ENST00000475170 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.48■■□□□ 1.67
ITGB2-209ENST00000475170 PTPRGP23470 1445 aa25.46■■□□□ 1.67
ITGB2-209ENST00000475170 ABCA8O94911 1581 aa25.46■■□□□ 1.67
ITGB2-209ENST00000475170 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.41■■□□□ 1.66
ITGB2-209ENST00000475170 OSCARQ8IYS5 282 aa25.4■■□□□ 1.66
ITGB2-209ENST00000475170 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.4■■□□□ 1.66
ITGB2-209ENST00000475170 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
ITGB2-209ENST00000475170 NCOA2Q15596 1464 aa25.36■■□□□ 1.65
ITGB2-209ENST00000475170 ARHGEF11O15085 1522 aa25.34■■□□□ 1.65
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ITGB2-209ENST00000475170 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.64
ITGB2-209ENST00000475170 ATP10BO94823 1461 aa25.33■■□□□ 1.64
ITGB2-209ENST00000475170 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
ITGB2-209ENST00000475170 UACAQ9BZF9 1416 aa25.32■■□□□ 1.64
ITGB2-209ENST00000475170 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
ITGB2-209ENST00000475170 HRCP23327 699 aa25.27■■□□□ 1.64
ITGB2-209ENST00000475170 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.26■■□□□ 1.63
ITGB2-209ENST00000475170 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.25■■□□□ 1.63
ITGB2-209ENST00000475170 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
ITGB2-209ENST00000475170 ABCC2Q92887 1545 aa25.22■■□□□ 1.63
ITGB2-209ENST00000475170 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
ITGB2-209ENST00000475170 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
ITGB2-209ENST00000475170 ITGAEP38570 1179 aa25.18■■□□□ 1.62
ITGB2-209ENST00000475170 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.17■■□□□ 1.62
ITGB2-209ENST00000475170 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.16■■□□□ 1.62
ITGB2-209ENST00000475170 KIF14Q15058 1648 aa25.15■■□□□ 1.62
ITGB2-209ENST00000475170 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.13■■□□□ 1.61
ITGB2-209ENST00000475170 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.11■■□□□ 1.61
ITGB2-209ENST00000475170 MIA2Q96PC5 1412 aa25.1■■□□□ 1.61
ITGB2-209ENST00000475170 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.09■■□□□ 1.61
ITGB2-209ENST00000475170 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
ITGB2-209ENST00000475170 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.06■■□□□ 1.6
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ITGB2-209ENST00000475170 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
ITGB2-209ENST00000475170 PTPRKQ15262 1439 aa25.05■■□□□ 1.6
ITGB2-209ENST00000475170 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
ITGB2-209ENST00000475170 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
ITGB2-209ENST00000475170 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
ITGB2-209ENST00000475170 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.96■■□□□ 1.59
ITGB2-209ENST00000475170 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.96■■□□□ 1.59
ITGB2-209ENST00000475170 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.93■■□□□ 1.58
ITGB2-209ENST00000475170 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.93■■□□□ 1.58
ITGB2-209ENST00000475170 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
ITGB2-209ENST00000475170 KCNH8Q96L42 1107 aa24.91■■□□□ 1.58
ITGB2-209ENST00000475170 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
ITGB2-209ENST00000475170 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.9■■□□□ 1.58
ITGB2-209ENST00000475170 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.9■■□□□ 1.58
ITGB2-209ENST00000475170 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
ITGB2-209ENST00000475170 ABCC5O15440 1437 aa24.87■■□□□ 1.57
ITGB2-209ENST00000475170 HFM1A2PYH4 1435 aa24.86■■□□□ 1.57
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