RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473312.5

AGAP3-211, Transcript of ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AGAP3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3-211ENST00000473312 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
AGAP3-211ENST00000473312 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
AGAP3-211ENST00000473312 TIAM1Q13009 1591 aa40.7■■■■■ 4.11
AGAP3-211ENST00000473312 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.64■■■■■ 4.1
AGAP3-211ENST00000473312 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.55■■■■■ 4.084e-7■■■■■ 26.9
AGAP3-211ENST00000473312 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
AGAP3-211ENST00000473312 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.53■■■■■ 4.08
AGAP3-211ENST00000473312 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.51■■■■■ 4.08
AGAP3-211ENST00000473312 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.5■■■■■ 4.07
AGAP3-211ENST00000473312 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.5■■■■■ 4.07
AGAP3-211ENST00000473312 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.49■■■■■ 4.07
AGAP3-211ENST00000473312 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.46■■■■■ 4.07
AGAP3-211ENST00000473312 SAMD9Q5K651 1589 aa40.42■■■■■ 4.06
AGAP3-211ENST00000473312 PBRM1Q86U86 1689 aa40.42■■■■■ 4.06
AGAP3-211ENST00000473312 P3H3Q8IVL6 736 aa40.41■■■■■ 4.06
AGAP3-211ENST00000473312 FMN1Q68DA7 1419 aa40.4■■■■■ 4.06
AGAP3-211ENST00000473312 WDR62O43379 1518 aa40.38■■■■■ 4.05
AGAP3-211ENST00000473312 IFT140Q96RY7 1462 aa40.32■■■■■ 4.05
AGAP3-211ENST00000473312 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.31■■■■■ 4.04
AGAP3-211ENST00000473312 ADAMTS12P58397 1594 aa40.29■■■■■ 4.04
AGAP3-211ENST00000473312 GRIN2BQ13224 1484 aa40.28■■■■■ 4.04
AGAP3-211ENST00000473312 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.27■■■■■ 4.04
AGAP3-211ENST00000473312 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.21■■■■■ 4.03
AGAP3-211ENST00000473312 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
AGAP3-211ENST00000473312 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
AGAP3-211ENST00000473312 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
AGAP3-211ENST00000473312 IQGAP2Q13576 1575 aa40.09■■■■■ 4.01
AGAP3-211ENST00000473312 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
AGAP3-211ENST00000473312 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.06■■■■■ 46e-8■■■□□ 14.6
AGAP3-211ENST00000473312 ERCC6Q03468 1493 aa40.02■■■■■ 4
AGAP3-211ENST00000473312 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP40.01■■■■□ 3.99
AGAP3-211ENST00000473312 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.97■■■■□ 3.99
AGAP3-211ENST00000473312 UGGT2Q9NYU1 1516 aa39.94■■■■□ 3.98
AGAP3-211ENST00000473312 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
AGAP3-211ENST00000473312 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
AGAP3-211ENST00000473312 ITGAEP38570 1179 aa39.93■■■■□ 3.98
AGAP3-211ENST00000473312 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.92■■■■□ 3.98
AGAP3-211ENST00000473312 SETD5Q9C0A6 1442 aa39.9■■■■□ 3.98
AGAP3-211ENST00000473312 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa39.9■■■■□ 3.98
AGAP3-211ENST00000473312 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.89■■■■□ 3.98
AGAP3-211ENST00000473312 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
AGAP3-211ENST00000473312 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.87■■■■□ 3.97
AGAP3-211ENST00000473312 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.85■■■■□ 3.97
AGAP3-211ENST00000473312 FGD6Q6ZV73 1430 aa39.85■■■■□ 3.97
AGAP3-211ENST00000473312 HECW1Q76N89 1606 aa39.84■■■■□ 3.97
AGAP3-211ENST00000473312 GRIN2AQ12879 1464 aa39.8■■■■□ 3.96
AGAP3-211ENST00000473312 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
AGAP3-211ENST00000473312 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
AGAP3-211ENST00000473312 NCOA2Q15596 1464 aa39.77■■■■□ 3.96
AGAP3-211ENST00000473312 ARHGEF11O15085 1522 aa39.72■■■■□ 3.95
AGAP3-211ENST00000473312 MYOM3Q5VTT5 1437 aa39.72■■■■□ 3.95
AGAP3-211ENST00000473312 KIAA0556O60303 1618 aa39.68■■■■□ 3.94
AGAP3-211ENST00000473312 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
AGAP3-211ENST00000473312 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.66■■■■□ 3.94
AGAP3-211ENST00000473312 MAPKBP1O60336 1514 aa39.65■■■■□ 3.94
AGAP3-211ENST00000473312 DISP1Q96F81 1524 aa39.65■■■■□ 3.94
AGAP3-211ENST00000473312 SYNJ2O15056 1496 aa39.65■■■■□ 3.94
AGAP3-211ENST00000473312 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.52■■■■□ 3.92
AGAP3-211ENST00000473312 CEP170Q5SW79 1584 aa39.51■■■■□ 3.92
AGAP3-211ENST00000473312 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
AGAP3-211ENST00000473312 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
AGAP3-211ENST00000473312 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
AGAP3-211ENST00000473312 HFM1A2PYH4 1435 aa39.48■■■■□ 3.91
AGAP3-211ENST00000473312 NUP160Q12769 1436 aa39.46■■■■□ 3.91
AGAP3-211ENST00000473312 PTPRKQ15262 1439 aa39.46■■■■□ 3.91
AGAP3-211ENST00000473312 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.43■■■■□ 3.9
AGAP3-211ENST00000473312 MIA2Q96PC5 1412 aa39.41■■■■□ 3.9
AGAP3-211ENST00000473312 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.9
AGAP3-211ENST00000473312 NAIPQ13075 1403 aa39.32■■■■□ 3.89
AGAP3-211ENST00000473312 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa39.31■■■■□ 3.88
AGAP3-211ENST00000473312 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.29■■■■□ 3.88
AGAP3-211ENST00000473312 UACAQ9BZF9 1416 aa39.27■■■■□ 3.88
AGAP3-211ENST00000473312 AKNAQ7Z591 1439 aa39.27■■■■□ 3.88
AGAP3-211ENST00000473312 FBLN2P98095 1184 aa39.23■■■■□ 3.87
AGAP3-211ENST00000473312 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.23■■■■□ 3.87
AGAP3-211ENST00000473312 JPH4Q96JJ6 628 aa39.22■■■■□ 3.87
AGAP3-211ENST00000473312 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.18■■■■□ 3.86
AGAP3-211ENST00000473312 ARID3CA6NKF2 412 aa39.15■■■■□ 3.86
AGAP3-211ENST00000473312 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.14■■■■□ 3.86
AGAP3-211ENST00000473312 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.12■■■■□ 3.85
AGAP3-211ENST00000473312 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.12■■■■□ 3.85
AGAP3-211ENST00000473312 MIER1Q8N108 512 aa39.12■■■■□ 3.85
AGAP3-211ENST00000473312 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP39.08■■■■□ 3.85
AGAP3-211ENST00000473312 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP39.06■■■■□ 3.84
AGAP3-211ENST00000473312 NEUROD1Q13562 356 aa39.06■■■■□ 3.84
AGAP3-211ENST00000473312 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.05■■■■□ 3.84
AGAP3-211ENST00000473312 ABCA8O94911 1581 aa39.03■■■■□ 3.84
AGAP3-211ENST00000473312 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.01■■■■□ 3.84
AGAP3-211ENST00000473312 ROCK1Q13464 1354 aa39.01■■■■□ 3.83
AGAP3-211ENST00000473312 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39■■■■□ 3.83
AGAP3-211ENST00000473312 DAPK1P53355 1430 aa38.99■■■■□ 3.83
AGAP3-211ENST00000473312 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa38.97■■■■□ 3.83
AGAP3-211ENST00000473312 ITSN2Q9NZM3 1697 aa38.96■■■■□ 3.83
AGAP3-211ENST00000473312 CHIC2Q9UKJ5 165 aa38.95■■■■□ 3.83
AGAP3-211ENST00000473312 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP38.94■■■■□ 3.82
AGAP3-211ENST00000473312 ABCC5O15440 1437 aa38.92■■■■□ 3.82
AGAP3-211ENST00000473312 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP38.92■■■■□ 3.82
AGAP3-211ENST00000473312 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP38.87■■■■□ 3.81
AGAP3-211ENST00000473312 KDM6BO15054 1643 aa38.86■■■■□ 3.81
AGAP3-211ENST00000473312 TONSLQ96HA7 1378 aa38.86■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.6 ms