RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472108.1

USP20-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 1,811 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-204ENST00000472108 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
USP20-204ENST00000472108 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
USP20-204ENST00000472108 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.52■■□□□ 1.68
USP20-204ENST00000472108 SYNJ2O15056 1496 aa25.52■■□□□ 1.68
USP20-204ENST00000472108 GRIN2AQ12879 1464 aa25.51■■□□□ 1.68
USP20-204ENST00000472108 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
USP20-204ENST00000472108 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.51■■□□□ 1.67
USP20-204ENST00000472108 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
USP20-204ENST00000472108 APLP2Q06481 763 aa25.44■■□□□ 1.66
USP20-204ENST00000472108 IQGAP2Q13576 1575 aa25.43■■□□□ 1.66
USP20-204ENST00000472108 P3H3Q8IVL6 736 aa25.42■■□□□ 1.66
USP20-204ENST00000472108 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.42■■□□□ 1.66
USP20-204ENST00000472108 FBLN2P98095 1184 aa25.41■■□□□ 1.66
USP20-204ENST00000472108 SAMD9Q5K651 1589 aa25.4■■□□□ 1.66
USP20-204ENST00000472108 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.39■■□□□ 1.66
USP20-204ENST00000472108 NUP160Q12769 1436 aa25.35■■□□□ 1.65
USP20-204ENST00000472108 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.33■■□□□ 1.65
USP20-204ENST00000472108 CEP170Q5SW79 1584 aa25.33■■□□□ 1.65
USP20-204ENST00000472108 FMN1Q68DA7 1419 aa25.31■■□□□ 1.64
USP20-204ENST00000472108 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
USP20-204ENST00000472108 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.25■■□□□ 1.63
USP20-204ENST00000472108 MAP3K1Q13233 1512 aa25.24■■□□□ 1.63
USP20-204ENST00000472108 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.23■■□□□ 1.63
USP20-204ENST00000472108 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
USP20-204ENST00000472108 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
USP20-204ENST00000472108 DISP1Q96F81 1524 aa25.2■■□□□ 1.63
USP20-204ENST00000472108 CHD1O14646 1710 aa25.19■■□□□ 1.62
USP20-204ENST00000472108 JPH4Q96JJ6 628 aa25.19■■□□□ 1.62
USP20-204ENST00000472108 TIAM1Q13009 1591 aa25.17■■□□□ 1.62
USP20-204ENST00000472108 KIAA0556O60303 1618 aa25.17■■□□□ 1.62
USP20-204ENST00000472108 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
USP20-204ENST00000472108 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.1■■□□□ 1.61
USP20-204ENST00000472108 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.09■■□□□ 1.61
USP20-204ENST00000472108 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.08■■□□□ 1.61
USP20-204ENST00000472108 HRCP23327 699 aa25.05■■□□□ 1.6
USP20-204ENST00000472108 HECW1Q76N89 1606 aa25■■□□□ 1.59
USP20-204ENST00000472108 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
USP20-204ENST00000472108 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.99■■□□□ 1.59
USP20-204ENST00000472108 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.98■■□□□ 1.59
USP20-204ENST00000472108 SHROOM2Q13796 1616 aa24.97■■□□□ 1.59
USP20-204ENST00000472108 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
USP20-204ENST00000472108 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.94■■□□□ 1.58
USP20-204ENST00000472108 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.92■■□□□ 1.58
USP20-204ENST00000472108 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
USP20-204ENST00000472108 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.91■■□□□ 1.58
USP20-204ENST00000472108 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
USP20-204ENST00000472108 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.87■■□□□ 1.57
USP20-204ENST00000472108 PTPRGP23470 1445 aa24.85■■□□□ 1.57
USP20-204ENST00000472108 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.85■■□□□ 1.57
USP20-204ENST00000472108 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
USP20-204ENST00000472108 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.84■■□□□ 1.57
USP20-204ENST00000472108 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.83■■□□□ 1.57
USP20-204ENST00000472108 ABCA8O94911 1581 aa24.82■■□□□ 1.56
USP20-204ENST00000472108 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.81■■□□□ 1.56
USP20-204ENST00000472108 ARID3CA6NKF2 412 aa24.8■■□□□ 1.56
USP20-204ENST00000472108 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
USP20-204ENST00000472108 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.78■■□□□ 1.56
USP20-204ENST00000472108 OSCARQ8IYS5 282 aa24.77■■□□□ 1.56
USP20-204ENST00000472108 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
USP20-204ENST00000472108 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
USP20-204ENST00000472108 NCOA2Q15596 1464 aa24.76■■□□□ 1.55
USP20-204ENST00000472108 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
USP20-204ENST00000472108 ARHGEF11O15085 1522 aa24.73■■□□□ 1.55
USP20-204ENST00000472108 UACAQ9BZF9 1416 aa24.71■■□□□ 1.55
USP20-204ENST00000472108 ATP10BO94823 1461 aa24.69■■□□□ 1.54
USP20-204ENST00000472108 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.54
USP20-204ENST00000472108 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.67■■□□□ 1.54
USP20-204ENST00000472108 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.67■■□□□ 1.54
USP20-204ENST00000472108 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
USP20-204ENST00000472108 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
USP20-204ENST00000472108 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.62■■□□□ 1.53
USP20-204ENST00000472108 ABCC2Q92887 1545 aa24.61■■□□□ 1.53
USP20-204ENST00000472108 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.57■■□□□ 1.52
USP20-204ENST00000472108 ITGAEP38570 1179 aa24.57■■□□□ 1.52
USP20-204ENST00000472108 MIA2Q96PC5 1412 aa24.56■■□□□ 1.52
USP20-204ENST00000472108 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.55■■□□□ 1.52
USP20-204ENST00000472108 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
USP20-204ENST00000472108 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
USP20-204ENST00000472108 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.52■■□□□ 1.52
USP20-204ENST00000472108 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
USP20-204ENST00000472108 KIF14Q15058 1648 aa24.49■■□□□ 1.51
USP20-204ENST00000472108 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.47■■□□□ 1.51
USP20-204ENST00000472108 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
USP20-204ENST00000472108 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.44■■□□□ 1.5
USP20-204ENST00000472108 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
USP20-204ENST00000472108 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.41■■□□□ 1.5
USP20-204ENST00000472108 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
USP20-204ENST00000472108 PTPRKQ15262 1439 aa24.4■■□□□ 1.5
USP20-204ENST00000472108 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.4■■□□□ 1.5
USP20-204ENST00000472108 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.35■■□□□ 1.49
USP20-204ENST00000472108 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
USP20-204ENST00000472108 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.34■■□□□ 1.49
USP20-204ENST00000472108 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.3■■□□□ 1.48
USP20-204ENST00000472108 HFM1A2PYH4 1435 aa24.29■■□□□ 1.48
USP20-204ENST00000472108 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
USP20-204ENST00000472108 KCNH8Q96L42 1107 aa24.28■■□□□ 1.48
USP20-204ENST00000472108 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
USP20-204ENST00000472108 DAPK1P53355 1430 aa24.28■■□□□ 1.48
USP20-204ENST00000472108 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
USP20-204ENST00000472108 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
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