RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.95■■□□□ 1.74
FAAP20-211ENST00000469733 MAP3K1Q13233 1512 aa25.94■■□□□ 1.74
FAAP20-211ENST00000469733 TIAM1Q13009 1591 aa25.91■■□□□ 1.74
FAAP20-211ENST00000469733 PBRM1Q86U86 1689 aa25.88■■□□□ 1.73
FAAP20-211ENST00000469733 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
FAAP20-211ENST00000469733 WDR62O43379 1518 aa25.86■■□□□ 1.73
FAAP20-211ENST00000469733 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.85■■□□□ 1.73
FAAP20-211ENST00000469733 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
FAAP20-211ENST00000469733 P3H3Q8IVL6 736 aa25.85■■□□□ 1.73
FAAP20-211ENST00000469733 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.82■■□□□ 1.72
FAAP20-211ENST00000469733 IFT140Q96RY7 1462 aa25.8■■□□□ 1.72
FAAP20-211ENST00000469733 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.79■■□□□ 1.72
FAAP20-211ENST00000469733 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.79■■□□□ 1.722e-6■■□□□ 13.2
FAAP20-211ENST00000469733 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.78■■□□□ 1.72
FAAP20-211ENST00000469733 SAMD9Q5K651 1589 aa25.77■■□□□ 1.72
FAAP20-211ENST00000469733 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-211ENST00000469733 ADAMTS12P58397 1594 aa25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-211ENST00000469733 GRIN2BQ13224 1484 aa25.75■■□□□ 1.71
FAAP20-211ENST00000469733 FMN1Q68DA7 1419 aa25.75■■□□□ 1.71
FAAP20-211ENST00000469733 ERCC6Q03468 1493 aa25.74■■□□□ 1.71
FAAP20-211ENST00000469733 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.74■■□□□ 1.71
FAAP20-211ENST00000469733 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
FAAP20-211ENST00000469733 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.66■■□□□ 1.7
FAAP20-211ENST00000469733 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
FAAP20-211ENST00000469733 IQGAP2Q13576 1575 aa25.62■■□□□ 1.69
FAAP20-211ENST00000469733 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
FAAP20-211ENST00000469733 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.59■■□□□ 1.69
FAAP20-211ENST00000469733 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.52■■□□□ 1.68
FAAP20-211ENST00000469733 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-211ENST00000469733 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-211ENST00000469733 ITGAEP38570 1179 aa25.49■■□□□ 1.67
FAAP20-211ENST00000469733 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.48■■□□□ 1.67
FAAP20-211ENST00000469733 GRIN2AQ12879 1464 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-211ENST00000469733 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-211ENST00000469733 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
FAAP20-211ENST00000469733 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-211ENST00000469733 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-211ENST00000469733 HECW1Q76N89 1606 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-211ENST00000469733 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.41■■□□□ 1.661e-7■■■■□ 21
FAAP20-211ENST00000469733 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.4■■□□□ 1.66
FAAP20-211ENST00000469733 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
FAAP20-211ENST00000469733 SYNJ2O15056 1496 aa25.37■■□□□ 1.65
FAAP20-211ENST00000469733 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.36■■□□□ 1.65
FAAP20-211ENST00000469733 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.36■■□□□ 1.65
FAAP20-211ENST00000469733 KIAA0556O60303 1618 aa25.35■■□□□ 1.65
FAAP20-211ENST00000469733 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.35■■□□□ 1.65
FAAP20-211ENST00000469733 NCOA2Q15596 1464 aa25.34■■□□□ 1.65
FAAP20-211ENST00000469733 DISP1Q96F81 1524 aa25.32■■□□□ 1.64
FAAP20-211ENST00000469733 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
FAAP20-211ENST00000469733 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-211ENST00000469733 CEP170Q5SW79 1584 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-211ENST00000469733 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-211ENST00000469733 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-211ENST00000469733 ARHGEF11O15085 1522 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-211ENST00000469733 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
FAAP20-211ENST00000469733 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
FAAP20-211ENST00000469733 NUP160Q12769 1436 aa25.22■■□□□ 1.63
FAAP20-211ENST00000469733 FBLN2P98095 1184 aa25.21■■□□□ 1.63
FAAP20-211ENST00000469733 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.19■■□□□ 1.62
FAAP20-211ENST00000469733 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.18■■□□□ 1.62
FAAP20-211ENST00000469733 MAPKBP1O60336 1514 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-211ENST00000469733 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
FAAP20-211ENST00000469733 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.12■■□□□ 1.61
FAAP20-211ENST00000469733 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
FAAP20-211ENST00000469733 ARID3CA6NKF2 412 aa25.11■■□□□ 1.61
FAAP20-211ENST00000469733 PTPRKQ15262 1439 aa25.11■■□□□ 1.61
FAAP20-211ENST00000469733 HFM1A2PYH4 1435 aa25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-211ENST00000469733 JPH4Q96JJ6 628 aa25.09■■□□□ 1.61
FAAP20-211ENST00000469733 MIA2Q96PC5 1412 aa25.07■■□□□ 1.6
FAAP20-211ENST00000469733 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
FAAP20-211ENST00000469733 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.02■■□□□ 1.6
FAAP20-211ENST00000469733 NAIPQ13075 1403 aa25.01■■□□□ 1.59
FAAP20-211ENST00000469733 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-211ENST00000469733 UACAQ9BZF9 1416 aa24.95■■□□□ 1.58
FAAP20-211ENST00000469733 CHD1O14646 1710 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-211ENST00000469733 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.94■■□□□ 1.58
FAAP20-211ENST00000469733 AKNAQ7Z591 1439 aa24.93■■□□□ 1.58
FAAP20-211ENST00000469733 ABCA8O94911 1581 aa24.92■■□□□ 1.58
FAAP20-211ENST00000469733 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
FAAP20-211ENST00000469733 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.9■■□□□ 1.58
FAAP20-211ENST00000469733 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-211ENST00000469733 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-211ENST00000469733 NEUROD1Q13562 356 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-211ENST00000469733 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-211ENST00000469733 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-211ENST00000469733 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-211ENST00000469733 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-211ENST00000469733 DAPK1P53355 1430 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-211ENST00000469733 KIF14Q15058 1648 aa24.83■■□□□ 1.57
FAAP20-211ENST00000469733 ATP10BO94823 1461 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-211ENST00000469733 ROCK1Q13464 1354 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-211ENST00000469733 PTPRGP23470 1445 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-211ENST00000469733 SHROOM2Q13796 1616 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-211ENST00000469733 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-211ENST00000469733 ABCC5O15440 1437 aa24.79■■□□□ 1.56
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
FAAP20-211ENST00000469733 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.77■■□□□ 1.56
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