RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468031.1

NME4-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2

Gene NME4, Length 1,861 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-210ENST00000468031 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
NME4-210ENST00000468031 PBRM1Q86U86 1689 aa28.49■■■□□ 2.15
NME4-210ENST00000468031 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
NME4-210ENST00000468031 IFT140Q96RY7 1462 aa28.46■■■□□ 2.15
NME4-210ENST00000468031 TIAM1Q13009 1591 aa28.46■■■□□ 2.15
NME4-210ENST00000468031 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.41■■■□□ 2.144e-7■■■□□ 18.2
NME4-210ENST00000468031 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
NME4-210ENST00000468031 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
NME4-210ENST00000468031 SAMD9Q5K651 1589 aa28.39■■■□□ 2.14
NME4-210ENST00000468031 ADAMTS12P58397 1594 aa28.38■■■□□ 2.13
NME4-210ENST00000468031 GRIN2BQ13224 1484 aa28.38■■■□□ 2.13
NME4-210ENST00000468031 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.38■■■□□ 2.13
NME4-210ENST00000468031 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.37■■■□□ 2.13
NME4-210ENST00000468031 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.37■■■□□ 2.13
NME4-210ENST00000468031 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.34■■■□□ 2.13
NME4-210ENST00000468031 ERCC6Q03468 1493 aa28.34■■■□□ 2.13
NME4-210ENST00000468031 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
NME4-210ENST00000468031 FMN1Q68DA7 1419 aa28.32■■■□□ 2.12
NME4-210ENST00000468031 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
NME4-210ENST00000468031 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.32■■■□□ 2.12
NME4-210ENST00000468031 P3H3Q8IVL6 736 aa28.28■■■□□ 2.12
NME4-210ENST00000468031 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
NME4-210ENST00000468031 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.24■■■□□ 2.11
NME4-210ENST00000468031 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.23■■■□□ 2.11
NME4-210ENST00000468031 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
NME4-210ENST00000468031 IQGAP2Q13576 1575 aa28.2■■■□□ 2.1
NME4-210ENST00000468031 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.08■■■□□ 2.09
NME4-210ENST00000468031 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
NME4-210ENST00000468031 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.08■■■□□ 2.09
NME4-210ENST00000468031 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
NME4-210ENST00000468031 GRIN2AQ12879 1464 aa28.05■■■□□ 2.08
NME4-210ENST00000468031 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.04■■■□□ 2.08
NME4-210ENST00000468031 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.03■■■□□ 2.08
NME4-210ENST00000468031 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28■■■□□ 2.07
NME4-210ENST00000468031 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.98■■■□□ 2.07
NME4-210ENST00000468031 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.98■■■□□ 2.07
NME4-210ENST00000468031 SYNJ2O15056 1496 aa27.97■■■□□ 2.07
NME4-210ENST00000468031 HECW1Q76N89 1606 aa27.96■■■□□ 2.07
NME4-210ENST00000468031 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.93■■■□□ 2.06
NME4-210ENST00000468031 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
NME4-210ENST00000468031 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.93■■■□□ 2.06
NME4-210ENST00000468031 KIAA0556O60303 1618 aa27.91■■■□□ 2.06
NME4-210ENST00000468031 DISP1Q96F81 1524 aa27.88■■■□□ 2.05
NME4-210ENST00000468031 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
NME4-210ENST00000468031 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.85■■■□□ 2.05
NME4-210ENST00000468031 CEP170Q5SW79 1584 aa27.85■■■□□ 2.05
NME4-210ENST00000468031 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
NME4-210ENST00000468031 NCOA2Q15596 1464 aa27.83■■■□□ 2.05
NME4-210ENST00000468031 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.04
NME4-210ENST00000468031 ARHGEF11O15085 1522 aa27.82■■■□□ 2.04
NME4-210ENST00000468031 NUP160Q12769 1436 aa27.82■■■□□ 2.04
NME4-210ENST00000468031 ITGAEP38570 1179 aa27.81■■■□□ 2.04
NME4-210ENST00000468031 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
NME4-210ENST00000468031 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.8■■■□□ 2.04
NME4-210ENST00000468031 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.79■■■□□ 2.04
NME4-210ENST00000468031 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.79■■■□□ 2.04
NME4-210ENST00000468031 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.78■■■□□ 2.04
NME4-210ENST00000468031 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.71■■■□□ 2.03
NME4-210ENST00000468031 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
NME4-210ENST00000468031 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
NME4-210ENST00000468031 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.65■■■□□ 2.02
NME4-210ENST00000468031 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.65■■■□□ 2.02
NME4-210ENST00000468031 FBLN2P98095 1184 aa27.64■■■□□ 2.02
NME4-210ENST00000468031 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
NME4-210ENST00000468031 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
NME4-210ENST00000468031 MAPKBP1O60336 1514 aa27.6■■■□□ 2.01
NME4-210ENST00000468031 JPH4Q96JJ6 628 aa27.59■■■□□ 2.01
NME4-210ENST00000468031 MIA2Q96PC5 1412 aa27.59■■■□□ 2.01
NME4-210ENST00000468031 HFM1A2PYH4 1435 aa27.57■■■□□ 2
NME4-210ENST00000468031 PTPRKQ15262 1439 aa27.55■■■□□ 2
NME4-210ENST00000468031 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
NME4-210ENST00000468031 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
NME4-210ENST00000468031 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.49■■□□□ 1.99
NME4-210ENST00000468031 NAIPQ13075 1403 aa27.46■■□□□ 1.99
NME4-210ENST00000468031 AKNAQ7Z591 1439 aa27.46■■□□□ 1.99
NME4-210ENST00000468031 ABCA8O94911 1581 aa27.46■■□□□ 1.99
NME4-210ENST00000468031 CHD1O14646 1710 aa27.46■■□□□ 1.99
NME4-210ENST00000468031 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.99
NME4-210ENST00000468031 ARID3CA6NKF2 412 aa27.44■■□□□ 1.98
NME4-210ENST00000468031 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.42■■□□□ 1.98
NME4-210ENST00000468031 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.4■■□□□ 1.98
NME4-210ENST00000468031 UACAQ9BZF9 1416 aa27.39■■□□□ 1.98
NME4-210ENST00000468031 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
NME4-210ENST00000468031 SHROOM2Q13796 1616 aa27.37■■□□□ 1.97
NME4-210ENST00000468031 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.35■■□□□ 1.97
NME4-210ENST00000468031 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.34■■□□□ 1.97
NME4-210ENST00000468031 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
NME4-210ENST00000468031 PTPRGP23470 1445 aa27.28■■□□□ 1.96
NME4-210ENST00000468031 DAPK1P53355 1430 aa27.28■■□□□ 1.96
NME4-210ENST00000468031 KIF14Q15058 1648 aa27.28■■□□□ 1.96
NME4-210ENST00000468031 ATP10BO94823 1461 aa27.28■■□□□ 1.96
NME4-210ENST00000468031 ROCK1Q13464 1354 aa27.28■■□□□ 1.96
NME4-210ENST00000468031 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
NME4-210ENST00000468031 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
NME4-210ENST00000468031 ABCC5O15440 1437 aa27.23■■□□□ 1.95
NME4-210ENST00000468031 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.21■■□□□ 1.95
NME4-210ENST00000468031 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.21■■□□□ 1.95
NME4-210ENST00000468031 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.21■■□□□ 1.95
NME4-210ENST00000468031 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.2■■□□□ 1.94
NME4-210ENST00000468031 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.2■■□□□ 1.94
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