RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464395.1

PITRM1-209, Transcript of pitrilysin metallopeptidase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PITRM1, Length 3,240 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1-209ENST00000464395 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.47■□□□□ 0.23
PITRM1-209ENST00000464395 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.47■□□□□ 0.23
PITRM1-209ENST00000464395 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.46■□□□□ 0.23
PITRM1-209ENST00000464395 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
PITRM1-209ENST00000464395 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
PITRM1-209ENST00000464395 CLSPNQ9HAW4 1339 aa16.45■□□□□ 0.22
PITRM1-209ENST00000464395 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.44■□□□□ 0.22
PITRM1-209ENST00000464395 SAMD9Q5K651 1589 aa16.44■□□□□ 0.22
PITRM1-209ENST00000464395 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
PITRM1-209ENST00000464395 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.43■□□□□ 0.223e-7■■■■■ 32.1
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PITRM1-209ENST00000464395 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.39■□□□□ 0.21
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PITRM1-209ENST00000464395 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.38■□□□□ 0.21
PITRM1-209ENST00000464395 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.37■□□□□ 0.21
PITRM1-209ENST00000464395 MAPKBP1O60336 1514 aa16.37■□□□□ 0.21
PITRM1-209ENST00000464395 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.35■□□□□ 0.21
PITRM1-209ENST00000464395 PBRM1Q86U86 1689 aa16.33■□□□□ 0.21
PITRM1-209ENST00000464395 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.32■□□□□ 0.2
PITRM1-209ENST00000464395 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.31■□□□□ 0.2
PITRM1-209ENST00000464395 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
PITRM1-209ENST00000464395 NEUROD1Q13562 356 aa16.3■□□□□ 0.2
PITRM1-209ENST00000464395 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP16.28■□□□□ 0.2
PITRM1-209ENST00000464395 GRIN2BQ13224 1484 aa16.28■□□□□ 0.2
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PITRM1-209ENST00000464395 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
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PITRM1-209ENST00000464395 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
PITRM1-209ENST00000464395 FMN1Q68DA7 1419 aa16.23■□□□□ 0.19
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PITRM1-209ENST00000464395 ADAMTS12P58397 1594 aa16.23■□□□□ 0.19
PITRM1-209ENST00000464395 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.23■□□□□ 0.19
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PITRM1-209ENST00000464395 MIER1Q8N108 512 aa16.2■□□□□ 0.18
PITRM1-209ENST00000464395 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa16.19■□□□□ 0.18
PITRM1-209ENST00000464395 FGD6Q6ZV73 1430 aa16.16■□□□□ 0.18
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PITRM1-209ENST00000464395 WDR62O43379 1518 aa16.15■□□□□ 0.18
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PITRM1-209ENST00000464395 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.14■□□□□ 0.17
PITRM1-209ENST00000464395 IQGAP2Q13576 1575 aa16.13■□□□□ 0.17
PITRM1-209ENST00000464395 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.13■□□□□ 0.17
PITRM1-209ENST00000464395 NCOA2Q15596 1464 aa16.11■□□□□ 0.17
PITRM1-209ENST00000464395 PTPN23Q9H3S7 1636 aa16.11■□□□□ 0.17
PITRM1-209ENST00000464395 ITGAEP38570 1179 aa16.08■□□□□ 0.17
PITRM1-209ENST00000464395 HECW1Q76N89 1606 aa16.08■□□□□ 0.16
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PITRM1-209ENST00000464395 HFM1A2PYH4 1435 aa16.07■□□□□ 0.16
PITRM1-209ENST00000464395 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.06■□□□□ 0.16
PITRM1-209ENST00000464395 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
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PITRM1-209ENST00000464395 NAIPQ13075 1403 aa16.02■□□□□ 0.16
PITRM1-209ENST00000464395 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PITRM1-209ENST00000464395 DISP1Q96F81 1524 aa16.02■□□□□ 0.15
PITRM1-209ENST00000464395 KIAA0556O60303 1618 aa16.01■□□□□ 0.15
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PITRM1-209ENST00000464395 MTUS2Q5JR59 1369 aa16■□□□□ 0.15
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PITRM1-209ENST00000464395 UACAQ9BZF9 1416 aa15.98■□□□□ 0.15
PITRM1-209ENST00000464395 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.98■□□□□ 0.15
PITRM1-209ENST00000464395 KDM6BO15054 1643 aa15.98■□□□□ 0.15
PITRM1-209ENST00000464395 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.97■□□□□ 0.15
PITRM1-209ENST00000464395 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.96■□□□□ 0.15
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PITRM1-209ENST00000464395 AKNAQ7Z591 1439 aa15.95■□□□□ 0.14
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PITRM1-209ENST00000464395 CEP170Q5SW79 1584 aa15.92■□□□□ 0.14
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PITRM1-209ENST00000464395 MIA2Q96PC5 1412 aa15.92■□□□□ 0.14
PITRM1-209ENST00000464395 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
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PITRM1-209ENST00000464395 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
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PITRM1-209ENST00000464395 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.88■□□□□ 0.13
PITRM1-209ENST00000464395 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
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PITRM1-209ENST00000464395 NUP160Q12769 1436 aa15.82■□□□□ 0.12
PITRM1-209ENST00000464395 CROCC2H7BZ55 1655 aa15.81■□□□□ 0.12
PITRM1-209ENST00000464395 DAPK1P53355 1430 aa15.79■□□□□ 0.12
PITRM1-209ENST00000464395 ROCK1Q13464 1354 aa15.79■□□□□ 0.12
PITRM1-209ENST00000464395 ABCC5O15440 1437 aa15.78■□□□□ 0.12
PITRM1-209ENST00000464395 KIF14Q15058 1648 aa15.77■□□□□ 0.12
PITRM1-209ENST00000464395 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.77■□□□□ 0.11
PITRM1-209ENST00000464395 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.77■□□□□ 0.11
PITRM1-209ENST00000464395 KCNH8Q96L42 1107 aa15.76■□□□□ 0.11
PITRM1-209ENST00000464395 ABCA8O94911 1581 aa15.76■□□□□ 0.11
PITRM1-209ENST00000464395 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.73■□□□□ 0.11
PITRM1-209ENST00000464395 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.73■□□□□ 0.11
PITRM1-209ENST00000464395 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
PITRM1-209ENST00000464395 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.71■□□□□ 0.11
PITRM1-209ENST00000464395 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
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