RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464203.1

C1orf61-208, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

TSL 5

Gene C1orf61, Length 766 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-208ENST00000464203 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
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C1orf61-208ENST00000464203 CUL7Q14999 1698 aa30.21■■■□□ 2.43
C1orf61-208ENST00000464203 EEA1Q15075 1411 aa30.21■■■□□ 2.43
C1orf61-208ENST00000464203 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.18■■■□□ 2.42
C1orf61-208ENST00000464203 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.12■■■□□ 2.41
C1orf61-208ENST00000464203 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.94■■■□□ 2.38
C1orf61-208ENST00000464203 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.94■■■□□ 2.38
C1orf61-208ENST00000464203 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.92■■■□□ 2.38
C1orf61-208ENST00000464203 PRXQ9BXM0 1461 aa29.9■■■□□ 2.38
C1orf61-208ENST00000464203 MAPKBP1O60336 1514 aa29.9■■■□□ 2.38
C1orf61-208ENST00000464203 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.87■■■□□ 2.37
C1orf61-208ENST00000464203 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.87■■■□□ 2.37
C1orf61-208ENST00000464203 PTPRGP23470 1445 aa29.87■■■□□ 2.37
C1orf61-208ENST00000464203 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.87■■■□□ 2.37
C1orf61-208ENST00000464203 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.86■■■□□ 2.37
C1orf61-208ENST00000464203 IQGAP2Q13576 1575 aa29.86■■■□□ 2.37
C1orf61-208ENST00000464203 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.83■■■□□ 2.37
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C1orf61-208ENST00000464203 KIF21BO75037 1637 aa29.78■■■□□ 2.36
C1orf61-208ENST00000464203 DISP1Q96F81 1524 aa29.75■■■□□ 2.35
C1orf61-208ENST00000464203 DIP2BQ9P265 1576 aa29.74■■■□□ 2.35
C1orf61-208ENST00000464203 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.72■■■□□ 2.35
C1orf61-208ENST00000464203 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
C1orf61-208ENST00000464203 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
C1orf61-208ENST00000464203 ABCC2Q92887 1545 aa29.69■■■□□ 2.34
C1orf61-208ENST00000464203 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.68■■■□□ 2.34
C1orf61-208ENST00000464203 UACAQ9BZF9 1416 aa29.65■■■□□ 2.34
C1orf61-208ENST00000464203 GOLGA3Q08378 1498 aa29.59■■■□□ 2.33
C1orf61-208ENST00000464203 KIAA0556O60303 1618 aa29.58■■■□□ 2.33
C1orf61-208ENST00000464203 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.57■■■□□ 2.32
C1orf61-208ENST00000464203 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.56■■■□□ 2.32
C1orf61-208ENST00000464203 ASXL2Q76L83 1435 aa29.56■■■□□ 2.32
C1orf61-208ENST00000464203 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
C1orf61-208ENST00000464203 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.53■■■□□ 2.32
C1orf61-208ENST00000464203 GLI2P10070 1586 aa29.49■■■□□ 2.31
C1orf61-208ENST00000464203 TSPOAP1O95153 1857 aa29.43■■■□□ 2.3
C1orf61-208ENST00000464203 KDM6BO15054 1643 aa29.42■■■□□ 2.3
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C1orf61-208ENST00000464203 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
C1orf61-208ENST00000464203 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
C1orf61-208ENST00000464203 ABCA8O94911 1581 aa29.34■■■□□ 2.29
C1orf61-208ENST00000464203 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
C1orf61-208ENST00000464203 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.29■■■□□ 2.28
C1orf61-208ENST00000464203 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.29■■■□□ 2.28
C1orf61-208ENST00000464203 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.24■■■□□ 2.27
C1orf61-208ENST00000464203 SAMD9Q5K651 1589 aa29.23■■■□□ 2.27
C1orf61-208ENST00000464203 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.23■■■□□ 2.27
C1orf61-208ENST00000464203 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
C1orf61-208ENST00000464203 P3H3Q8IVL6 736 aa29.18■■■□□ 2.26
C1orf61-208ENST00000464203 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.16■■■□□ 2.26
C1orf61-208ENST00000464203 KCNH8Q96L42 1107 aa29.12■■■□□ 2.25
C1orf61-208ENST00000464203 ATP10BO94823 1461 aa29.11■■■□□ 2.25
C1orf61-208ENST00000464203 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.11■■■□□ 2.25
C1orf61-208ENST00000464203 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.11■■■□□ 2.25
C1orf61-208ENST00000464203 CD109Q6YHK3 1445 aa29.11■■■□□ 2.25
C1orf61-208ENST00000464203 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.08■■■□□ 2.25
C1orf61-208ENST00000464203 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.08■■■□□ 2.25
C1orf61-208ENST00000464203 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.04■■■□□ 2.24
C1orf61-208ENST00000464203 ARID3CA6NKF2 412 aa29.03■■■□□ 2.24
C1orf61-208ENST00000464203 CLIP1P30622 1438 aa29.02■■■□□ 2.24
C1orf61-208ENST00000464203 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29■■■□□ 2.23
C1orf61-208ENST00000464203 CEP162Q5TB80 1403 aa28.99■■■□□ 2.23
C1orf61-208ENST00000464203 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.96■■■□□ 2.23
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C1orf61-208ENST00000464203 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
C1orf61-208ENST00000464203 FMN1Q68DA7 1419 aa28.94■■■□□ 2.22
C1orf61-208ENST00000464203 ADGRL1O94910 1474 aa28.91■■■□□ 2.22
C1orf61-208ENST00000464203 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.91■■■□□ 2.22
C1orf61-208ENST00000464203 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.89■■■□□ 2.21
C1orf61-208ENST00000464203 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
C1orf61-208ENST00000464203 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
C1orf61-208ENST00000464203 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.87■■■□□ 2.21
C1orf61-208ENST00000464203 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.79■■■□□ 2.2
C1orf61-208ENST00000464203 NEO1Q92859 1461 aa28.78■■■□□ 2.2
C1orf61-208ENST00000464203 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.73■■■□□ 2.19
C1orf61-208ENST00000464203 HECW1Q76N89 1606 aa28.71■■■□□ 2.19
C1orf61-208ENST00000464203 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.71■■■□□ 2.19
C1orf61-208ENST00000464203 RAPGEF3O95398 923 aa28.68■■■□□ 2.18
C1orf61-208ENST00000464203 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.68■■■□□ 2.18
C1orf61-208ENST00000464203 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.64■■■□□ 2.185e-6■■■■■ 35.4
C1orf61-208ENST00000464203 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
C1orf61-208ENST00000464203 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
C1orf61-208ENST00000464203 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.61■■■□□ 2.17
C1orf61-208ENST00000464203 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.59■■■□□ 2.17
C1orf61-208ENST00000464203 AKNAQ7Z591 1439 aa28.58■■■□□ 2.17
C1orf61-208ENST00000464203 FANCAO15360 1455 aa28.58■■■□□ 2.17
C1orf61-208ENST00000464203 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.56■■■□□ 2.16
C1orf61-208ENST00000464203 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
C1orf61-208ENST00000464203 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.54■■■□□ 2.16
C1orf61-208ENST00000464203 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
C1orf61-208ENST00000464203 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
C1orf61-208ENST00000464203 PLCH2O75038 1416 aa28.51■■■□□ 2.15
C1orf61-208ENST00000464203 MAP3K1Q13233 1512 aa28.5■■■□□ 2.15
C1orf61-208ENST00000464203 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.5■■■□□ 2.15
C1orf61-208ENST00000464203 RICTORQ6R327 1708 aa28.49■■■□□ 2.15
C1orf61-208ENST00000464203 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.45■■■□□ 2.14
C1orf61-208ENST00000464203 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.45■■■□□ 2.14
C1orf61-208ENST00000464203 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.43■■■□□ 2.14
C1orf61-208ENST00000464203 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.43■■■□□ 2.14
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