RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462548.6

RPRD1B-203, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 5

Gene RPRD1B, Length 2,436 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-203ENST00000462548 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.65■■□□□ 1.38
RPRD1B-203ENST00000462548 GRIN2AQ12879 1464 aa23.61■■□□□ 1.37
RPRD1B-203ENST00000462548 SYNJ2O15056 1496 aa23.6■■□□□ 1.37
RPRD1B-203ENST00000462548 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
RPRD1B-203ENST00000462548 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
RPRD1B-203ENST00000462548 P3H3Q8IVL6 736 aa23.52■■□□□ 1.36
RPRD1B-203ENST00000462548 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.52■■□□□ 1.36
RPRD1B-203ENST00000462548 FBLN2P98095 1184 aa23.51■■□□□ 1.35
RPRD1B-203ENST00000462548 IQGAP2Q13576 1575 aa23.51■■□□□ 1.35
RPRD1B-203ENST00000462548 CEP170Q5SW79 1584 aa23.49■■□□□ 1.35
RPRD1B-203ENST00000462548 SAMD9Q5K651 1589 aa23.49■■□□□ 1.35
RPRD1B-203ENST00000462548 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.49■■□□□ 1.35
RPRD1B-203ENST00000462548 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.46■■□□□ 1.35
RPRD1B-203ENST00000462548 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.44■■□□□ 1.34
RPRD1B-203ENST00000462548 NUP160Q12769 1436 aa23.44■■□□□ 1.34
RPRD1B-203ENST00000462548 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
RPRD1B-203ENST00000462548 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
RPRD1B-203ENST00000462548 CHD1O14646 1710 aa23.4■■□□□ 1.34
RPRD1B-203ENST00000462548 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.4■■□□□ 1.34
RPRD1B-203ENST00000462548 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
RPRD1B-203ENST00000462548 APLP2Q06481 763 aa23.33■■□□□ 1.33
RPRD1B-203ENST00000462548 DISP1Q96F81 1524 aa23.32■■□□□ 1.32
RPRD1B-203ENST00000462548 FMN1Q68DA7 1419 aa23.3■■□□□ 1.32
RPRD1B-203ENST00000462548 KIAA0556O60303 1618 aa23.29■■□□□ 1.32
RPRD1B-203ENST00000462548 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.28■■□□□ 1.32
RPRD1B-203ENST00000462548 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
RPRD1B-203ENST00000462548 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.26■■□□□ 1.31
RPRD1B-203ENST00000462548 JPH4Q96JJ6 628 aa23.25■■□□□ 1.31
RPRD1B-203ENST00000462548 TIAM1Q13009 1591 aa23.23■■□□□ 1.31
RPRD1B-203ENST00000462548 MAP3K1Q13233 1512 aa23.21■■□□□ 1.31
RPRD1B-203ENST00000462548 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
RPRD1B-203ENST00000462548 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.19■■□□□ 1.3
RPRD1B-203ENST00000462548 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.18■■□□□ 1.3
RPRD1B-203ENST00000462548 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.14■■□□□ 1.29
RPRD1B-203ENST00000462548 SHROOM2Q13796 1616 aa23.13■■□□□ 1.29
RPRD1B-203ENST00000462548 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.13■■□□□ 1.29
RPRD1B-203ENST00000462548 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.12■■□□□ 1.29
RPRD1B-203ENST00000462548 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
RPRD1B-203ENST00000462548 HECW1Q76N89 1606 aa23.09■■□□□ 1.29
RPRD1B-203ENST00000462548 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.05■■□□□ 1.28
RPRD1B-203ENST00000462548 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.05■■□□□ 1.28
RPRD1B-203ENST00000462548 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
RPRD1B-203ENST00000462548 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.03■■□□□ 1.28
RPRD1B-203ENST00000462548 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.27
RPRD1B-203ENST00000462548 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
RPRD1B-203ENST00000462548 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.01■■□□□ 1.27
RPRD1B-203ENST00000462548 ARID3CA6NKF2 412 aa23■■□□□ 1.27
RPRD1B-203ENST00000462548 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.99■■□□□ 1.27
RPRD1B-203ENST00000462548 ABCA8O94911 1581 aa22.97■■□□□ 1.27
RPRD1B-203ENST00000462548 PTPRGP23470 1445 aa22.95■■□□□ 1.26
RPRD1B-203ENST00000462548 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.95■■□□□ 1.26
RPRD1B-203ENST00000462548 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.95■■□□□ 1.26
RPRD1B-203ENST00000462548 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
RPRD1B-203ENST00000462548 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.92■■□□□ 1.26
RPRD1B-203ENST00000462548 OSCARQ8IYS5 282 aa22.89■■□□□ 1.25
RPRD1B-203ENST00000462548 NCOA2Q15596 1464 aa22.86■■□□□ 1.25
RPRD1B-203ENST00000462548 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.86■■□□□ 1.25
RPRD1B-203ENST00000462548 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
RPRD1B-203ENST00000462548 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
RPRD1B-203ENST00000462548 ARHGEF11O15085 1522 aa22.83■■□□□ 1.24
RPRD1B-203ENST00000462548 ATP10BO94823 1461 aa22.82■■□□□ 1.24
RPRD1B-203ENST00000462548 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
RPRD1B-203ENST00000462548 UACAQ9BZF9 1416 aa22.82■■□□□ 1.24
RPRD1B-203ENST00000462548 ABCC2Q92887 1545 aa22.76■■□□□ 1.23
RPRD1B-203ENST00000462548 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
RPRD1B-203ENST00000462548 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.75■■□□□ 1.23
RPRD1B-203ENST00000462548 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.75■■□□□ 1.23
RPRD1B-203ENST00000462548 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
RPRD1B-203ENST00000462548 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
RPRD1B-203ENST00000462548 KIF14Q15058 1648 aa22.7■■□□□ 1.22
RPRD1B-203ENST00000462548 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.69■■□□□ 1.22
RPRD1B-203ENST00000462548 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.69■■□□□ 1.22
RPRD1B-203ENST00000462548 HRCP23327 699 aa22.68■■□□□ 1.22
RPRD1B-203ENST00000462548 ITGAEP38570 1179 aa22.68■■□□□ 1.22
RPRD1B-203ENST00000462548 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.66■■□□□ 1.22
RPRD1B-203ENST00000462548 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
RPRD1B-203ENST00000462548 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.64■■□□□ 1.21
RPRD1B-203ENST00000462548 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
RPRD1B-203ENST00000462548 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.62■■□□□ 1.21
RPRD1B-203ENST00000462548 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
RPRD1B-203ENST00000462548 MIA2Q96PC5 1412 aa22.59■■□□□ 1.21
RPRD1B-203ENST00000462548 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.59■■□□□ 1.21
RPRD1B-203ENST00000462548 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
RPRD1B-203ENST00000462548 PTPRKQ15262 1439 aa22.55■■□□□ 1.2
RPRD1B-203ENST00000462548 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.53■■□□□ 1.2
RPRD1B-203ENST00000462548 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.52■■□□□ 1.2
RPRD1B-203ENST00000462548 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
RPRD1B-203ENST00000462548 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
RPRD1B-203ENST00000462548 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
RPRD1B-203ENST00000462548 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.47■■□□□ 1.19
RPRD1B-203ENST00000462548 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.192e-8■□□□□ 9.5
RPRD1B-203ENST00000462548 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.46■■□□□ 1.19
RPRD1B-203ENST00000462548 KCNH8Q96L42 1107 aa22.46■■□□□ 1.19
RPRD1B-203ENST00000462548 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.45■■□□□ 1.18
RPRD1B-203ENST00000462548 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.45■■□□□ 1.18
RPRD1B-203ENST00000462548 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.45■■□□□ 1.18
RPRD1B-203ENST00000462548 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.43■■□□□ 1.18
RPRD1B-203ENST00000462548 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.43■■□□□ 1.18
RPRD1B-203ENST00000462548 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.42■■□□□ 1.18
RPRD1B-203ENST00000462548 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms