RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458121.6

PARD6A-202, Transcript of par-6 family cell polarity regulator alpha, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PARD6A, Length 1,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6A-202ENST00000458121 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.89■■■■■ 5.26
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PARD6A-202ENST00000458121 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP47.67■■■■■ 5.22
PARD6A-202ENST00000458121 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa47.66■■■■■ 5.22
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PARD6A-202ENST00000458121 IGF1RP08069 1367 aa47.62■■■■■ 5.21
PARD6A-202ENST00000458121 ADCY10Q96PN6 1610 aa47.59■■■■■ 5.21
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PARD6A-202ENST00000458121 KIF27Q86VH2 1401 aa47.54■■■■■ 5.2
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PARD6A-202ENST00000458121 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa47.16■■■■■ 5.14
PARD6A-202ENST00000458121 ABCC2Q92887 1545 aa47.12■■■■■ 5.13
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PARD6A-202ENST00000458121 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa46.33■■■■■ 5.01
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PARD6A-202ENST00000458121 HECW2Q9P2P5 1572 aa46.05■■■■■ 4.96
PARD6A-202ENST00000458121 ARAP3Q8WWN8 1544 aa45.93■■■■■ 4.94
PARD6A-202ENST00000458121 ATP10BO94823 1461 aa45.89■■■■■ 4.94
PARD6A-202ENST00000458121 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.89■■■■■ 4.94
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PARD6A-202ENST00000458121 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa45.44■■■■■ 4.86
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PARD6A-202ENST00000458121 EEA1Q15075 1411 aa45.41■■■■■ 4.86
PARD6A-202ENST00000458121 BCORL1Q5H9F3 1711 aa45.35■■■■■ 4.85
PARD6A-202ENST00000458121 FHOD3Q2V2M9 1422 aa45.33■■■■■ 4.85
PARD6A-202ENST00000458121 PLEKHD1A6NEE1 506 aa45.3■■■■■ 4.84
PARD6A-202ENST00000458121 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP45.25■■■■■ 4.83
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PARD6A-202ENST00000458121 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP45.23■■■■■ 4.83
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PARD6A-202ENST00000458121 TTC37Q6PGP7 1564 aa45.06■■■■■ 4.8
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PARD6A-202ENST00000458121 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP44.92■■■■■ 4.78
PARD6A-202ENST00000458121 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa44.89■■■■■ 4.78
PARD6A-202ENST00000458121 HECW1Q76N89 1606 aa44.88■■■■■ 4.78
PARD6A-202ENST00000458121 SCAPERQ9BY12 1400 aa44.85■■■■■ 4.77
PARD6A-202ENST00000458121 FMN1Q68DA7 1419 aa44.79■■■■■ 4.76
PARD6A-202ENST00000458121 HSPA2P54652 639 aa44.77■■■■■ 4.76
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