RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454996.5

TTC28-AS1-220, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 837 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa13.29□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa13.28□□□□□ -0.28
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa13.25□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CUL7Q14999 1698 aa13.22□□□□□ -0.29
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ADCY10Q96PN6 1610 aa13.18□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FAM69CQ0P6D2 419 aa13.17□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KIF13AQ9H1H9 1805 aa13.17□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP13.15□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PTPRGP23470 1445 aa13.14□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DISP1Q96F81 1524 aa13.12□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ABCC10Q5T3U5 1492 aa13.11□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TNIKQ9UKE5 1360 aa13.11□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-220ENST00000454996 IQGAP2Q13576 1575 aa13.11□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MAPKBP1O60336 1514 aa13.08□□□□□ -0.31
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa13.08□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DIP2BQ9P265 1576 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-220ENST00000454996 UGGT2Q9NYU1 1516 aa13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-220ENST00000454996 UACAQ9BZF9 1416 aa13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ABCC2Q92887 1545 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PRXQ9BXM0 1461 aa13.03□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TSPOAP1O95153 1857 aa13.02□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-220ENST00000454996 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ASXL2Q76L83 1435 aa13.02□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KIAA0556O60303 1618 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-220ENST00000454996 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-220ENST00000454996 P3H3Q8IVL6 736 aa13□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CSRNP3Q8WYN3 585 aa12.99□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PLB1Q6P1J6 1458 aa12.98□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KDM5BQ9UGL1 1544 aa12.97□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa12.96□□□□□ -0.33
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ARID3CA6NKF2 412 aa12.95□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-220ENST00000454996 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KCNH8Q96L42 1107 aa12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KDM6BO15054 1643 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GLI2P10070 1586 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EHMT2Q96KQ7 1210 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ABCA8O94911 1581 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GOLGA3Q08378 1498 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-220ENST00000454996 WDR7Q9Y4E6 1490 aa12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CHIC1Q5VXU3 224 aa12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ATP10BO94823 1461 aa12.85□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SAMD9Q5K651 1589 aa12.82□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CD109Q6YHK3 1445 aa12.81□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FHOD3Q2V2M9 1422 aa12.8□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EEA1Q15075 1411 aa12.79□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TEX14Q8IWB6 1497 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-220ENST00000454996 UBTFP17480 764 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CFAP43Q8NDM7 1665 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KIF21BO75037 1637 aa12.73□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ADGRL1O94910 1474 aa12.72□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RAPGEF3O95398 923 aa12.71□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ABCA9Q8IUA7 1624 aa12.69□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PLEKHD1A6NEE1 506 aa12.68□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ARAP3Q8WWN8 1544 aa12.67□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa12.65□□□□□ -0.38
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EFCAB5A4FU69 1503 aa12.64□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP12.62□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa12.6□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TTC37Q6PGP7 1564 aa12.6□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NEO1Q92859 1461 aa12.59□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-220ENST00000454996 AKNAQ7Z591 1439 aa12.59□□□□□ -0.39
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PHLDB1Q86UU1 1377 aa12.58□□□□□ -0.4
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa12.57□□□□□ -0.4
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FANCAO15360 1455 aa12.56□□□□□ -0.4
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FMN1Q68DA7 1419 aa12.55□□□□□ -0.4
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KIF14Q15058 1648 aa12.54□□□□□ -0.4
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PLCH2O75038 1416 aa12.54□□□□□ -0.4
TTC28-AS1-220ENST00000454996 YEATS2Q9ULM3 1422 aa12.53□□□□□ -0.4
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HECW2Q9P2P5 1572 aa12.52□□□□□ -0.4
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RICTORQ6R327 1708 aa12.52□□□□□ -0.41
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa12.52□□□□□ -0.41
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HECW1Q76N89 1606 aa12.51□□□□□ -0.41
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SCAPERQ9BY12 1400 aa12.51□□□□□ -0.41
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ADAMTSL3P82987 1691 aa12.51□□□□□ -0.41
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PLPPR3Q6T4P5 718 aa12.5□□□□□ -0.41
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PTPRMP28827 1452 aa12.49□□□□□ -0.41
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MLECQ14165 292 aa12.49□□□□□ -0.41
TTC28-AS1-220ENST00000454996 AFAP1Q8N556 730 aa12.49□□□□□ -0.41
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.8 ms