RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452979.5

HERC3-207, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HERC3, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-207ENST00000452979 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.75■□□□□ 0.91
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HERC3-207ENST00000452979 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.64■□□□□ 0.9
HERC3-207ENST00000452979 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.64■□□□□ 0.89
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HERC3-207ENST00000452979 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.62■□□□□ 0.89
HERC3-207ENST00000452979 CUL7Q14999 1698 aa20.61■□□□□ 0.89
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HERC3-207ENST00000452979 KIF27Q86VH2 1401 aa20.61■□□□□ 0.89
HERC3-207ENST00000452979 DIP2BQ9P265 1576 aa20.58■□□□□ 0.88
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HERC3-207ENST00000452979 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.43■□□□□ 0.86
HERC3-207ENST00000452979 IQGAP2Q13576 1575 aa20.39■□□□□ 0.85
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HERC3-207ENST00000452979 DISP1Q96F81 1524 aa20.33■□□□□ 0.85
HERC3-207ENST00000452979 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HERC3-207ENST00000452979 ASXL2Q76L83 1435 aa20.33■□□□□ 0.84
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HERC3-207ENST00000452979 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
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HERC3-207ENST00000452979 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
HERC3-207ENST00000452979 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.22■□□□□ 0.83
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HERC3-207ENST00000452979 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
HERC3-207ENST00000452979 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HERC3-207ENST00000452979 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.15■□□□□ 0.82
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HERC3-207ENST00000452979 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.1■□□□□ 0.81
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HERC3-207ENST00000452979 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
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HERC3-207ENST00000452979 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa19.68■□□□□ 0.74
HERC3-207ENST00000452979 PTPRMP28827 1452 aa19.67■□□□□ 0.74
HERC3-207ENST00000452979 BCORL1Q5H9F3 1711 aa19.65■□□□□ 0.74
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HERC3-207ENST00000452979 FHOD3Q2V2M9 1422 aa19.64■□□□□ 0.73
HERC3-207ENST00000452979 RICTORQ6R327 1708 aa19.62■□□□□ 0.73
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HERC3-207ENST00000452979 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP19.59■□□□□ 0.73
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HERC3-207ENST00000452979 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
HERC3-207ENST00000452979 TTC37Q6PGP7 1564 aa19.53■□□□□ 0.72
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HERC3-207ENST00000452979 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa19.47■□□□□ 0.71
HERC3-207ENST00000452979 PLCH2O75038 1416 aa19.47■□□□□ 0.71
HERC3-207ENST00000452979 POGZQ7Z3K3 1410 aa19.47■□□□□ 0.71
HERC3-207ENST00000452979 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa19.47■□□□□ 0.71
HERC3-207ENST00000452979 HECW1Q76N89 1606 aa19.46■□□□□ 0.71
HERC3-207ENST00000452979 YEATS2Q9ULM3 1422 aa19.45■□□□□ 0.7
HERC3-207ENST00000452979 SCAPERQ9BY12 1400 aa19.43■□□□□ 0.7
HERC3-207ENST00000452979 FMN1Q68DA7 1419 aa19.42■□□□□ 0.7
HERC3-207ENST00000452979 MYO5CQ9NQX4 1742 aa19.4■□□□□ 0.7
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