RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449934.6

MICA-209, Transcript of MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MICA, Length 1,386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICA-209ENST00000449934 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.05■■■□□ 2.56
MICA-209ENST00000449934 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.98■■■□□ 2.55
MICA-209ENST00000449934 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.92■■■□□ 2.54
MICA-209ENST00000449934 KIF27Q86VH2 1401 aa30.9■■■□□ 2.54
MICA-209ENST00000449934 IGF1RP08069 1367 aa30.89■■■□□ 2.54
MICA-209ENST00000449934 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.86■■■□□ 2.53
MICA-209ENST00000449934 CUL7Q14999 1698 aa30.86■■■□□ 2.53
MICA-209ENST00000449934 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.85■■■□□ 2.53
MICA-209ENST00000449934 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.84■■■□□ 2.53
MICA-209ENST00000449934 MAPKBP1O60336 1514 aa30.81■■■□□ 2.52
MICA-209ENST00000449934 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
MICA-209ENST00000449934 DIP2BQ9P265 1576 aa30.76■■■□□ 2.51
MICA-209ENST00000449934 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.71■■■□□ 2.51
MICA-209ENST00000449934 TSPOAP1O95153 1857 aa30.7■■■□□ 2.51
MICA-209ENST00000449934 PTPRGP23470 1445 aa30.67■■■□□ 2.5
MICA-209ENST00000449934 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.61■■■□□ 2.49
MICA-209ENST00000449934 KDM6BO15054 1643 aa30.61■■■□□ 2.49
MICA-209ENST00000449934 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.58■■■□□ 2.49
MICA-209ENST00000449934 IQGAP2Q13576 1575 aa30.57■■■□□ 2.48
MICA-209ENST00000449934 ABCC2Q92887 1545 aa30.51■■■□□ 2.47
MICA-209ENST00000449934 ASXL2Q76L83 1435 aa30.46■■■□□ 2.47
MICA-209ENST00000449934 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.42■■■□□ 2.46
MICA-209ENST00000449934 UACAQ9BZF9 1416 aa30.42■■■□□ 2.46
MICA-209ENST00000449934 DISP1Q96F81 1524 aa30.41■■■□□ 2.46
MICA-209ENST00000449934 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.4■■■□□ 2.46
MICA-209ENST00000449934 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.39■■■□□ 2.46
MICA-209ENST00000449934 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.39■■■□□ 2.45
MICA-209ENST00000449934 GLI2P10070 1586 aa30.34■■■□□ 2.45
MICA-209ENST00000449934 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
MICA-209ENST00000449934 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.31■■■□□ 2.44
MICA-209ENST00000449934 KIAA0556O60303 1618 aa30.28■■■□□ 2.44
MICA-209ENST00000449934 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
MICA-209ENST00000449934 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.27■■■□□ 2.44
MICA-209ENST00000449934 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
MICA-209ENST00000449934 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.2■■■□□ 2.43
MICA-209ENST00000449934 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.2■■■□□ 2.42
MICA-209ENST00000449934 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.15■■■□□ 2.42
MICA-209ENST00000449934 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
MICA-209ENST00000449934 ADGRL1O94910 1474 aa30.11■■■□□ 2.41
MICA-209ENST00000449934 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.11■■■□□ 2.41
MICA-209ENST00000449934 GOLGA3Q08378 1498 aa30.09■■■□□ 2.41
MICA-209ENST00000449934 KCNH8Q96L42 1107 aa30.06■■■□□ 2.4
MICA-209ENST00000449934 ABCA8O94911 1581 aa30■■■□□ 2.39
MICA-209ENST00000449934 CD109Q6YHK3 1445 aa29.98■■■□□ 2.39
MICA-209ENST00000449934 PRXQ9BXM0 1461 aa29.97■■■□□ 2.39
MICA-209ENST00000449934 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.95■■■□□ 2.38
MICA-209ENST00000449934 ARID3CA6NKF2 412 aa29.94■■■□□ 2.38
MICA-209ENST00000449934 P3H3Q8IVL6 736 aa29.93■■■□□ 2.38
MICA-209ENST00000449934 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
MICA-209ENST00000449934 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.9■■■□□ 2.38
MICA-209ENST00000449934 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.78■■■□□ 2.36
MICA-209ENST00000449934 ATP10BO94823 1461 aa29.77■■■□□ 2.36
MICA-209ENST00000449934 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
MICA-209ENST00000449934 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.76■■■□□ 2.35
MICA-209ENST00000449934 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
MICA-209ENST00000449934 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
MICA-209ENST00000449934 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
MICA-209ENST00000449934 KIF21BO75037 1637 aa29.73■■■□□ 2.35
MICA-209ENST00000449934 SAMD9Q5K651 1589 aa29.68■■■□□ 2.34
MICA-209ENST00000449934 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.68■■■□□ 2.34
MICA-209ENST00000449934 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.68■■■□□ 2.34
MICA-209ENST00000449934 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.66■■■□□ 2.34
MICA-209ENST00000449934 RAPGEF3O95398 923 aa29.6■■■□□ 2.33
MICA-209ENST00000449934 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.58■■■□□ 2.33
MICA-209ENST00000449934 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.55■■■□□ 2.32
MICA-209ENST00000449934 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
MICA-209ENST00000449934 NEO1Q92859 1461 aa29.52■■■□□ 2.32
MICA-209ENST00000449934 EEA1Q15075 1411 aa29.52■■■□□ 2.32
MICA-209ENST00000449934 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
MICA-209ENST00000449934 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.48■■■□□ 2.31
MICA-209ENST00000449934 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.43■■■□□ 2.3
MICA-209ENST00000449934 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.43■■■□□ 2.3
MICA-209ENST00000449934 PTPRMP28827 1452 aa29.42■■■□□ 2.3
MICA-209ENST00000449934 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.38■■■□□ 2.29
MICA-209ENST00000449934 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.37■■■□□ 2.29
MICA-209ENST00000449934 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
MICA-209ENST00000449934 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.35■■■□□ 2.29
MICA-209ENST00000449934 AKNAQ7Z591 1439 aa29.35■■■□□ 2.29
MICA-209ENST00000449934 FANCAO15360 1455 aa29.34■■■□□ 2.29
MICA-209ENST00000449934 MADDQ8WXG6 1647 aa29.33■■■□□ 2.29
MICA-209ENST00000449934 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.33■■■□□ 2.29
MICA-209ENST00000449934 RICTORQ6R327 1708 aa29.32■■■□□ 2.28
MICA-209ENST00000449934 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.32■■■□□ 2.28
MICA-209ENST00000449934 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.3■■■□□ 2.28
MICA-209ENST00000449934 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.3■■■□□ 2.28
MICA-209ENST00000449934 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
MICA-209ENST00000449934 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
MICA-209ENST00000449934 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.26■■■□□ 2.28
MICA-209ENST00000449934 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
MICA-209ENST00000449934 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
MICA-209ENST00000449934 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
MICA-209ENST00000449934 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.19■■■□□ 2.26
MICA-209ENST00000449934 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.18■■■□□ 2.26
MICA-209ENST00000449934 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.17■■■□□ 2.26
MICA-209ENST00000449934 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.17■■■□□ 2.26
MICA-209ENST00000449934 MLECQ14165 292 aa29.16■■■□□ 2.26
MICA-209ENST00000449934 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.16■■■□□ 2.26
MICA-209ENST00000449934 FBXO41Q8TF61 875 aa29.15■■■□□ 2.26
MICA-209ENST00000449934 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.14■■■□□ 2.26
MICA-209ENST00000449934 HECW1Q76N89 1606 aa29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms