RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445721.5

NUP50-211, Transcript of nucleoporin 50, humanhuman

TSL 5

Gene NUP50, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-211ENST00000445721 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.27■■■■■ 4.36
NUP50-211ENST00000445721 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.26■■■■■ 4.36
NUP50-211ENST00000445721 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.19■■■■■ 4.34
NUP50-211ENST00000445721 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.17■■■■■ 4.34
NUP50-211ENST00000445721 MAPKBP1O60336 1514 aa42.07■■■■■ 4.33
NUP50-211ENST00000445721 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.02■■■■■ 4.32
NUP50-211ENST00000445721 DIP2BQ9P265 1576 aa42■■■■■ 4.31
NUP50-211ENST00000445721 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.98■■■■■ 4.31
NUP50-211ENST00000445721 IGF1RP08069 1367 aa41.95■■■■■ 4.31
NUP50-211ENST00000445721 KIF27Q86VH2 1401 aa41.86■■■■■ 4.29
NUP50-211ENST00000445721 KDM6BO15054 1643 aa41.83■■■■■ 4.29
NUP50-211ENST00000445721 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
NUP50-211ENST00000445721 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.79■■■■■ 4.28
NUP50-211ENST00000445721 TSPOAP1O95153 1857 aa41.79■■■■■ 4.28
NUP50-211ENST00000445721 CUL7Q14999 1698 aa41.78■■■■■ 4.28
NUP50-211ENST00000445721 PTPRGP23470 1445 aa41.78■■■■■ 4.28
NUP50-211ENST00000445721 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.66■■■■■ 4.26
NUP50-211ENST00000445721 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.62■■■■■ 4.25
NUP50-211ENST00000445721 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.61■■■■■ 4.25
NUP50-211ENST00000445721 ABCC2Q92887 1545 aa41.58■■■■■ 4.25
NUP50-211ENST00000445721 ASXL2Q76L83 1435 aa41.52■■■■■ 4.24
NUP50-211ENST00000445721 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.49■■■■■ 4.23
NUP50-211ENST00000445721 IQGAP2Q13576 1575 aa41.45■■■■■ 4.23
NUP50-211ENST00000445721 GLI2P10070 1586 aa41.42■■■■■ 4.22
NUP50-211ENST00000445721 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.41■■■■■ 4.22
NUP50-211ENST00000445721 UACAQ9BZF9 1416 aa41.4■■■■■ 4.22
NUP50-211ENST00000445721 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
NUP50-211ENST00000445721 DISP1Q96F81 1524 aa41.33■■■■■ 4.21
NUP50-211ENST00000445721 ADGRL1O94910 1474 aa41.25■■■■■ 4.19
NUP50-211ENST00000445721 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
NUP50-211ENST00000445721 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
NUP50-211ENST00000445721 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.23■■■■■ 4.19
NUP50-211ENST00000445721 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
NUP50-211ENST00000445721 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.17■■■■■ 4.18
NUP50-211ENST00000445721 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.17■■■■■ 4.18
NUP50-211ENST00000445721 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.15■■■■■ 4.18
NUP50-211ENST00000445721 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.14■■■■■ 4.18
NUP50-211ENST00000445721 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
NUP50-211ENST00000445721 KIAA0556O60303 1618 aa41.07■■■■■ 4.16
NUP50-211ENST00000445721 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.99■■■■■ 4.15
NUP50-211ENST00000445721 KCNH8Q96L42 1107 aa40.9■■■■■ 4.14
NUP50-211ENST00000445721 CD109Q6YHK3 1445 aa40.86■■■■■ 4.13
NUP50-211ENST00000445721 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.86■■■■■ 4.13
NUP50-211ENST00000445721 GOLGA3Q08378 1498 aa40.81■■■■■ 4.12
NUP50-211ENST00000445721 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.79■■■■■ 4.12
NUP50-211ENST00000445721 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.77■■■■■ 4.12
NUP50-211ENST00000445721 ABCA8O94911 1581 aa40.75■■■■■ 4.11
NUP50-211ENST00000445721 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.73■■■■■ 4.11
NUP50-211ENST00000445721 ARID3CA6NKF2 412 aa40.61■■■■■ 4.09
NUP50-211ENST00000445721 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.09
NUP50-211ENST00000445721 PRXQ9BXM0 1461 aa40.57■■■■■ 4.08
NUP50-211ENST00000445721 P3H3Q8IVL6 736 aa40.54■■■■■ 4.08
NUP50-211ENST00000445721 KIF21BO75037 1637 aa40.53■■■■■ 4.08
NUP50-211ENST00000445721 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.5■■■■■ 4.07
NUP50-211ENST00000445721 ATP10BO94823 1461 aa40.47■■■■■ 4.07
NUP50-211ENST00000445721 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.36■■■■■ 4.05
NUP50-211ENST00000445721 RAPGEF3O95398 923 aa40.35■■■■■ 4.05
NUP50-211ENST00000445721 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.32■■■■■ 4.05
NUP50-211ENST00000445721 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
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NUP50-211ENST00000445721 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.23■■■■■ 4.03
NUP50-211ENST00000445721 NEO1Q92859 1461 aa40.22■■■■■ 4.03
NUP50-211ENST00000445721 FBXO41Q8TF61 875 aa40.22■■■■■ 4.03
NUP50-211ENST00000445721 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
NUP50-211ENST00000445721 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.19■■■■■ 4.02
NUP50-211ENST00000445721 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.18■■■■■ 4.02
NUP50-211ENST00000445721 SAMD9Q5K651 1589 aa40.18■■■■■ 4.02
NUP50-211ENST00000445721 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
NUP50-211ENST00000445721 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.09■■■■■ 4.01
NUP50-211ENST00000445721 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.08■■■■■ 4.01
NUP50-211ENST00000445721 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4.01
NUP50-211ENST00000445721 MADDQ8WXG6 1647 aa40.03■■■■■ 4
NUP50-211ENST00000445721 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.02■■■■■ 4
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NUP50-211ENST00000445721 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
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NUP50-211ENST00000445721 AKNAQ7Z591 1439 aa39.93■■■■□ 3.98
NUP50-211ENST00000445721 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.91■■■■□ 3.98
NUP50-211ENST00000445721 FANCAO15360 1455 aa39.88■■■■□ 3.98
NUP50-211ENST00000445721 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
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NUP50-211ENST00000445721 RICTORQ6R327 1708 aa39.86■■■■□ 3.97
NUP50-211ENST00000445721 HSPA2P54652 639 aa39.82■■■■□ 3.97
NUP50-211ENST00000445721 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.81■■■■□ 3.96
NUP50-211ENST00000445721 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.8■■■■□ 3.96
NUP50-211ENST00000445721 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.8■■■■□ 3.96
NUP50-211ENST00000445721 EEA1Q15075 1411 aa39.79■■■■□ 3.96
NUP50-211ENST00000445721 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.75■■■■□ 3.95
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NUP50-211ENST00000445721 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.73■■■■□ 3.95
NUP50-211ENST00000445721 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.72■■■■□ 3.95
NUP50-211ENST00000445721 MLECQ14165 292 aa39.72■■■■□ 3.95
NUP50-211ENST00000445721 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.69■■■■□ 3.94
NUP50-211ENST00000445721 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.67■■■■□ 3.94
NUP50-211ENST00000445721 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.65■■■■□ 3.94
NUP50-211ENST00000445721 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
NUP50-211ENST00000445721 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.63■■■■□ 3.93
NUP50-211ENST00000445721 HECW1Q76N89 1606 aa39.62■■■■□ 3.93
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