RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445003.5

SMIM25-204, Transcript of small integral membrane protein 25, humanhuman

TSL 3

Gene SMIM25, Length 539 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM25-204ENST00000445003 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
SMIM25-204ENST00000445003 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
SMIM25-204ENST00000445003 TIAM1Q13009 1591 aa20.98■□□□□ 0.95
SMIM25-204ENST00000445003 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.98■□□□□ 0.95
SMIM25-204ENST00000445003 FMN1Q68DA7 1419 aa20.97■□□□□ 0.95
SMIM25-204ENST00000445003 GRIN2BQ13224 1484 aa20.97■□□□□ 0.95
SMIM25-204ENST00000445003 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
SMIM25-204ENST00000445003 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.96■□□□□ 0.95
SMIM25-204ENST00000445003 SAMD9Q5K651 1589 aa20.94■□□□□ 0.94
SMIM25-204ENST00000445003 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
SMIM25-204ENST00000445003 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
SMIM25-204ENST00000445003 ADAMTS12P58397 1594 aa20.92■□□□□ 0.94
SMIM25-204ENST00000445003 PBRM1Q86U86 1689 aa20.92■□□□□ 0.94
SMIM25-204ENST00000445003 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.9■□□□□ 0.94
SMIM25-204ENST00000445003 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.9■□□□□ 0.94
SMIM25-204ENST00000445003 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SMIM25-204ENST00000445003 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SMIM25-204ENST00000445003 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.86■□□□□ 0.93
SMIM25-204ENST00000445003 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.86■□□□□ 0.93
SMIM25-204ENST00000445003 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.86■□□□□ 0.93
SMIM25-204ENST00000445003 ERCC6Q03468 1493 aa20.84■□□□□ 0.93
SMIM25-204ENST00000445003 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.82■□□□□ 0.92
SMIM25-204ENST00000445003 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.81■□□□□ 0.92
SMIM25-204ENST00000445003 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
SMIM25-204ENST00000445003 IQGAP2Q13576 1575 aa20.78■□□□□ 0.92
SMIM25-204ENST00000445003 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
SMIM25-204ENST00000445003 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.77■□□□□ 0.92
SMIM25-204ENST00000445003 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
SMIM25-204ENST00000445003 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.74■□□□□ 0.91
SMIM25-204ENST00000445003 P3H3Q8IVL6 736 aa20.72■□□□□ 0.91
SMIM25-204ENST00000445003 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
SMIM25-204ENST00000445003 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.71■□□□□ 0.91
SMIM25-204ENST00000445003 GRIN2AQ12879 1464 aa20.69■□□□□ 0.9
SMIM25-204ENST00000445003 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.68■□□□□ 0.9
SMIM25-204ENST00000445003 SYNJ2O15056 1496 aa20.65■□□□□ 0.9
SMIM25-204ENST00000445003 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.63■□□□□ 0.89
SMIM25-204ENST00000445003 HECW1Q76N89 1606 aa20.63■□□□□ 0.89
SMIM25-204ENST00000445003 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.61■□□□□ 0.89
SMIM25-204ENST00000445003 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SMIM25-204ENST00000445003 ARHGEF11O15085 1522 aa20.58■□□□□ 0.88
SMIM25-204ENST00000445003 NUP160Q12769 1436 aa20.57■□□□□ 0.88
SMIM25-204ENST00000445003 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.57■□□□□ 0.88
SMIM25-204ENST00000445003 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SMIM25-204ENST00000445003 KIAA0556O60303 1618 aa20.56■□□□□ 0.88
SMIM25-204ENST00000445003 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.55■□□□□ 0.88
SMIM25-204ENST00000445003 DISP1Q96F81 1524 aa20.55■□□□□ 0.88
SMIM25-204ENST00000445003 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SMIM25-204ENST00000445003 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SMIM25-204ENST00000445003 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.53■□□□□ 0.88
SMIM25-204ENST00000445003 NCOA2Q15596 1464 aa20.52■□□□□ 0.88
SMIM25-204ENST00000445003 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SMIM25-204ENST00000445003 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.5■□□□□ 0.87
SMIM25-204ENST00000445003 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.48■□□□□ 0.87
SMIM25-204ENST00000445003 CEP170Q5SW79 1584 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM25-204ENST00000445003 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.47■□□□□ 0.87
SMIM25-204ENST00000445003 MIA2Q96PC5 1412 aa20.46■□□□□ 0.87
SMIM25-204ENST00000445003 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SMIM25-204ENST00000445003 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SMIM25-204ENST00000445003 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SMIM25-204ENST00000445003 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SMIM25-204ENST00000445003 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.42■□□□□ 0.86
SMIM25-204ENST00000445003 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.41■□□□□ 0.86
SMIM25-204ENST00000445003 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SMIM25-204ENST00000445003 HFM1A2PYH4 1435 aa20.39■□□□□ 0.85
SMIM25-204ENST00000445003 AKNAQ7Z591 1439 aa20.39■□□□□ 0.85
SMIM25-204ENST00000445003 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SMIM25-204ENST00000445003 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.38■□□□□ 0.85
SMIM25-204ENST00000445003 JPH4Q96JJ6 628 aa20.37■□□□□ 0.85
SMIM25-204ENST00000445003 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.36■□□□□ 0.85
SMIM25-204ENST00000445003 ITGAEP38570 1179 aa20.36■□□□□ 0.85
SMIM25-204ENST00000445003 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SMIM25-204ENST00000445003 MAPKBP1O60336 1514 aa20.32■□□□□ 0.84
SMIM25-204ENST00000445003 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SMIM25-204ENST00000445003 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SMIM25-204ENST00000445003 PTPRKQ15262 1439 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM25-204ENST00000445003 ABCA8O94911 1581 aa20.27■□□□□ 0.84
SMIM25-204ENST00000445003 NAIPQ13075 1403 aa20.27■□□□□ 0.83
SMIM25-204ENST00000445003 UACAQ9BZF9 1416 aa20.27■□□□□ 0.83
SMIM25-204ENST00000445003 FBLN2P98095 1184 aa20.26■□□□□ 0.83
SMIM25-204ENST00000445003 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.24■□□□□ 0.83
SMIM25-204ENST00000445003 ROCK1Q13464 1354 aa20.23■□□□□ 0.83
SMIM25-204ENST00000445003 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.21■□□□□ 0.83
SMIM25-204ENST00000445003 SHROOM2Q13796 1616 aa20.19■□□□□ 0.82
SMIM25-204ENST00000445003 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.19■□□□□ 0.82
SMIM25-204ENST00000445003 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SMIM25-204ENST00000445003 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.16■□□□□ 0.82
SMIM25-204ENST00000445003 PTPRGP23470 1445 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM25-204ENST00000445003 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SMIM25-204ENST00000445003 ATP10BO94823 1461 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM25-204ENST00000445003 DAPK1P53355 1430 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM25-204ENST00000445003 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SMIM25-204ENST00000445003 CHD1O14646 1710 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM25-204ENST00000445003 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM25-204ENST00000445003 ABCC5O15440 1437 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM25-204ENST00000445003 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM25-204ENST00000445003 KIF14Q15058 1648 aa20.07■□□□□ 0.8
SMIM25-204ENST00000445003 ADGRL2O95490 1459 aa20.06■□□□□ 0.8
SMIM25-204ENST00000445003 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SMIM25-204ENST00000445003 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.05■□□□□ 0.8
SMIM25-204ENST00000445003 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.04■□□□□ 0.8
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