RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419364.1

SIX3-AS1-201, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 844 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.01■■□□□ 1.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 JPH4Q96JJ6 628 aa23■■□□□ 1.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SHROOM2Q13796 1616 aa23■■□□□ 1.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CUL7Q14999 1698 aa22.96■■□□□ 1.27
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.92■■□□□ 1.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.92■■□□□ 1.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.89■■□□□ 1.26
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.73■■□□□ 1.23
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.68■■□□□ 1.22
SIX3-AS1-201ENST00000419364 IQGAP2Q13576 1575 aa22.67■■□□□ 1.22
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PTPRGP23470 1445 aa22.65■■□□□ 1.22
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.63■■□□□ 1.21
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.6■■□□□ 1.21
SIX3-AS1-201ENST00000419364 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.56■■□□□ 1.2
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PRXQ9BXM0 1461 aa22.55■■□□□ 1.2
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DISP1Q96F81 1524 aa22.55■■□□□ 1.2
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MAPKBP1O60336 1514 aa22.54■■□□□ 1.2
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.52■■□□□ 1.2
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.51■■□□□ 1.19
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.49■■□□□ 1.19
SIX3-AS1-201ENST00000419364 UACAQ9BZF9 1416 aa22.47■■□□□ 1.19
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.46■■□□□ 1.19
SIX3-AS1-201ENST00000419364 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.46■■□□□ 1.19
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ABCC2Q92887 1545 aa22.46■■□□□ 1.19
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KIAA0556O60303 1618 aa22.45■■□□□ 1.18
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.44■■□□□ 1.18
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EEA1Q15075 1411 aa22.43■■□□□ 1.18
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GOLGA3Q08378 1498 aa22.42■■□□□ 1.18
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DIP2BQ9P265 1576 aa22.42■■□□□ 1.18
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ASXL2Q76L83 1435 aa22.37■■□□□ 1.17
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.36■■□□□ 1.17
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.34■■□□□ 1.17
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SIX3-AS1-201ENST00000419364 P3H3Q8IVL6 736 aa22.27■■□□□ 1.16
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ABCA8O94911 1581 aa22.25■■□□□ 1.15
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GLI2P10070 1586 aa22.25■■□□□ 1.15
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TSPOAP1O95153 1857 aa22.2■■□□□ 1.14
SIX3-AS1-201ENST00000419364 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.19■■□□□ 1.14
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SAMD9Q5K651 1589 aa22.17■■□□□ 1.14
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KDM6BO15054 1643 aa22.17■■□□□ 1.14
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KIF21BO75037 1637 aa22.17■■□□□ 1.14
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARID3CA6NKF2 412 aa22.11■■□□□ 1.13
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KCNH8Q96L42 1107 aa22.11■■□□□ 1.13
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.1■■□□□ 1.13
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ATP10BO94823 1461 aa22.09■■□□□ 1.13
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.09■■□□□ 1.13
SIX3-AS1-201ENST00000419364 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.08■■□□□ 1.13
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.07■■□□□ 1.12
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.05■■□□□ 1.12
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CD109Q6YHK3 1445 aa22.05■■□□□ 1.12
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.04■■□□□ 1.12
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22■■□□□ 1.11
SIX3-AS1-201ENST00000419364 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.98■■□□□ 1.11
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.92■■□□□ 1.1
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.88■■□□□ 1.09
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.88■■□□□ 1.09
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FMN1Q68DA7 1419 aa21.88■■□□□ 1.09
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.88■■□□□ 1.09
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.85■■□□□ 1.09
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.81■■□□□ 1.08
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NEO1Q92859 1461 aa21.78■■□□□ 1.08
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HECW1Q76N89 1606 aa21.77■■□□□ 1.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ADGRL1O94910 1474 aa21.74■■□□□ 1.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RAPGEF3O95398 923 aa21.72■■□□□ 1.07
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FANCAO15360 1455 aa21.68■■□□□ 1.06
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AKNAQ7Z591 1439 aa21.67■■□□□ 1.06
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.66■■□□□ 1.06
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CLIP1P30622 1438 aa21.65■■□□□ 1.06
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.65■■□□□ 1.06
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.65■■□□□ 1.06
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PLCH2O75038 1416 aa21.63■■□□□ 1.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FOXD1Q16676 465 aa21.63■■□□□ 1.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.6■■□□□ 1.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.6■■□□□ 1.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.59■■□□□ 1.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KIF14Q15058 1648 aa21.58■■□□□ 1.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.57■■□□□ 1.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.55■■□□□ 1.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.55■■□□□ 1.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RICTORQ6R327 1708 aa21.53■■□□□ 1.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
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