RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409483.5

PTPRN2-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-205ENST00000409483 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.58■■□□□ 1.2
PTPRN2-205ENST00000409483 MRS2Q9HD23 443 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRN2-205ENST00000409483 TSPY4P0CV99 314 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRN2-205ENST00000409483 TSPY10P0CW01 314 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRN2-205ENST00000409483 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRN2-205ENST00000409483 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRN2-205ENST00000409483 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRN2-205ENST00000409483 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
PTPRN2-205ENST00000409483 KCNH8Q96L42 1107 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRN2-205ENST00000409483 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRN2-205ENST00000409483 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2-205ENST00000409483 TMC1Q8TDI8 760 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRN2-205ENST00000409483 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
PTPRN2-205ENST00000409483 RGL3Q3MIN7 710 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRN2-205ENST00000409483 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRN2-205ENST00000409483 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRN2-205ENST00000409483 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRN2-205ENST00000409483 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRN2-205ENST00000409483 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRN2-205ENST00000409483 FOXD1Q16676 465 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRN2-205ENST00000409483 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRN2-205ENST00000409483 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRN2-205ENST00000409483 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRN2-205ENST00000409483 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRN2-205ENST00000409483 SMARCA2P51531 1590 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRN2-205ENST00000409483 SLC24A1O60721 1099 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRN2-205ENST00000409483 SMARCA4P51532 1647 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRN2-205ENST00000409483 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRN2-205ENST00000409483 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRN2-205ENST00000409483 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRN2-205ENST00000409483 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
PTPRN2-205ENST00000409483 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPRN2-205ENST00000409483 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRN2-205ENST00000409483 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRN2-205ENST00000409483 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRN2-205ENST00000409483 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRN2-205ENST00000409483 NEFMP07197 916 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRN2-205ENST00000409483 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
PTPRN2-205ENST00000409483 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRN2-205ENST00000409483 ERCC6Q03468 1493 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN2-205ENST00000409483 NBR1Q14596 966 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRN2-205ENST00000409483 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRN2-205ENST00000409483 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRN2-205ENST00000409483 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PTPRN2-205ENST00000409483 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
PTPRN2-205ENST00000409483 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRN2-205ENST00000409483 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRN2-205ENST00000409483 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRN2-205ENST00000409483 PKD2Q13563 968 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRN2-205ENST00000409483 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRN2-205ENST00000409483 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRN2-205ENST00000409483 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRN2-205ENST00000409483 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRN2-205ENST00000409483 FMN1Q68DA7 1419 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN2-205ENST00000409483 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRN2-205ENST00000409483 NEUROD2Q15784 382 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRN2-205ENST00000409483 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRN2-205ENST00000409483 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRN2-205ENST00000409483 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRN2-205ENST00000409483 IGF1RP08069 1367 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPRN2-205ENST00000409483 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2-205ENST00000409483 PLEKHG5O94827 1062 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2-205ENST00000409483 CCER2I3L3R5 266 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRN2-205ENST00000409483 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN2-205ENST00000409483 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRN2-205ENST00000409483 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.084e-7■■■■■ 27.1
PTPRN2-205ENST00000409483 NUP155O75694 1391 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN2-205ENST00000409483 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN2-205ENST00000409483 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PTPRN2-205ENST00000409483 ARXQ96QS3 562 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRN2-205ENST00000409483 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRN2-205ENST00000409483 KIF21BO75037 1637 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRN2-205ENST00000409483 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PTPRN2-205ENST00000409483 SYNJ1O43426 1573 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRN2-205ENST00000409483 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PTPRN2-205ENST00000409483 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
PTPRN2-205ENST00000409483 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRN2-205ENST00000409483 JPH4Q96JJ6 628 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRN2-205ENST00000409483 CDCA8Q53HL2 280 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRN2-205ENST00000409483 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.7■■□□□ 1.06
PTPRN2-205ENST00000409483 ARAP1Q96P48 1450 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRN2-205ENST00000409483 RGS3P49796 1198 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRN2-205ENST00000409483 TMF1P82094 1093 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRN2-205ENST00000409483 GGT6Q6P531 493 aa21.69■■□□□ 1.06
PTPRN2-205ENST00000409483 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRN2-205ENST00000409483 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRN2-205ENST00000409483 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRN2-205ENST00000409483 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRN2-205ENST00000409483 NCAPD3P42695 1498 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRN2-205ENST00000409483 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRN2-205ENST00000409483 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRN2-205ENST00000409483 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PTPRN2-205ENST00000409483 MLECQ14165 292 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRN2-205ENST00000409483 CFAP53Q96M91 514 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRN2-205ENST00000409483 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPRN2-205ENST00000409483 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2-205ENST00000409483 C14orf37Q86TY3 774 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2-205ENST00000409483 POGKQ9P215 609 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRN2-205ENST00000409483 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
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