RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
LRRTM4-202ENST00000409093 IFT140Q96RY7 1462 aa15.37■□□□□ 0.05
LRRTM4-202ENST00000409093 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.34■□□□□ 0.05
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
LRRTM4-202ENST00000409093 GRIN2BQ13224 1484 aa15.3■□□□□ 0.04
LRRTM4-202ENST00000409093 ADAMTS12P58397 1594 aa15.29■□□□□ 0.04
LRRTM4-202ENST00000409093 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.29■□□□□ 0.04
LRRTM4-202ENST00000409093 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.28■□□□□ 0.04
LRRTM4-202ENST00000409093 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
LRRTM4-202ENST00000409093 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.23■□□□□ 0.03
LRRTM4-202ENST00000409093 P3H3Q8IVL6 736 aa15.23■□□□□ 0.03
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LRRTM4-202ENST00000409093 SAMD9Q5K651 1589 aa15.21■□□□□ 0.02
LRRTM4-202ENST00000409093 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.2■□□□□ 0.02
LRRTM4-202ENST00000409093 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
LRRTM4-202ENST00000409093 TIAM1Q13009 1591 aa15.19■□□□□ 0.02
LRRTM4-202ENST00000409093 MAP3K1Q13233 1512 aa15.18■□□□□ 0.02
LRRTM4-202ENST00000409093 IQGAP2Q13576 1575 aa15.17■□□□□ 0.02
LRRTM4-202ENST00000409093 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
LRRTM4-202ENST00000409093 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.16■□□□□ 0.02
LRRTM4-202ENST00000409093 FYCO1Q9BQS8 1478 aa15.16■□□□□ 0.02
LRRTM4-202ENST00000409093 FMN1Q68DA7 1419 aa15.16■□□□□ 0.02
LRRTM4-202ENST00000409093 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
LRRTM4-202ENST00000409093 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa15.14■□□□□ 0.01
LRRTM4-202ENST00000409093 GRIN2AQ12879 1464 aa15.13■□□□□ 0.01
LRRTM4-202ENST00000409093 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
LRRTM4-202ENST00000409093 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
LRRTM4-202ENST00000409093 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.11■□□□□ 0.01
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LRRTM4-202ENST00000409093 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC24A1O60721 1099 aa15.09■□□□□ 0.01
LRRTM4-202ENST00000409093 SYNJ2O15056 1496 aa15.09■□□□□ 0.01
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LRRTM4-202ENST00000409093 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
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LRRTM4-202ENST00000409093 CEP170Q5SW79 1584 aa15.03■□□□□ -0
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LRRTM4-202ENST00000409093 KIAA0556O60303 1618 aa15.02□□□□□ -0.01
LRRTM4-202ENST00000409093 HECW1Q76N89 1606 aa15□□□□□ -0.01
LRRTM4-202ENST00000409093 DISP1Q96F81 1524 aa14.99□□□□□ -0.01
LRRTM4-202ENST00000409093 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.98□□□□□ -0.01
LRRTM4-202ENST00000409093 NUP160Q12769 1436 aa14.98□□□□□ -0.01
LRRTM4-202ENST00000409093 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRTM4-202ENST00000409093 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.97□□□□□ -0.01
LRRTM4-202ENST00000409093 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.94□□□□□ -0.02
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LRRTM4-202ENST00000409093 CHD1O14646 1710 aa14.92□□□□□ -0.02
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LRRTM4-202ENST00000409093 JPH4Q96JJ6 628 aa14.89□□□□□ -0.03
LRRTM4-202ENST00000409093 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.89□□□□□ -0.03
LRRTM4-202ENST00000409093 NCOA2Q15596 1464 aa14.88□□□□□ -0.03
LRRTM4-202ENST00000409093 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.87□□□□□ -0.03
LRRTM4-202ENST00000409093 ARID3CA6NKF2 412 aa14.85□□□□□ -0.03
LRRTM4-202ENST00000409093 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
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LRRTM4-202ENST00000409093 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.84□□□□□ -0.03
LRRTM4-202ENST00000409093 ARHGEF11O15085 1522 aa14.83□□□□□ -0.03
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LRRTM4-202ENST00000409093 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.79□□□□□ -0.04
LRRTM4-202ENST00000409093 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LRRTM4-202ENST00000409093 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.78□□□□□ -0.04
LRRTM4-202ENST00000409093 SETD5Q9C0A6 1442 aa14.77□□□□□ -0.04
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LRRTM4-202ENST00000409093 CLSPNQ9HAW4 1339 aa14.75□□□□□ -0.05
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LRRTM4-202ENST00000409093 MIA2Q96PC5 1412 aa14.72□□□□□ -0.05
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LRRTM4-202ENST00000409093 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.69□□□□□ -0.06
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LRRTM4-202ENST00000409093 ATP10BO94823 1461 aa14.67□□□□□ -0.06
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LRRTM4-202ENST00000409093 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRTM4-202ENST00000409093 UACAQ9BZF9 1416 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRTM4-202ENST00000409093 NAIPQ13075 1403 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRTM4-202ENST00000409093 GCC2Q8IWJ2 1684 aa14.62□□□□□ -0.07
LRRTM4-202ENST00000409093 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LRRTM4-202ENST00000409093 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
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LRRTM4-202ENST00000409093 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.6□□□□□ -0.07
LRRTM4-202ENST00000409093 ABCC2Q92887 1545 aa14.59□□□□□ -0.07
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