RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CTDSP2-201ENST00000398073 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDSP2-201ENST00000398073 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDSP2-201ENST00000398073 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
CTDSP2-201ENST00000398073 TSPY4P0CV99 314 aa21.98■■□□□ 1.11
CTDSP2-201ENST00000398073 TSPY10P0CW01 314 aa21.98■■□□□ 1.11
CTDSP2-201ENST00000398073 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDSP2-201ENST00000398073 NBR1Q14596 966 aa21.97■■□□□ 1.11
CTDSP2-201ENST00000398073 WIZO95785 1651 aa21.94■■□□□ 1.1
CTDSP2-201ENST00000398073 NEFMP07197 916 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDSP2-201ENST00000398073 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CTDSP2-201ENST00000398073 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDSP2-201ENST00000398073 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CTDSP2-201ENST00000398073 CCER2I3L3R5 266 aa21.91■■□□□ 1.1
CTDSP2-201ENST00000398073 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CTDSP2-201ENST00000398073 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.89■■□□□ 1.09
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDSP2-201ENST00000398073 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CTDSP2-201ENST00000398073 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDSP2-201ENST00000398073 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
CTDSP2-201ENST00000398073 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
CTDSP2-201ENST00000398073 CUX2O14529 1486 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDSP2-201ENST00000398073 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDSP2-201ENST00000398073 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CTDSP2-201ENST00000398073 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
CTDSP2-201ENST00000398073 BCL11AQ9H165 835 aa21.72■■□□□ 1.07
CTDSP2-201ENST00000398073 SMARCA2P51531 1590 aa21.72■■□□□ 1.07
CTDSP2-201ENST00000398073 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.72■■□□□ 1.07
CTDSP2-201ENST00000398073 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CTDSP2-201ENST00000398073 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.71■■□□□ 1.07
CTDSP2-201ENST00000398073 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.7■■□□□ 1.06
CTDSP2-201ENST00000398073 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CTDSP2-201ENST00000398073 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.7■■□□□ 1.06
CTDSP2-201ENST00000398073 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
CTDSP2-201ENST00000398073 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.68■■□□□ 1.06
CTDSP2-201ENST00000398073 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CTDSP2-201ENST00000398073 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CTDSP2-201ENST00000398073 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.66■■□□□ 1.06
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CTDSP2-201ENST00000398073 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.64■■□□□ 1.06
CTDSP2-201ENST00000398073 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.64■■□□□ 1.06
CTDSP2-201ENST00000398073 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.64■■□□□ 1.05
CTDSP2-201ENST00000398073 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CTDSP2-201ENST00000398073 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CTDSP2-201ENST00000398073 RGL3Q3MIN7 710 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDSP2-201ENST00000398073 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CTDSP2-201ENST00000398073 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.61■■□□□ 1.05
CTDSP2-201ENST00000398073 SMARCA4P51532 1647 aa21.59■■□□□ 1.05
CTDSP2-201ENST00000398073 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CTDSP2-201ENST00000398073 CDCA8Q53HL2 280 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDSP2-201ENST00000398073 FMN1Q68DA7 1419 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDSP2-201ENST00000398073 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDSP2-201ENST00000398073 BECN1Q14457 450 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC24A1O60721 1099 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDSP2-201ENST00000398073 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDSP2-201ENST00000398073 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDSP2-201ENST00000398073 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
CTDSP2-201ENST00000398073 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDSP2-201ENST00000398073 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CTDSP2-201ENST00000398073 KCNH8Q96L42 1107 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDSP2-201ENST00000398073 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDSP2-201ENST00000398073 ARXQ96QS3 562 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDSP2-201ENST00000398073 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CTDSP2-201ENST00000398073 FOXD1Q16676 465 aa21.39■■□□□ 1.01
CTDSP2-201ENST00000398073 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDSP2-201ENST00000398073 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDSP2-201ENST00000398073 CFAP53Q96M91 514 aa21.37■■□□□ 1.01
CTDSP2-201ENST00000398073 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CTDSP2-201ENST00000398073 TMF1P82094 1093 aa21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2-201ENST00000398073 PKD2Q13563 968 aa21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2-201ENST00000398073 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2-201ENST00000398073 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2-201ENST00000398073 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2-201ENST00000398073 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.33■■□□□ 1.01
CTDSP2-201ENST00000398073 RGS3P49796 1198 aa21.33■■□□□ 1.01
CTDSP2-201ENST00000398073 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.32■■□□□ 1
CTDSP2-201ENST00000398073 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CTDSP2-201ENST00000398073 NUDCQ9Y266 331 aa21.29■■□□□ 1
CTDSP2-201ENST00000398073 RALBP1Q15311 655 aa21.29■■□□□ 1
CTDSP2-201ENST00000398073 KIF21BO75037 1637 aa21.28■■□□□ 1
CTDSP2-201ENST00000398073 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
CTDSP2-201ENST00000398073 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.26■□□□□ 0.99
CTDSP2-201ENST00000398073 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CTDSP2-201ENST00000398073 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CTDSP2-201ENST00000398073 NEUROD2Q15784 382 aa21.24■□□□□ 0.99
CTDSP2-201ENST00000398073 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.21■□□□□ 0.99
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CTDSP2-201ENST00000398073 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.21■□□□□ 0.99
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
CTDSP2-201ENST00000398073 NUP155O75694 1391 aa21.2■□□□□ 0.98
CTDSP2-201ENST00000398073 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.2■□□□□ 0.98
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.2■□□□□ 0.98
CTDSP2-201ENST00000398073 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
CTDSP2-201ENST00000398073 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CTDSP2-201ENST00000398073 MS4A1P11836 297 aa21.17■□□□□ 0.98
CTDSP2-201ENST00000398073 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
CTDSP2-201ENST00000398073 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.15■□□□□ 0.98
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CTDSP2-201ENST00000398073 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.15■□□□□ 0.98
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