RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394725.2

SIAH1-203, Transcript of siah E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIAH1, Length 2,147 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH1-203ENST00000394725 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.46■■■■■ 4.39
SIAH1-203ENST00000394725 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.45■■■■■ 4.39
SIAH1-203ENST00000394725 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.43■■■■■ 4.38
SIAH1-203ENST00000394725 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.42■■■■■ 4.38
SIAH1-203ENST00000394725 TIAM1Q13009 1591 aa42.41■■■■■ 4.38
SIAH1-203ENST00000394725 MAP3K1Q13233 1512 aa42.38■■■■■ 4.38
SIAH1-203ENST00000394725 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
SIAH1-203ENST00000394725 WDR62O43379 1518 aa42.35■■■■■ 4.37
SIAH1-203ENST00000394725 PBRM1Q86U86 1689 aa42.35■■■■■ 4.37
SIAH1-203ENST00000394725 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
SIAH1-203ENST00000394725 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
SIAH1-203ENST00000394725 IFT140Q96RY7 1462 aa42.26■■■■■ 4.36
SIAH1-203ENST00000394725 ERCC6Q03468 1493 aa42.26■■■■■ 4.36
SIAH1-203ENST00000394725 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.25■■■■■ 4.35
SIAH1-203ENST00000394725 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.23■■■■■ 4.35
SIAH1-203ENST00000394725 GRIN2BQ13224 1484 aa42.2■■■■■ 4.35
SIAH1-203ENST00000394725 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.2■■■■■ 4.35
SIAH1-203ENST00000394725 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.2■■■■■ 4.35
SIAH1-203ENST00000394725 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.2■■■■■ 4.35
SIAH1-203ENST00000394725 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.18■■■■■ 4.34
SIAH1-203ENST00000394725 ADAMTS12P58397 1594 aa42.17■■■■■ 4.34
SIAH1-203ENST00000394725 SAMD9Q5K651 1589 aa42.17■■■■■ 4.34
SIAH1-203ENST00000394725 FMN1Q68DA7 1419 aa42.15■■■■■ 4.34
SIAH1-203ENST00000394725 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.06■■■■■ 4.32
SIAH1-203ENST00000394725 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.04■■■■■ 4.32
SIAH1-203ENST00000394725 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
SIAH1-203ENST00000394725 ITGAEP38570 1179 aa41.99■■■■■ 4.31
SIAH1-203ENST00000394725 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
SIAH1-203ENST00000394725 IQGAP2Q13576 1575 aa41.95■■■■■ 4.31
SIAH1-203ENST00000394725 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
SIAH1-203ENST00000394725 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.82■■■■■ 4.29
SIAH1-203ENST00000394725 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
SIAH1-203ENST00000394725 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.76■■■■■ 4.28
SIAH1-203ENST00000394725 GRIN2AQ12879 1464 aa41.74■■■■■ 4.27
SIAH1-203ENST00000394725 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.71■■■■■ 4.27
SIAH1-203ENST00000394725 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.7■■■■■ 4.27
SIAH1-203ENST00000394725 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
SIAH1-203ENST00000394725 CLSPNQ9HAW4 1339 aa41.65■■■■■ 4.26
SIAH1-203ENST00000394725 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.62■■■■■ 4.25
SIAH1-203ENST00000394725 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
SIAH1-203ENST00000394725 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.57■■■■■ 4.25
SIAH1-203ENST00000394725 SYNJ2O15056 1496 aa41.57■■■■■ 4.25
SIAH1-203ENST00000394725 HECW1Q76N89 1606 aa41.57■■■■■ 4.25
SIAH1-203ENST00000394725 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.56■■■■■ 4.24
SIAH1-203ENST00000394725 FBLN2P98095 1184 aa41.55■■■■■ 4.24
SIAH1-203ENST00000394725 DISP1Q96F81 1524 aa41.55■■■■■ 4.24
SIAH1-203ENST00000394725 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.54■■■■■ 4.24
SIAH1-203ENST00000394725 NCOA2Q15596 1464 aa41.54■■■■■ 4.24
SIAH1-203ENST00000394725 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.54■■■■■ 4.24
SIAH1-203ENST00000394725 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.54■■■■■ 4.24
SIAH1-203ENST00000394725 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.53■■■■■ 4.24
SIAH1-203ENST00000394725 KIAA0556O60303 1618 aa41.51■■■■■ 4.24
SIAH1-203ENST00000394725 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
SIAH1-203ENST00000394725 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
SIAH1-203ENST00000394725 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
SIAH1-203ENST00000394725 CEP170Q5SW79 1584 aa41.48■■■■■ 4.23
SIAH1-203ENST00000394725 ARID3CA6NKF2 412 aa41.45■■■■■ 4.23
SIAH1-203ENST00000394725 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
SIAH1-203ENST00000394725 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.43■■■■■ 4.22
SIAH1-203ENST00000394725 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
SIAH1-203ENST00000394725 ARHGEF11O15085 1522 aa41.36■■■■■ 4.21
SIAH1-203ENST00000394725 NUP160Q12769 1436 aa41.33■■■■■ 4.21
SIAH1-203ENST00000394725 MAPKBP1O60336 1514 aa41.27■■■■■ 4.2
SIAH1-203ENST00000394725 PTPRKQ15262 1439 aa41.27■■■■■ 4.2
SIAH1-203ENST00000394725 JPH4Q96JJ6 628 aa41.24■■■■■ 4.19
SIAH1-203ENST00000394725 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
SIAH1-203ENST00000394725 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.23■■■■■ 4.19
SIAH1-203ENST00000394725 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.23■■■■■ 4.19
SIAH1-203ENST00000394725 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.14■■■■■ 4.18
SIAH1-203ENST00000394725 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.11■■■■■ 4.17
SIAH1-203ENST00000394725 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
SIAH1-203ENST00000394725 HFM1A2PYH4 1435 aa41.1■■■■■ 4.17
SIAH1-203ENST00000394725 MIA2Q96PC5 1412 aa41.03■■■■■ 4.16
SIAH1-203ENST00000394725 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
SIAH1-203ENST00000394725 NAIPQ13075 1403 aa41.01■■■■■ 4.16
SIAH1-203ENST00000394725 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.98■■■■■ 4.15
SIAH1-203ENST00000394725 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.96■■■■■ 4.15
SIAH1-203ENST00000394725 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
SIAH1-203ENST00000394725 NEUROD1Q13562 356 aa40.93■■■■■ 4.14
SIAH1-203ENST00000394725 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.91■■■■■ 4.14
SIAH1-203ENST00000394725 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
SIAH1-203ENST00000394725 CHD1O14646 1710 aa40.86■■■■■ 4.13
SIAH1-203ENST00000394725 UACAQ9BZF9 1416 aa40.86■■■■■ 4.13
SIAH1-203ENST00000394725 ABCA8O94911 1581 aa40.82■■■■■ 4.13
SIAH1-203ENST00000394725 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
SIAH1-203ENST00000394725 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.74■■■■■ 4.11
SIAH1-203ENST00000394725 AKNAQ7Z591 1439 aa40.74■■■■■ 4.11
SIAH1-203ENST00000394725 KIF14Q15058 1648 aa40.73■■■■■ 4.11
SIAH1-203ENST00000394725 DAPK1P53355 1430 aa40.72■■■■■ 4.11
SIAH1-203ENST00000394725 ATP10BO94823 1461 aa40.71■■■■■ 4.11
SIAH1-203ENST00000394725 PTPRGP23470 1445 aa40.7■■■■■ 4.11
SIAH1-203ENST00000394725 MIER1Q8N108 512 aa40.69■■■■■ 4.1
SIAH1-203ENST00000394725 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.68■■■■■ 4.1
SIAH1-203ENST00000394725 ABCC5O15440 1437 aa40.68■■■■■ 4.1
SIAH1-203ENST00000394725 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40.67■■■■■ 4.1
SIAH1-203ENST00000394725 KDM6BO15054 1643 aa40.67■■■■■ 4.1
SIAH1-203ENST00000394725 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
SIAH1-203ENST00000394725 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
SIAH1-203ENST00000394725 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.66■■■■■ 4.1
SIAH1-203ENST00000394725 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms