RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393119.6

MKS1-202, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MKS1, Length 2,397 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-202ENST00000393119 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
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MKS1-202ENST00000393119 GRIN2BQ13224 1484 aa23.11■■□□□ 1.29
MKS1-202ENST00000393119 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.09■■□□□ 1.29
MKS1-202ENST00000393119 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
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MKS1-202ENST00000393119 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.06■■□□□ 1.28
MKS1-202ENST00000393119 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.05■■□□□ 1.28
MKS1-202ENST00000393119 FBLN2P98095 1184 aa23.04■■□□□ 1.28
MKS1-202ENST00000393119 ADAMTS12P58397 1594 aa23.03■■□□□ 1.28
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MKS1-202ENST00000393119 SAMD9Q5K651 1589 aa22.82■■□□□ 1.24
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MKS1-202ENST00000393119 CEP170Q5SW79 1584 aa22.77■■□□□ 1.24
MKS1-202ENST00000393119 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.77■■□□□ 1.24
MKS1-202ENST00000393119 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.75■■□□□ 1.23
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MKS1-202ENST00000393119 NUP160Q12769 1436 aa22.65■■□□□ 1.22
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MKS1-202ENST00000393119 KIAA0556O60303 1618 aa22.6■■□□□ 1.21
MKS1-202ENST00000393119 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.58■■□□□ 1.21
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MKS1-202ENST00000393119 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
MKS1-202ENST00000393119 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.56■■□□□ 1.2
MKS1-202ENST00000393119 CHD1O14646 1710 aa22.52■■□□□ 1.2
MKS1-202ENST00000393119 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.52■■□□□ 1.19
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MKS1-202ENST00000393119 PTPRKQ15262 1439 aa22.31■■□□□ 1.16
MKS1-202ENST00000393119 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
MKS1-202ENST00000393119 ARHGEF11O15085 1522 aa22.29■■□□□ 1.16
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MKS1-202ENST00000393119 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
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MKS1-202ENST00000393119 ABCA8O94911 1581 aa22.26■■□□□ 1.15
MKS1-202ENST00000393119 ATP10BO94823 1461 aa22.25■■□□□ 1.15
MKS1-202ENST00000393119 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
MKS1-202ENST00000393119 SHROOM2Q13796 1616 aa22.22■■□□□ 1.15
MKS1-202ENST00000393119 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.21■■□□□ 1.15
MKS1-202ENST00000393119 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.21■■□□□ 1.15
MKS1-202ENST00000393119 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.19■■□□□ 1.14
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MKS1-202ENST00000393119 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
MKS1-202ENST00000393119 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.18■■□□□ 1.14
MKS1-202ENST00000393119 KIF14Q15058 1648 aa22.18■■□□□ 1.14
MKS1-202ENST00000393119 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.18■■□□□ 1.14
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MKS1-202ENST00000393119 UACAQ9BZF9 1416 aa22.15■■□□□ 1.14
MKS1-202ENST00000393119 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
MKS1-202ENST00000393119 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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MKS1-202ENST00000393119 OSCARQ8IYS5 282 aa22.07■■□□□ 1.12
MKS1-202ENST00000393119 KCNH8Q96L42 1107 aa22.07■■□□□ 1.12
MKS1-202ENST00000393119 NAIPQ13075 1403 aa22.05■■□□□ 1.12
MKS1-202ENST00000393119 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.04■■□□□ 1.12
MKS1-202ENST00000393119 HFM1A2PYH4 1435 aa22.02■■□□□ 1.12
MKS1-202ENST00000393119 MAPKBP1O60336 1514 aa22.02■■□□□ 1.11
MKS1-202ENST00000393119 ABCC5O15440 1437 aa22.01■■□□□ 1.11
MKS1-202ENST00000393119 ABCC2Q92887 1545 aa22.01■■□□□ 1.11
MKS1-202ENST00000393119 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.01■■□□□ 1.11
MKS1-202ENST00000393119 DAPK1P53355 1430 aa21.99■■□□□ 1.11
MKS1-202ENST00000393119 NEUROD1Q13562 356 aa21.99■■□□□ 1.11
MKS1-202ENST00000393119 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.98■■□□□ 1.11
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