RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390664.2

CHST6-202, Transcript of carbohydrate sulfotransferase 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHST6, Length 2,093 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST6-202ENST00000390664 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.65■■■■□ 3.3
CHST6-202ENST00000390664 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
CHST6-202ENST00000390664 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.53■■■■□ 3.28
CHST6-202ENST00000390664 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.47■■■■□ 3.27
CHST6-202ENST00000390664 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
CHST6-202ENST00000390664 APLP2Q06481 763 aa35.39■■■■□ 3.26
CHST6-202ENST00000390664 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
CHST6-202ENST00000390664 GRIN2AQ12879 1464 aa35.34■■■■□ 3.25
CHST6-202ENST00000390664 SAMD9Q5K651 1589 aa35.33■■■■□ 3.25
CHST6-202ENST00000390664 IQGAP2Q13576 1575 aa35.33■■■■□ 3.25
CHST6-202ENST00000390664 SYNJ2O15056 1496 aa35.31■■■■□ 3.24
CHST6-202ENST00000390664 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.28■■■■□ 3.24
CHST6-202ENST00000390664 P3H3Q8IVL6 736 aa35.27■■■■□ 3.24
CHST6-202ENST00000390664 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.22
CHST6-202ENST00000390664 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
CHST6-202ENST00000390664 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.17■■■■□ 3.22
CHST6-202ENST00000390664 CEP170Q5SW79 1584 aa35.13■■■■□ 3.21
CHST6-202ENST00000390664 FMN1Q68DA7 1419 aa35.13■■■■□ 3.21
CHST6-202ENST00000390664 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.12■■■■□ 3.21
CHST6-202ENST00000390664 FBLN2P98095 1184 aa35.1■■■■□ 3.21
CHST6-202ENST00000390664 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.09■■■■□ 3.21
CHST6-202ENST00000390664 TIAM1Q13009 1591 aa35.09■■■■□ 3.21
CHST6-202ENST00000390664 MAP3K1Q13233 1512 aa35.09■■■■□ 3.21
CHST6-202ENST00000390664 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.06■■■■□ 3.2
CHST6-202ENST00000390664 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.05■■■■□ 3.2
CHST6-202ENST00000390664 NUP160Q12769 1436 aa35.04■■■■□ 3.2
CHST6-202ENST00000390664 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
CHST6-202ENST00000390664 CHD1O14646 1710 aa34.99■■■■□ 3.19
CHST6-202ENST00000390664 KIAA0556O60303 1618 aa34.97■■■■□ 3.19
CHST6-202ENST00000390664 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.93■■■■□ 3.18
CHST6-202ENST00000390664 DISP1Q96F81 1524 aa34.93■■■■□ 3.18
CHST6-202ENST00000390664 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.89■■■■□ 3.18
CHST6-202ENST00000390664 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.89■■■■□ 3.18
CHST6-202ENST00000390664 HECW1Q76N89 1606 aa34.81■■■■□ 3.16
CHST6-202ENST00000390664 HRCP23327 699 aa34.79■■■■□ 3.16
CHST6-202ENST00000390664 JPH4Q96JJ6 628 aa34.76■■■■□ 3.16
CHST6-202ENST00000390664 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.74■■■■□ 3.15
CHST6-202ENST00000390664 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.72■■■■□ 3.15
CHST6-202ENST00000390664 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
CHST6-202ENST00000390664 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.65■■■■□ 3.14
CHST6-202ENST00000390664 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
CHST6-202ENST00000390664 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.61■■■■□ 3.13
CHST6-202ENST00000390664 SHROOM2Q13796 1616 aa34.6■■■■□ 3.13
CHST6-202ENST00000390664 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.58■■■■□ 3.13
CHST6-202ENST00000390664 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.57■■■■□ 3.12
CHST6-202ENST00000390664 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.57■■■■□ 3.12
CHST6-202ENST00000390664 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
CHST6-202ENST00000390664 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
CHST6-202ENST00000390664 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
CHST6-202ENST00000390664 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
CHST6-202ENST00000390664 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
CHST6-202ENST00000390664 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.51■■■■□ 3.12
CHST6-202ENST00000390664 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.5■■■■□ 3.11
CHST6-202ENST00000390664 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.49■■■■□ 3.11
CHST6-202ENST00000390664 NCOA2Q15596 1464 aa34.43■■■■□ 3.1
CHST6-202ENST00000390664 ARID3CA6NKF2 412 aa34.42■■■■□ 3.1
CHST6-202ENST00000390664 ABCA8O94911 1581 aa34.42■■■■□ 3.1
CHST6-202ENST00000390664 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
CHST6-202ENST00000390664 ARHGEF11O15085 1522 aa34.37■■■■□ 3.09
CHST6-202ENST00000390664 PTPRGP23470 1445 aa34.35■■■■□ 3.09
CHST6-202ENST00000390664 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.33■■■■□ 3.09
CHST6-202ENST00000390664 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.09
CHST6-202ENST00000390664 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.32■■■■□ 3.09
CHST6-202ENST00000390664 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
CHST6-202ENST00000390664 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.3■■■■□ 3.08
CHST6-202ENST00000390664 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
CHST6-202ENST00000390664 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
CHST6-202ENST00000390664 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.26■■■■□ 3.08
CHST6-202ENST00000390664 ITGAEP38570 1179 aa34.23■■■■□ 3.07
CHST6-202ENST00000390664 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
CHST6-202ENST00000390664 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.18■■■■□ 3.06
CHST6-202ENST00000390664 ATP10BO94823 1461 aa34.17■■■■□ 3.06
CHST6-202ENST00000390664 UACAQ9BZF9 1416 aa34.17■■■■□ 3.06
CHST6-202ENST00000390664 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.16■■■■□ 3.06
CHST6-202ENST00000390664 ABCC2Q92887 1545 aa34.1■■■■□ 3.05
CHST6-202ENST00000390664 KIF14Q15058 1648 aa34.09■■■■□ 3.05
CHST6-202ENST00000390664 MIA2Q96PC5 1412 aa34.08■■■■□ 3.05
CHST6-202ENST00000390664 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.05
CHST6-202ENST00000390664 OSCARQ8IYS5 282 aa34.04■■■■□ 3.04
CHST6-202ENST00000390664 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.04■■■■□ 3.04
CHST6-202ENST00000390664 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.03■■■■□ 3.04
CHST6-202ENST00000390664 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.96■■■■□ 3.03
CHST6-202ENST00000390664 SETD5Q9C0A6 1442 aa33.95■■■■□ 3.03
CHST6-202ENST00000390664 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa33.94■■■■□ 3.02
CHST6-202ENST00000390664 PTPRKQ15262 1439 aa33.91■■■■□ 3.02
CHST6-202ENST00000390664 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.91■■■■□ 3.02
CHST6-202ENST00000390664 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
CHST6-202ENST00000390664 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
CHST6-202ENST00000390664 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.89■■■■□ 3.02
CHST6-202ENST00000390664 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
CHST6-202ENST00000390664 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.85■■■■□ 3.01
CHST6-202ENST00000390664 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
CHST6-202ENST00000390664 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
CHST6-202ENST00000390664 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.8■■■■□ 3
CHST6-202ENST00000390664 HFM1A2PYH4 1435 aa33.8■■■■□ 3
CHST6-202ENST00000390664 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.76■■■□□ 2.99
CHST6-202ENST00000390664 CLSPNQ9HAW4 1339 aa33.75■■■□□ 2.99
CHST6-202ENST00000390664 DAPK1P53355 1430 aa33.75■■■□□ 2.99
CHST6-202ENST00000390664 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.74■■■□□ 2.99
CHST6-202ENST00000390664 PREX2Q70Z35 1606 aa33.73■■■□□ 2.99
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