RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379915.4

AC009690.1-201, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene AC009690.1, Length 4,374 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009690.1-201ENST00000379915 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
AC009690.1-201ENST00000379915 DEKP35659 375 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
AC009690.1-201ENST00000379915 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
AC009690.1-201ENST00000379915 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa19.38■□□□□ 0.69
AC009690.1-201ENST00000379915 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.38■□□□□ 0.69
AC009690.1-201ENST00000379915 FBLN2P98095 1184 aa19.36■□□□□ 0.69
AC009690.1-201ENST00000379915 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
AC009690.1-201ENST00000379915 BICRAQ9NZM4 1560 aa19.34■□□□□ 0.69
AC009690.1-201ENST00000379915 ARID3CA6NKF2 412 aa19.33■□□□□ 0.69
AC009690.1-201ENST00000379915 UNC13AQ9UPW8 1703 aa19.29■□□□□ 0.68
AC009690.1-201ENST00000379915 NEFMP07197 916 aa19.26■□□□□ 0.67
AC009690.1-201ENST00000379915 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.26■□□□□ 0.67
AC009690.1-201ENST00000379915 KIF27Q86VH2 1401 aa19.24■□□□□ 0.67
AC009690.1-201ENST00000379915 CANXP27824 592 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
AC009690.1-201ENST00000379915 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa19.2■□□□□ 0.66
AC009690.1-201ENST00000379915 MRS2Q9HD23 443 aa19.18■□□□□ 0.66
AC009690.1-201ENST00000379915 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
AC009690.1-201ENST00000379915 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
AC009690.1-201ENST00000379915 CUX2O14529 1486 aa19.16■□□□□ 0.66
AC009690.1-201ENST00000379915 SYNJ1O43426 1573 aa19.16■□□□□ 0.66
AC009690.1-201ENST00000379915 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
AC009690.1-201ENST00000379915 VPS8Q8N3P4 1428 aa19.13■□□□□ 0.65
AC009690.1-201ENST00000379915 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
AC009690.1-201ENST00000379915 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
AC009690.1-201ENST00000379915 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
AC009690.1-201ENST00000379915 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
AC009690.1-201ENST00000379915 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.05■□□□□ 0.64
AC009690.1-201ENST00000379915 TONSLQ96HA7 1378 aa19.05■□□□□ 0.64
AC009690.1-201ENST00000379915 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.04■□□□□ 0.64
AC009690.1-201ENST00000379915 NCAPD3P42695 1498 aa19.01■□□□□ 0.63
AC009690.1-201ENST00000379915 TMC1Q8TDI8 760 aa19.01■□□□□ 0.63
AC009690.1-201ENST00000379915 ERICH6BQ5W0A0 696 aa18.98■□□□□ 0.63
AC009690.1-201ENST00000379915 PPP4R2Q9NY27 417 aa18.95■□□□□ 0.62
AC009690.1-201ENST00000379915 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
AC009690.1-201ENST00000379915 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
AC009690.1-201ENST00000379915 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.94■□□□□ 0.62
AC009690.1-201ENST00000379915 KCNH8Q96L42 1107 aa18.94■□□□□ 0.62
AC009690.1-201ENST00000379915 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
AC009690.1-201ENST00000379915 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
AC009690.1-201ENST00000379915 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
AC009690.1-201ENST00000379915 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.62
AC009690.1-201ENST00000379915 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
AC009690.1-201ENST00000379915 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.88■□□□□ 0.61
AC009690.1-201ENST00000379915 SIN3AQ96ST3 1273 aa18.87■□□□□ 0.61
AC009690.1-201ENST00000379915 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.87■□□□□ 0.61
AC009690.1-201ENST00000379915 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.87■□□□□ 0.61
AC009690.1-201ENST00000379915 CCNB3Q8WWL7 1395 aa18.86■□□□□ 0.61
AC009690.1-201ENST00000379915 IGF1RP08069 1367 aa18.85■□□□□ 0.61
AC009690.1-201ENST00000379915 ARID3AQ99856 593 aa18.85■□□□□ 0.61
AC009690.1-201ENST00000379915 CUX1P39880 1505 aa18.85■□□□□ 0.61
AC009690.1-201ENST00000379915 CFTRP13569 1480 aa18.84■□□□□ 0.61
AC009690.1-201ENST00000379915 KIF21BO75037 1637 aa18.84■□□□□ 0.61
AC009690.1-201ENST00000379915 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.84■□□□□ 0.61
AC009690.1-201ENST00000379915 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.83■□□□□ 0.6
AC009690.1-201ENST00000379915 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.83■□□□□ 0.6
AC009690.1-201ENST00000379915 RGS3P49796 1198 aa18.82■□□□□ 0.6
AC009690.1-201ENST00000379915 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
AC009690.1-201ENST00000379915 NESP48681 1621 aa18.8■□□□□ 0.6
AC009690.1-201ENST00000379915 TOP2BQ02880 1626 aa18.8■□□□□ 0.6
AC009690.1-201ENST00000379915 DDRGK1Q96HY6 314 aa18.79■□□□□ 0.6
AC009690.1-201ENST00000379915 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.79■□□□□ 0.6
AC009690.1-201ENST00000379915 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.79■□□□□ 0.6
AC009690.1-201ENST00000379915 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.79■□□□□ 0.6
AC009690.1-201ENST00000379915 ARAP1Q96P48 1450 aa18.77■□□□□ 0.6
AC009690.1-201ENST00000379915 HMGXB3Q12766 1538 aa18.76■□□□□ 0.59
AC009690.1-201ENST00000379915 PRXQ9BXM0 1461 aa18.74■□□□□ 0.59
AC009690.1-201ENST00000379915 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
AC009690.1-201ENST00000379915 TPRNQ4KMQ1 711 aa18.73■□□□□ 0.59
AC009690.1-201ENST00000379915 VSIG10Q8N0Z9 540 aa18.73■□□□□ 0.59
AC009690.1-201ENST00000379915 SLC24A1O60721 1099 aa18.73■□□□□ 0.59
AC009690.1-201ENST00000379915 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.72■□□□□ 0.59
AC009690.1-201ENST00000379915 NCLP19338 710 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
AC009690.1-201ENST00000379915 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
AC009690.1-201ENST00000379915 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa18.7■□□□□ 0.58
AC009690.1-201ENST00000379915 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18.7■□□□□ 0.58
AC009690.1-201ENST00000379915 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.7■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 26.9
AC009690.1-201ENST00000379915 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.69■□□□□ 0.58
AC009690.1-201ENST00000379915 ZBTB7CA1YPR0 619 aa18.68■□□□□ 0.58
AC009690.1-201ENST00000379915 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa18.67■□□□□ 0.58
AC009690.1-201ENST00000379915 BECN1Q14457 450 aa18.67■□□□□ 0.58
AC009690.1-201ENST00000379915 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
AC009690.1-201ENST00000379915 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa18.66■□□□□ 0.58
AC009690.1-201ENST00000379915 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
AC009690.1-201ENST00000379915 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.65■□□□□ 0.58
AC009690.1-201ENST00000379915 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
AC009690.1-201ENST00000379915 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
AC009690.1-201ENST00000379915 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
AC009690.1-201ENST00000379915 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP18.6■□□□□ 0.57
AC009690.1-201ENST00000379915 IL27Q8NEV9 243 aa18.6■□□□□ 0.57
AC009690.1-201ENST00000379915 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
AC009690.1-201ENST00000379915 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.6■□□□□ 0.57
AC009690.1-201ENST00000379915 SLC4A3P48751 1232 aa18.59■□□□□ 0.57
AC009690.1-201ENST00000379915 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
AC009690.1-201ENST00000379915 PTMAP06454 111 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
AC009690.1-201ENST00000379915 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP18.57■□□□□ 0.56
AC009690.1-201ENST00000379915 SETD5Q9C0A6 1442 aa18.57■□□□□ 0.56
AC009690.1-201ENST00000379915 PHLDB1Q86UU1 1377 aa18.55■□□□□ 0.56
AC009690.1-201ENST00000379915 ERCC6Q03468 1493 aa18.54■□□□□ 0.56
AC009690.1-201ENST00000379915 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
AC009690.1-201ENST00000379915 PLCB2Q00722 1185 aa18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms