RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371281.3

TTC4-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC4, Length 2,395 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC4-201ENST00000371281 ERCC6Q03468 1493 aa20.57■□□□□ 0.88
TTC4-201ENST00000371281 ADAMTS12P58397 1594 aa20.56■□□□□ 0.88
TTC4-201ENST00000371281 MAP3K1Q13233 1512 aa20.55■□□□□ 0.88
TTC4-201ENST00000371281 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.888e-8■■■■□ 25.3
TTC4-201ENST00000371281 GRIN2BQ13224 1484 aa20.53■□□□□ 0.88
TTC4-201ENST00000371281 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.52■□□□□ 0.88
TTC4-201ENST00000371281 SAMD9Q5K651 1589 aa20.51■□□□□ 0.87
TTC4-201ENST00000371281 TIAM1Q13009 1591 aa20.5■□□□□ 0.87
TTC4-201ENST00000371281 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TTC4-201ENST00000371281 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TTC4-201ENST00000371281 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.48■□□□□ 0.87
TTC4-201ENST00000371281 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TTC4-201ENST00000371281 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TTC4-201ENST00000371281 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.46■□□□□ 0.87
TTC4-201ENST00000371281 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.44■□□□□ 0.86
TTC4-201ENST00000371281 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.41■□□□□ 0.86
TTC4-201ENST00000371281 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
TTC4-201ENST00000371281 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
TTC4-201ENST00000371281 FMN1Q68DA7 1419 aa20.39■□□□□ 0.85
TTC4-201ENST00000371281 P3H3Q8IVL6 736 aa20.39■□□□□ 0.85
TTC4-201ENST00000371281 IQGAP2Q13576 1575 aa20.39■□□□□ 0.85
TTC4-201ENST00000371281 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.38■□□□□ 0.85
TTC4-201ENST00000371281 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.37■□□□□ 0.85
TTC4-201ENST00000371281 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TTC4-201ENST00000371281 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
TTC4-201ENST00000371281 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
TTC4-201ENST00000371281 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.3■□□□□ 0.84
TTC4-201ENST00000371281 GRIN2AQ12879 1464 aa20.3■□□□□ 0.84
TTC4-201ENST00000371281 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.29■□□□□ 0.84
TTC4-201ENST00000371281 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.27■□□□□ 0.83
TTC4-201ENST00000371281 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.26■□□□□ 0.83
TTC4-201ENST00000371281 SYNJ2O15056 1496 aa20.25■□□□□ 0.83
TTC4-201ENST00000371281 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.2■□□□□ 0.82
TTC4-201ENST00000371281 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
TTC4-201ENST00000371281 CEP170Q5SW79 1584 aa20.19■□□□□ 0.82
TTC4-201ENST00000371281 KIAA0556O60303 1618 aa20.18■□□□□ 0.82
TTC4-201ENST00000371281 HECW1Q76N89 1606 aa20.18■□□□□ 0.82
TTC4-201ENST00000371281 DISP1Q96F81 1524 aa20.16■□□□□ 0.82
TTC4-201ENST00000371281 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.16■□□□□ 0.82
TTC4-201ENST00000371281 NUP160Q12769 1436 aa20.14■□□□□ 0.81
TTC4-201ENST00000371281 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.13■□□□□ 0.81
TTC4-201ENST00000371281 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
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TTC4-201ENST00000371281 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
TTC4-201ENST00000371281 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
TTC4-201ENST00000371281 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC4-201ENST00000371281 ARHGEF11O15085 1522 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC4-201ENST00000371281 NCOA2Q15596 1464 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC4-201ENST00000371281 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.04■□□□□ 0.8
TTC4-201ENST00000371281 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.03■□□□□ 0.8
TTC4-201ENST00000371281 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
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TTC4-201ENST00000371281 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20■□□□□ 0.79
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TTC4-201ENST00000371281 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.95■□□□□ 0.78
TTC4-201ENST00000371281 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.94■□□□□ 0.78
TTC4-201ENST00000371281 JPH4Q96JJ6 628 aa19.94■□□□□ 0.78
TTC4-201ENST00000371281 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.93■□□□□ 0.78
TTC4-201ENST00000371281 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
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TTC4-201ENST00000371281 ABCA8O94911 1581 aa19.87■□□□□ 0.77
TTC4-201ENST00000371281 SHROOM2Q13796 1616 aa19.86■□□□□ 0.77
TTC4-201ENST00000371281 MIA2Q96PC5 1412 aa19.85■□□□□ 0.77
TTC4-201ENST00000371281 PTPRKQ15262 1439 aa19.83■□□□□ 0.77
TTC4-201ENST00000371281 ADCY10Q96PN6 1610 aa19.83■□□□□ 0.77
TTC4-201ENST00000371281 MAPKBP1O60336 1514 aa19.82■□□□□ 0.76
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TTC4-201ENST00000371281 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
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TTC4-201ENST00000371281 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.73■□□□□ 0.75
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TTC4-201ENST00000371281 UACAQ9BZF9 1416 aa19.66■□□□□ 0.74
TTC4-201ENST00000371281 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
TTC4-201ENST00000371281 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.66■□□□□ 0.74
TTC4-201ENST00000371281 DAPK1P53355 1430 aa19.65■□□□□ 0.74
TTC4-201ENST00000371281 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa19.65■□□□□ 0.74
TTC4-201ENST00000371281 ABCC10Q5T3U5 1492 aa19.64■□□□□ 0.73
TTC4-201ENST00000371281 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa19.62■□□□□ 0.73
TTC4-201ENST00000371281 ROCK1Q13464 1354 aa19.62■□□□□ 0.73
TTC4-201ENST00000371281 ABCC5O15440 1437 aa19.62■□□□□ 0.73
TTC4-201ENST00000371281 PLEKHD1A6NEE1 506 aa19.61■□□□□ 0.73
TTC4-201ENST00000371281 CROCC2H7BZ55 1655 aa19.6■□□□□ 0.73
TTC4-201ENST00000371281 ABCC2Q92887 1545 aa19.6■□□□□ 0.73
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