RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366170.6

VSTM1-202, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSTM1, Length 654 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1-202ENST00000366170 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
VSTM1-202ENST00000366170 OSCARQ8IYS5 282 aa20.87■□□□□ 0.93
VSTM1-202ENST00000366170 NUP160Q12769 1436 aa20.82■□□□□ 0.92
VSTM1-202ENST00000366170 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.81■□□□□ 0.92
VSTM1-202ENST00000366170 CEP170Q5SW79 1584 aa20.8■□□□□ 0.92
VSTM1-202ENST00000366170 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.8■□□□□ 0.92
VSTM1-202ENST00000366170 JPH4Q96JJ6 628 aa20.77■□□□□ 0.92
VSTM1-202ENST00000366170 IQGAP2Q13576 1575 aa20.73■□□□□ 0.91
VSTM1-202ENST00000366170 CEP162Q5TB80 1403 aa20.7■□□□□ 0.9
VSTM1-202ENST00000366170 P3H3Q8IVL6 736 aa20.7■□□□□ 0.9
VSTM1-202ENST00000366170 CLIP1P30622 1438 aa20.7■□□□□ 0.9
VSTM1-202ENST00000366170 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.65■□□□□ 0.9
VSTM1-202ENST00000366170 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.63■□□□□ 0.89
VSTM1-202ENST00000366170 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.61■□□□□ 0.89
VSTM1-202ENST00000366170 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
VSTM1-202ENST00000366170 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.59■□□□□ 0.89
VSTM1-202ENST00000366170 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
VSTM1-202ENST00000366170 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.58■□□□□ 0.88
VSTM1-202ENST00000366170 SHROOM2Q13796 1616 aa20.56■□□□□ 0.88
VSTM1-202ENST00000366170 DISP1Q96F81 1524 aa20.55■□□□□ 0.88
VSTM1-202ENST00000366170 SAMD9Q5K651 1589 aa20.54■□□□□ 0.88
VSTM1-202ENST00000366170 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.53■□□□□ 0.88
VSTM1-202ENST00000366170 KIAA0556O60303 1618 aa20.51■□□□□ 0.87
VSTM1-202ENST00000366170 ARAP1Q96P48 1450 aa20.5■□□□□ 0.87
VSTM1-202ENST00000366170 PTPRGP23470 1445 aa20.47■□□□□ 0.87
VSTM1-202ENST00000366170 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
VSTM1-202ENST00000366170 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.46■□□□□ 0.87
VSTM1-202ENST00000366170 FMN1Q68DA7 1419 aa20.44■□□□□ 0.86
VSTM1-202ENST00000366170 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.41■□□□□ 0.86
VSTM1-202ENST00000366170 APLP2Q06481 763 aa20.38■□□□□ 0.85
VSTM1-202ENST00000366170 ARHGEF11O15085 1522 aa20.37■□□□□ 0.85
VSTM1-202ENST00000366170 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.33■□□□□ 0.85
VSTM1-202ENST00000366170 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.33■□□□□ 0.84
VSTM1-202ENST00000366170 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM1-202ENST00000366170 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM1-202ENST00000366170 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.32■□□□□ 0.84
VSTM1-202ENST00000366170 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.3■□□□□ 0.84
VSTM1-202ENST00000366170 UACAQ9BZF9 1416 aa20.3■□□□□ 0.84
VSTM1-202ENST00000366170 ARID3CA6NKF2 412 aa20.29■□□□□ 0.84
VSTM1-202ENST00000366170 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
VSTM1-202ENST00000366170 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
VSTM1-202ENST00000366170 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.28■□□□□ 0.84
VSTM1-202ENST00000366170 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.27■□□□□ 0.84
VSTM1-202ENST00000366170 ABCA8O94911 1581 aa20.26■□□□□ 0.83
VSTM1-202ENST00000366170 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
VSTM1-202ENST00000366170 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
VSTM1-202ENST00000366170 HECW1Q76N89 1606 aa20.23■□□□□ 0.83
VSTM1-202ENST00000366170 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.21■□□□□ 0.83
VSTM1-202ENST00000366170 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
VSTM1-202ENST00000366170 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
VSTM1-202ENST00000366170 ABCC2Q92887 1545 aa20.2■□□□□ 0.82
VSTM1-202ENST00000366170 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
VSTM1-202ENST00000366170 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
VSTM1-202ENST00000366170 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM1-202ENST00000366170 ATP10BO94823 1461 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM1-202ENST00000366170 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.16■□□□□ 0.82
VSTM1-202ENST00000366170 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM1-202ENST00000366170 MAP3K1Q13233 1512 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM1-202ENST00000366170 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
VSTM1-202ENST00000366170 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM1-202ENST00000366170 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
VSTM1-202ENST00000366170 TIAM1Q13009 1591 aa20.12■□□□□ 0.81
VSTM1-202ENST00000366170 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.11■□□□□ 0.81
VSTM1-202ENST00000366170 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.1■□□□□ 0.81
VSTM1-202ENST00000366170 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.07■□□□□ 0.8
VSTM1-202ENST00000366170 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
VSTM1-202ENST00000366170 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM1-202ENST00000366170 KCNH8Q96L42 1107 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM1-202ENST00000366170 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
VSTM1-202ENST00000366170 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa19.98■□□□□ 0.79
VSTM1-202ENST00000366170 ASXL2Q76L83 1435 aa19.98■□□□□ 0.79
VSTM1-202ENST00000366170 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.97■□□□□ 0.79
VSTM1-202ENST00000366170 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
VSTM1-202ENST00000366170 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
VSTM1-202ENST00000366170 WDR7Q9Y4E6 1490 aa19.93■□□□□ 0.78
VSTM1-202ENST00000366170 NCOA2Q15596 1464 aa19.91■□□□□ 0.78
VSTM1-202ENST00000366170 MAPKBP1O60336 1514 aa19.9■□□□□ 0.78
VSTM1-202ENST00000366170 KIF14Q15058 1648 aa19.88■□□□□ 0.77
VSTM1-202ENST00000366170 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.88■□□□□ 0.77
VSTM1-202ENST00000366170 FAM69CQ0P6D2 419 aa19.85■□□□□ 0.77
VSTM1-202ENST00000366170 PHLDB1Q86UU1 1377 aa19.84■□□□□ 0.77
VSTM1-202ENST00000366170 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
VSTM1-202ENST00000366170 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
VSTM1-202ENST00000366170 ABCC10Q5T3U5 1492 aa19.82■□□□□ 0.76
VSTM1-202ENST00000366170 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP19.81■□□□□ 0.76
VSTM1-202ENST00000366170 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
VSTM1-202ENST00000366170 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.8■□□□□ 0.76
VSTM1-202ENST00000366170 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
VSTM1-202ENST00000366170 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
VSTM1-202ENST00000366170 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
VSTM1-202ENST00000366170 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.77■□□□□ 0.76
VSTM1-202ENST00000366170 CD109Q6YHK3 1445 aa19.76■□□□□ 0.75
VSTM1-202ENST00000366170 TTC37Q6PGP7 1564 aa19.76■□□□□ 0.75
VSTM1-202ENST00000366170 ABCA9Q8IUA7 1624 aa19.76■□□□□ 0.75
VSTM1-202ENST00000366170 PLCH2O75038 1416 aa19.76■□□□□ 0.75
VSTM1-202ENST00000366170 MIA2Q96PC5 1412 aa19.75■□□□□ 0.75
VSTM1-202ENST00000366170 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa19.74■□□□□ 0.75
VSTM1-202ENST00000366170 FGD6Q6ZV73 1430 aa19.74■□□□□ 0.75
VSTM1-202ENST00000366170 ITSN2Q9NZM3 1697 aa19.74■□□□□ 0.75
VSTM1-202ENST00000366170 GLI2P10070 1586 aa19.74■□□□□ 0.75
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