RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361523.8

BECN1-201, Transcript of beclin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BECN1, Length 2,112 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-201ENST00000361523 TIAM1Q13009 1591 aa27■■□□□ 1.91
BECN1-201ENST00000361523 EFCAB5A4FU69 1503 aa27■■□□□ 1.91
BECN1-201ENST00000361523 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
BECN1-201ENST00000361523 P3H3Q8IVL6 736 aa26.92■■□□□ 1.9
BECN1-201ENST00000361523 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.91■■□□□ 1.9
BECN1-201ENST00000361523 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
BECN1-201ENST00000361523 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.9■■□□□ 1.9
BECN1-201ENST00000361523 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.88■■□□□ 1.89
BECN1-201ENST00000361523 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.88■■□□□ 1.89
BECN1-201ENST00000361523 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.87■■□□□ 1.89
BECN1-201ENST00000361523 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.85■■□□□ 1.893e-9■■■■□ 25.8
BECN1-201ENST00000361523 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.85■■□□□ 1.89
BECN1-201ENST00000361523 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.82■■□□□ 1.88
BECN1-201ENST00000361523 PBRM1Q86U86 1689 aa26.82■■□□□ 1.88
BECN1-201ENST00000361523 FMN1Q68DA7 1419 aa26.8■■□□□ 1.88
BECN1-201ENST00000361523 SAMD9Q5K651 1589 aa26.78■■□□□ 1.88
BECN1-201ENST00000361523 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
BECN1-201ENST00000361523 WDR62O43379 1518 aa26.73■■□□□ 1.87
BECN1-201ENST00000361523 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.73■■□□□ 1.87
BECN1-201ENST00000361523 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.7■■□□□ 1.86
BECN1-201ENST00000361523 IFT140Q96RY7 1462 aa26.7■■□□□ 1.86
BECN1-201ENST00000361523 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.69■■□□□ 1.86
BECN1-201ENST00000361523 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
BECN1-201ENST00000361523 ADAMTS12P58397 1594 aa26.69■■□□□ 1.86
BECN1-201ENST00000361523 GRIN2BQ13224 1484 aa26.68■■□□□ 1.86
BECN1-201ENST00000361523 ITGAEP38570 1179 aa26.64■■□□□ 1.86
BECN1-201ENST00000361523 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
BECN1-201ENST00000361523 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
BECN1-201ENST00000361523 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
BECN1-201ENST00000361523 IQGAP2Q13576 1575 aa26.59■■□□□ 1.85
BECN1-201ENST00000361523 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
BECN1-201ENST00000361523 ERCC6Q03468 1493 aa26.58■■□□□ 1.84
BECN1-201ENST00000361523 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.56■■□□□ 1.84
BECN1-201ENST00000361523 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
BECN1-201ENST00000361523 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.52■■□□□ 1.84
BECN1-201ENST00000361523 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.84
BECN1-201ENST00000361523 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.51■■□□□ 1.83
BECN1-201ENST00000361523 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.49■■□□□ 1.83
BECN1-201ENST00000361523 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
BECN1-201ENST00000361523 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.45■■□□□ 1.82
BECN1-201ENST00000361523 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.44■■□□□ 1.82
BECN1-201ENST00000361523 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.44■■□□□ 1.82
BECN1-201ENST00000361523 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.42■■□□□ 1.82
BECN1-201ENST00000361523 HECW1Q76N89 1606 aa26.41■■□□□ 1.82
BECN1-201ENST00000361523 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
BECN1-201ENST00000361523 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.41■■□□□ 1.82
BECN1-201ENST00000361523 NCOA2Q15596 1464 aa26.39■■□□□ 1.82
BECN1-201ENST00000361523 GRIN2AQ12879 1464 aa26.38■■□□□ 1.81
BECN1-201ENST00000361523 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
BECN1-201ENST00000361523 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.35■■□□□ 1.81
BECN1-201ENST00000361523 MAPKBP1O60336 1514 aa26.33■■□□□ 1.8
BECN1-201ENST00000361523 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.8
BECN1-201ENST00000361523 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.32■■□□□ 1.8
BECN1-201ENST00000361523 ARHGEF11O15085 1522 aa26.31■■□□□ 1.8
BECN1-201ENST00000361523 KIAA0556O60303 1618 aa26.3■■□□□ 1.8
BECN1-201ENST00000361523 DISP1Q96F81 1524 aa26.29■■□□□ 1.8
BECN1-201ENST00000361523 SYNJ2O15056 1496 aa26.28■■□□□ 1.8
BECN1-201ENST00000361523 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
BECN1-201ENST00000361523 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
BECN1-201ENST00000361523 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.23■■□□□ 1.79
BECN1-201ENST00000361523 CEP170Q5SW79 1584 aa26.2■■□□□ 1.78
BECN1-201ENST00000361523 PTPRKQ15262 1439 aa26.2■■□□□ 1.78
BECN1-201ENST00000361523 HFM1A2PYH4 1435 aa26.19■■□□□ 1.78
BECN1-201ENST00000361523 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
BECN1-201ENST00000361523 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.15■■□□□ 1.78
BECN1-201ENST00000361523 FBLN2P98095 1184 aa26.14■■□□□ 1.78
BECN1-201ENST00000361523 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
BECN1-201ENST00000361523 NUP160Q12769 1436 aa26.12■■□□□ 1.77
BECN1-201ENST00000361523 ARID3CA6NKF2 412 aa26.12■■□□□ 1.77
BECN1-201ENST00000361523 MIA2Q96PC5 1412 aa26.11■■□□□ 1.77
BECN1-201ENST00000361523 NAIPQ13075 1403 aa26.1■■□□□ 1.77
BECN1-201ENST00000361523 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.07■■□□□ 1.76
BECN1-201ENST00000361523 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.06■■□□□ 1.76
BECN1-201ENST00000361523 UACAQ9BZF9 1416 aa26.06■■□□□ 1.76
BECN1-201ENST00000361523 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.06■■□□□ 1.76
BECN1-201ENST00000361523 MIER1Q8N108 512 aa26.06■■□□□ 1.76
BECN1-201ENST00000361523 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
BECN1-201ENST00000361523 JPH4Q96JJ6 628 aa26.05■■□□□ 1.76
BECN1-201ENST00000361523 NEUROD1Q13562 356 aa26.03■■□□□ 1.76
BECN1-201ENST00000361523 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
BECN1-201ENST00000361523 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
BECN1-201ENST00000361523 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.99■■□□□ 1.75
BECN1-201ENST00000361523 AKNAQ7Z591 1439 aa25.98■■□□□ 1.75
BECN1-201ENST00000361523 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.98■■□□□ 1.75
BECN1-201ENST00000361523 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.95■■□□□ 1.74
BECN1-201ENST00000361523 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.94■■□□□ 1.74
BECN1-201ENST00000361523 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
BECN1-201ENST00000361523 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
BECN1-201ENST00000361523 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
BECN1-201ENST00000361523 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
BECN1-201ENST00000361523 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
BECN1-201ENST00000361523 DAPK1P53355 1430 aa25.87■■□□□ 1.73
BECN1-201ENST00000361523 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.86■■□□□ 1.73
BECN1-201ENST00000361523 ABCA8O94911 1581 aa25.85■■□□□ 1.73
BECN1-201ENST00000361523 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.85■■□□□ 1.73
BECN1-201ENST00000361523 ROCK1Q13464 1354 aa25.84■■□□□ 1.73
BECN1-201ENST00000361523 TONSLQ96HA7 1378 aa25.84■■□□□ 1.73
BECN1-201ENST00000361523 ABCC5O15440 1437 aa25.82■■□□□ 1.72
BECN1-201ENST00000361523 KDM6BO15054 1643 aa25.82■■□□□ 1.72
BECN1-201ENST00000361523 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
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