RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 TNIKQ9UKE5 1360 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-201ENST00000355233 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-201ENST00000355233 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-201ENST00000355233 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-201ENST00000355233 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRD-201ENST00000355233 POLR3GLQ9BT43 218 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-201ENST00000355233 P3H3Q8IVL6 736 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-201ENST00000355233 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
PTPRD-201ENST00000355233 CHMP4AQ9BY43 222 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 NRDCO43847 1150 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 CECR2Q9BXF3 1484 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 CCER2I3L3R5 266 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 MTUS2Q5JR59 1369 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 CANXP27824 592 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 ABCC8Q09428 1581 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 CLIP1P30622 1438 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 NGEFQ8N5V2 710 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 CASC1Q6TDU7 716 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 CADPSQ9ULU8 1353 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 ARID3CA6NKF2 412 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 CUX1P39880 1505 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 AAMPQ13685 434 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 MYH16Q9H6N6 1097 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 KIF21BO75037 1637 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 SCAPERQ9BY12 1400 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRD-201ENST00000355233 PRDM2Q13029 1718 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 IL27Q8NEV9 243 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 HDGFP51858 240 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 CHGAP10645 457 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC18Q5T9S5 1454 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 ERICH3Q5RHP9 1530 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC136Q96JN2 1154 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 TRHP20396 242 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 KCNH8Q96L42 1107 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 FMN1Q68DA7 1419 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 VPS8Q8N3P4 1428 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 CUX2O14529 1486 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 SOGA1O94964 1423 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 KANK1Q14678 1352 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRD-201ENST00000355233 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 CCNB3Q8WWL7 1395 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 STAC3Q96MF2 364 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 HDAC5Q9UQL6 1122 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 PKNOX2Q96KN3 472 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 OSCARQ8IYS5 282 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 SMARCA4P51532 1647 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 PDE3BQ13370 1112 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 RSPH6AQ9H0K4 717 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 TMC1Q8TDI8 760 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 MAP7D2Q96T17 732 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 NCAPD3P42695 1498 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 PHF14O94880 888 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
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PTPRD-201ENST00000355233 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 CFAP53Q96M91 514 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 RSPH4AQ5TD94 716 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC34Q96HJ3 373 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 WWC1Q8IX03 1113 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 C14orf37Q86TY3 774 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 UACAQ9BZF9 1416 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 PLPPR3Q6T4P5 718 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-201ENST00000355233 CUL7Q14999 1698 aa6.28□□□□□ -1.4
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