RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353437.10

GABRB2-202, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor beta2 subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GABRB2, Length 1,963 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2-202ENST00000353437 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.1■■□□□ 1.93
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GABRB2-202ENST00000353437 P3H3Q8IVL6 736 aa27.03■■□□□ 1.92
GABRB2-202ENST00000353437 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
GABRB2-202ENST00000353437 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
GABRB2-202ENST00000353437 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
GABRB2-202ENST00000353437 FBLN2P98095 1184 aa26.94■■□□□ 1.9
GABRB2-202ENST00000353437 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
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GABRB2-202ENST00000353437 SYNJ2O15056 1496 aa26.92■■□□□ 1.9
GABRB2-202ENST00000353437 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.89■■□□□ 1.9
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GABRB2-202ENST00000353437 SAMD9Q5K651 1589 aa26.81■■□□□ 1.88
GABRB2-202ENST00000353437 CEP170Q5SW79 1584 aa26.8■■□□□ 1.88
GABRB2-202ENST00000353437 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.8■■□□□ 1.88
GABRB2-202ENST00000353437 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
GABRB2-202ENST00000353437 NUP160Q12769 1436 aa26.74■■□□□ 1.87
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GABRB2-202ENST00000353437 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.63■■□□□ 1.85
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GABRB2-202ENST00000353437 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.59■■□□□ 1.85
GABRB2-202ENST00000353437 TIAM1Q13009 1591 aa26.58■■□□□ 1.85
GABRB2-202ENST00000353437 KIAA0556O60303 1618 aa26.57■■□□□ 1.84
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GABRB2-202ENST00000353437 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.43■■□□□ 1.82
GABRB2-202ENST00000353437 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
GABRB2-202ENST00000353437 ARID3CA6NKF2 412 aa26.42■■□□□ 1.82
GABRB2-202ENST00000353437 HECW1Q76N89 1606 aa26.35■■□□□ 1.81
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GABRB2-202ENST00000353437 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.3■■□□□ 1.8
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GABRB2-202ENST00000353437 ARHGEF11O15085 1522 aa26.1■■□□□ 1.77
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GABRB2-202ENST00000353437 ABCC2Q92887 1545 aa25.95■■□□□ 1.74
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GABRB2-202ENST00000353437 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
GABRB2-202ENST00000353437 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.91■■□□□ 1.74
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GABRB2-202ENST00000353437 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.75■■□□□ 1.71
GABRB2-202ENST00000353437 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.74■■□□□ 1.71
GABRB2-202ENST00000353437 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
GABRB2-202ENST00000353437 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.71■■□□□ 1.71
GABRB2-202ENST00000353437 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
GABRB2-202ENST00000353437 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.68■■□□□ 1.7
GABRB2-202ENST00000353437 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.67■■□□□ 1.7
GABRB2-202ENST00000353437 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.67■■□□□ 1.7
GABRB2-202ENST00000353437 ABCC5O15440 1437 aa25.66■■□□□ 1.7
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