RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326035.6

NIM1K-201, Transcript of NIM1 serine/threonine protein kinase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NIM1K, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIM1K-201ENST00000326035 ADAMTS12P58397 1594 aa25.49■■□□□ 1.67
NIM1K-201ENST00000326035 P3H3Q8IVL6 736 aa25.48■■□□□ 1.67
NIM1K-201ENST00000326035 HRCP23327 699 aa25.47■■□□□ 1.67
NIM1K-201ENST00000326035 GRIN2BQ13224 1484 aa25.45■■□□□ 1.66
NIM1K-201ENST00000326035 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.4■■□□□ 1.66
NIM1K-201ENST00000326035 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.39■■□□□ 1.66
NIM1K-201ENST00000326035 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.37■■□□□ 1.65
NIM1K-201ENST00000326035 APLP2Q06481 763 aa25.37■■□□□ 1.65
NIM1K-201ENST00000326035 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
NIM1K-201ENST00000326035 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
NIM1K-201ENST00000326035 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.3■■□□□ 1.64
NIM1K-201ENST00000326035 SAMD9Q5K651 1589 aa25.3■■□□□ 1.64
NIM1K-201ENST00000326035 IQGAP2Q13576 1575 aa25.22■■□□□ 1.63
NIM1K-201ENST00000326035 TIAM1Q13009 1591 aa25.22■■□□□ 1.63
NIM1K-201ENST00000326035 GRIN2AQ12879 1464 aa25.2■■□□□ 1.63
NIM1K-201ENST00000326035 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.19■■□□□ 1.62
NIM1K-201ENST00000326035 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
NIM1K-201ENST00000326035 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
NIM1K-201ENST00000326035 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.17■■□□□ 1.62
NIM1K-201ENST00000326035 CEP170Q5SW79 1584 aa25.14■■□□□ 1.61
NIM1K-201ENST00000326035 FBLN2P98095 1184 aa25.12■■□□□ 1.61
NIM1K-201ENST00000326035 SYNJ2O15056 1496 aa25.12■■□□□ 1.61
NIM1K-201ENST00000326035 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
NIM1K-201ENST00000326035 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.11■■□□□ 1.61
NIM1K-201ENST00000326035 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.1■■□□□ 1.61
NIM1K-201ENST00000326035 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
NIM1K-201ENST00000326035 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
NIM1K-201ENST00000326035 MAP3K1Q13233 1512 aa25.08■■□□□ 1.61
NIM1K-201ENST00000326035 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.07■■□□□ 1.6
NIM1K-201ENST00000326035 FMN1Q68DA7 1419 aa25.07■■□□□ 1.6
NIM1K-201ENST00000326035 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.06■■□□□ 1.6
NIM1K-201ENST00000326035 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.05■■□□□ 1.6
NIM1K-201ENST00000326035 DISP1Q96F81 1524 aa25.01■■□□□ 1.59
NIM1K-201ENST00000326035 KIAA0556O60303 1618 aa25■■□□□ 1.59
NIM1K-201ENST00000326035 CHD1O14646 1710 aa24.99■■□□□ 1.59
NIM1K-201ENST00000326035 NUP160Q12769 1436 aa24.96■■□□□ 1.59
NIM1K-201ENST00000326035 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
NIM1K-201ENST00000326035 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.94■■□□□ 1.58
NIM1K-201ENST00000326035 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
NIM1K-201ENST00000326035 ARID3CA6NKF2 412 aa24.9■■□□□ 1.58
NIM1K-201ENST00000326035 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.89■■□□□ 1.57
NIM1K-201ENST00000326035 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.88■■□□□ 1.57
NIM1K-201ENST00000326035 HECW1Q76N89 1606 aa24.87■■□□□ 1.57
NIM1K-201ENST00000326035 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
NIM1K-201ENST00000326035 JPH4Q96JJ6 628 aa24.83■■□□□ 1.56
NIM1K-201ENST00000326035 ITGAEP38570 1179 aa24.82■■□□□ 1.56
NIM1K-201ENST00000326035 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
NIM1K-201ENST00000326035 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.8■■□□□ 1.56
NIM1K-201ENST00000326035 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.79■■□□□ 1.56
NIM1K-201ENST00000326035 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
NIM1K-201ENST00000326035 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.76■■□□□ 1.55
NIM1K-201ENST00000326035 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
NIM1K-201ENST00000326035 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
NIM1K-201ENST00000326035 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.74■■□□□ 1.55
NIM1K-201ENST00000326035 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.74■■□□□ 1.55
NIM1K-201ENST00000326035 NCOA2Q15596 1464 aa24.73■■□□□ 1.55
NIM1K-201ENST00000326035 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
NIM1K-201ENST00000326035 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.69■■□□□ 1.54
NIM1K-201ENST00000326035 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
NIM1K-201ENST00000326035 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.66■■□□□ 1.54
NIM1K-201ENST00000326035 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.66■■□□□ 1.54
NIM1K-201ENST00000326035 ARHGEF11O15085 1522 aa24.65■■□□□ 1.54
NIM1K-201ENST00000326035 SHROOM2Q13796 1616 aa24.63■■□□□ 1.53
NIM1K-201ENST00000326035 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.6■■□□□ 1.53
NIM1K-201ENST00000326035 ABCA8O94911 1581 aa24.59■■□□□ 1.53
NIM1K-201ENST00000326035 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.56■■□□□ 1.52
NIM1K-201ENST00000326035 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.55■■□□□ 1.52
NIM1K-201ENST00000326035 PTPRKQ15262 1439 aa24.53■■□□□ 1.52
NIM1K-201ENST00000326035 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
NIM1K-201ENST00000326035 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.52■■□□□ 1.51
NIM1K-201ENST00000326035 KIF14Q15058 1648 aa24.51■■□□□ 1.51
NIM1K-201ENST00000326035 PTPRGP23470 1445 aa24.49■■□□□ 1.51
NIM1K-201ENST00000326035 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
NIM1K-201ENST00000326035 ATP10BO94823 1461 aa24.46■■□□□ 1.51
NIM1K-201ENST00000326035 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.45■■□□□ 1.5
NIM1K-201ENST00000326035 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
NIM1K-201ENST00000326035 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
NIM1K-201ENST00000326035 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.41■■□□□ 1.5
NIM1K-201ENST00000326035 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
NIM1K-201ENST00000326035 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
NIM1K-201ENST00000326035 UACAQ9BZF9 1416 aa24.35■■□□□ 1.49
NIM1K-201ENST00000326035 MIA2Q96PC5 1412 aa24.35■■□□□ 1.49
NIM1K-201ENST00000326035 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.34■■□□□ 1.49
NIM1K-201ENST00000326035 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.34■■□□□ 1.49
NIM1K-201ENST00000326035 MAPKBP1O60336 1514 aa24.33■■□□□ 1.48
NIM1K-201ENST00000326035 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
NIM1K-201ENST00000326035 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.31■■□□□ 1.48
NIM1K-201ENST00000326035 ABCC2Q92887 1545 aa24.29■■□□□ 1.48
NIM1K-201ENST00000326035 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.29■■□□□ 1.48
NIM1K-201ENST00000326035 NAIPQ13075 1403 aa24.28■■□□□ 1.48
NIM1K-201ENST00000326035 HFM1A2PYH4 1435 aa24.28■■□□□ 1.48
NIM1K-201ENST00000326035 KDM6BO15054 1643 aa24.28■■□□□ 1.48
NIM1K-201ENST00000326035 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.28■■□□□ 1.48
NIM1K-201ENST00000326035 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.27■■□□□ 1.48
NIM1K-201ENST00000326035 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
NIM1K-201ENST00000326035 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.25■■□□□ 1.47
NIM1K-201ENST00000326035 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.24■■□□□ 1.47
NIM1K-201ENST00000326035 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
NIM1K-201ENST00000326035 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
NIM1K-201ENST00000326035 DAPK1P53355 1430 aa24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms