RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 IFT140Q96RY7 1462 aa17.31■□□□□ 0.36
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PGA3-201ENST00000325558 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.28■□□□□ 0.36
PGA3-201ENST00000325558 SAMD9Q5K651 1589 aa17.28■□□□□ 0.36
PGA3-201ENST00000325558 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
PGA3-201ENST00000325558 TIAM1Q13009 1591 aa17.27■□□□□ 0.36
PGA3-201ENST00000325558 ADAMTS12P58397 1594 aa17.26■□□□□ 0.35
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PGA3-201ENST00000325558 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa17.21■□□□□ 0.35
PGA3-201ENST00000325558 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa17.2■□□□□ 0.34
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PGA3-201ENST00000325558 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa16.58■□□□□ 0.24
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PGA3-201ENST00000325558 ABCC5O15440 1437 aa16.57■□□□□ 0.24
PGA3-201ENST00000325558 ROCK1Q13464 1354 aa16.57■□□□□ 0.24
PGA3-201ENST00000325558 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.56■□□□□ 0.24
PGA3-201ENST00000325558 DAPK1P53355 1430 aa16.55■□□□□ 0.24
PGA3-201ENST00000325558 KDM6BO15054 1643 aa16.53■□□□□ 0.24
PGA3-201ENST00000325558 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
PGA3-201ENST00000325558 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16.53■□□□□ 0.24
PGA3-201ENST00000325558 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
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