RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318561.7

SFTPC-201, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFTPC, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-201ENST00000318561 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
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SFTPC-201ENST00000318561 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.1■■■□□ 2.25
SFTPC-201ENST00000318561 DIP2BQ9P265 1576 aa29.09■■■□□ 2.25
SFTPC-201ENST00000318561 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.06■■■□□ 2.24
SFTPC-201ENST00000318561 MAPKBP1O60336 1514 aa29.05■■■□□ 2.24
SFTPC-201ENST00000318561 JPH4Q96JJ6 628 aa29.04■■■□□ 2.24
SFTPC-201ENST00000318561 ADGRL1O94910 1474 aa28.91■■■□□ 2.22
SFTPC-201ENST00000318561 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.9■■■□□ 2.22
SFTPC-201ENST00000318561 TSPOAP1O95153 1857 aa28.87■■■□□ 2.21
SFTPC-201ENST00000318561 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.85■■■□□ 2.21
SFTPC-201ENST00000318561 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.83■■■□□ 2.21
SFTPC-201ENST00000318561 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.76■■■□□ 2.19
SFTPC-201ENST00000318561 KIF27Q86VH2 1401 aa28.69■■■□□ 2.18
SFTPC-201ENST00000318561 FBXO41Q8TF61 875 aa28.67■■■□□ 2.18
SFTPC-201ENST00000318561 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
SFTPC-201ENST00000318561 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
SFTPC-201ENST00000318561 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
SFTPC-201ENST00000318561 ASXL2Q76L83 1435 aa28.54■■■□□ 2.16
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SFTPC-201ENST00000318561 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.53■■■□□ 2.16
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SFTPC-201ENST00000318561 GLI2P10070 1586 aa28.52■■■□□ 2.16
SFTPC-201ENST00000318561 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.5■■■□□ 2.15
SFTPC-201ENST00000318561 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.5■■■□□ 2.15
SFTPC-201ENST00000318561 CUL7Q14999 1698 aa28.5■■■□□ 2.15
SFTPC-201ENST00000318561 ABCC2Q92887 1545 aa28.49■■■□□ 2.15
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SFTPC-201ENST00000318561 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.36■■■□□ 2.13
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SFTPC-201ENST00000318561 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.34■■■□□ 2.13
SFTPC-201ENST00000318561 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.31■■■□□ 2.12
SFTPC-201ENST00000318561 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.29■■■□□ 2.12
SFTPC-201ENST00000318561 EEA1Q15075 1411 aa28.27■■■□□ 2.12
SFTPC-201ENST00000318561 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.27■■■□□ 2.12
SFTPC-201ENST00000318561 UACAQ9BZF9 1416 aa28.26■■■□□ 2.11
SFTPC-201ENST00000318561 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.24■■■□□ 2.11
SFTPC-201ENST00000318561 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.24■■■□□ 2.11
SFTPC-201ENST00000318561 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.19■■■□□ 2.1
SFTPC-201ENST00000318561 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.19■■■□□ 2.1
SFTPC-201ENST00000318561 PRXQ9BXM0 1461 aa28.17■■■□□ 2.1
SFTPC-201ENST00000318561 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
SFTPC-201ENST00000318561 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
SFTPC-201ENST00000318561 DISP1Q96F81 1524 aa28.07■■■□□ 2.08
SFTPC-201ENST00000318561 KIF21BO75037 1637 aa28.07■■■□□ 2.08
SFTPC-201ENST00000318561 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.05■■■□□ 2.08
SFTPC-201ENST00000318561 IQGAP2Q13576 1575 aa28.04■■■□□ 2.08
SFTPC-201ENST00000318561 PTPRMP28827 1452 aa28.03■■■□□ 2.08
SFTPC-201ENST00000318561 CD109Q6YHK3 1445 aa28.03■■■□□ 2.08
SFTPC-201ENST00000318561 ILDR2Q71H61 639 aa28.02■■■□□ 2.08
SFTPC-201ENST00000318561 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.02■■■□□ 2.08
SFTPC-201ENST00000318561 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.01■■■□□ 2.07
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SFTPC-201ENST00000318561 KCNH8Q96L42 1107 aa27.95■■■□□ 2.06
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SFTPC-201ENST00000318561 KIAA0556O60303 1618 aa27.82■■■□□ 2.04
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SFTPC-201ENST00000318561 HSPA2P54652 639 aa27.8■■■□□ 2.04
SFTPC-201ENST00000318561 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.75■■■□□ 2.03
SFTPC-201ENST00000318561 MADDQ8WXG6 1647 aa27.74■■■□□ 2.03
SFTPC-201ENST00000318561 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
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SFTPC-201ENST00000318561 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
SFTPC-201ENST00000318561 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.7■■■□□ 2.03
SFTPC-201ENST00000318561 ABCA8O94911 1581 aa27.66■■■□□ 2.02
SFTPC-201ENST00000318561 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.64■■■□□ 2.02
SFTPC-201ENST00000318561 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.62■■■□□ 2.01
SFTPC-201ENST00000318561 SAMD9Q5K651 1589 aa27.62■■■□□ 2.01
SFTPC-201ENST00000318561 ARID3CA6NKF2 412 aa27.6■■■□□ 2.01
SFTPC-201ENST00000318561 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
SFTPC-201ENST00000318561 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
SFTPC-201ENST00000318561 P3H3Q8IVL6 736 aa27.55■■■□□ 2
SFTPC-201ENST00000318561 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.54■■■□□ 2
SFTPC-201ENST00000318561 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.53■■■□□ 2
SFTPC-201ENST00000318561 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.52■■■□□ 2
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SFTPC-201ENST00000318561 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.34■■□□□ 1.97
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SFTPC-201ENST00000318561 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
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SFTPC-201ENST00000318561 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.33■■□□□ 1.96
SFTPC-201ENST00000318561 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.32■■□□□ 1.96
SFTPC-201ENST00000318561 CLIP1P30622 1438 aa27.31■■□□□ 1.96
SFTPC-201ENST00000318561 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.29■■□□□ 1.96
SFTPC-201ENST00000318561 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.28■■□□□ 1.96
SFTPC-201ENST00000318561 FMN1Q68DA7 1419 aa27.27■■□□□ 1.96
SFTPC-201ENST00000318561 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
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