RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314397.8

NHP2-202, Transcript of NHP2 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NHP2, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHP2-202ENST00000314397 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.81■■□□□ 1.4
NHP2-202ENST00000314397 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.68■■□□□ 1.38
NHP2-202ENST00000314397 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.38
NHP2-202ENST00000314397 MAPKBP1O60336 1514 aa23.67■■□□□ 1.38
NHP2-202ENST00000314397 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.66■■□□□ 1.38
NHP2-202ENST00000314397 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.66■■□□□ 1.38
NHP2-202ENST00000314397 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.66■■□□□ 1.38
NHP2-202ENST00000314397 IGF1RP08069 1367 aa23.65■■□□□ 1.38
NHP2-202ENST00000314397 KIF27Q86VH2 1401 aa23.64■■□□□ 1.37
NHP2-202ENST00000314397 CUL7Q14999 1698 aa23.64■■□□□ 1.37
NHP2-202ENST00000314397 DIP2BQ9P265 1576 aa23.61■■□□□ 1.37
NHP2-202ENST00000314397 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.5■■□□□ 1.35
NHP2-202ENST00000314397 PTPRGP23470 1445 aa23.48■■□□□ 1.35
NHP2-202ENST00000314397 KDM6BO15054 1643 aa23.48■■□□□ 1.35
NHP2-202ENST00000314397 TSPOAP1O95153 1857 aa23.46■■□□□ 1.35
NHP2-202ENST00000314397 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.43■■□□□ 1.34
NHP2-202ENST00000314397 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.42■■□□□ 1.34
NHP2-202ENST00000314397 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
NHP2-202ENST00000314397 IQGAP2Q13576 1575 aa23.4■■□□□ 1.34
NHP2-202ENST00000314397 ABCC2Q92887 1545 aa23.39■■□□□ 1.34
NHP2-202ENST00000314397 ASXL2Q76L83 1435 aa23.33■■□□□ 1.33
NHP2-202ENST00000314397 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.33■■□□□ 1.33
NHP2-202ENST00000314397 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.33■■□□□ 1.33
NHP2-202ENST00000314397 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.32■■□□□ 1.32
NHP2-202ENST00000314397 DISP1Q96F81 1524 aa23.31■■□□□ 1.32
NHP2-202ENST00000314397 UACAQ9BZF9 1416 aa23.31■■□□□ 1.32
NHP2-202ENST00000314397 GLI2P10070 1586 aa23.31■■□□□ 1.32
NHP2-202ENST00000314397 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
NHP2-202ENST00000314397 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.26■■□□□ 1.31
NHP2-202ENST00000314397 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.25■■□□□ 1.31
NHP2-202ENST00000314397 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.23■■□□□ 1.31
NHP2-202ENST00000314397 KIAA0556O60303 1618 aa23.2■■□□□ 1.3
NHP2-202ENST00000314397 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
NHP2-202ENST00000314397 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
NHP2-202ENST00000314397 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.18■■□□□ 1.3
NHP2-202ENST00000314397 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
NHP2-202ENST00000314397 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.12■■□□□ 1.29
NHP2-202ENST00000314397 ADGRL1O94910 1474 aa23.1■■□□□ 1.29
NHP2-202ENST00000314397 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.09■■□□□ 1.29
NHP2-202ENST00000314397 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.07■■□□□ 1.28
NHP2-202ENST00000314397 GOLGA3Q08378 1498 aa23.04■■□□□ 1.28
NHP2-202ENST00000314397 ABCA8O94911 1581 aa23.01■■□□□ 1.27
NHP2-202ENST00000314397 PRXQ9BXM0 1461 aa22.97■■□□□ 1.27
NHP2-202ENST00000314397 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.97■■□□□ 1.27
NHP2-202ENST00000314397 CD109Q6YHK3 1445 aa22.96■■□□□ 1.27
NHP2-202ENST00000314397 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.96■■□□□ 1.27
NHP2-202ENST00000314397 KCNH8Q96L42 1107 aa22.93■■□□□ 1.26
NHP2-202ENST00000314397 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.85■■□□□ 1.25
NHP2-202ENST00000314397 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
NHP2-202ENST00000314397 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
NHP2-202ENST00000314397 ATP10BO94823 1461 aa22.8■■□□□ 1.24
NHP2-202ENST00000314397 ARID3CA6NKF2 412 aa22.8■■□□□ 1.24
NHP2-202ENST00000314397 P3H3Q8IVL6 736 aa22.8■■□□□ 1.24
NHP2-202ENST00000314397 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.78■■□□□ 1.24
NHP2-202ENST00000314397 KIF21BO75037 1637 aa22.78■■□□□ 1.24
NHP2-202ENST00000314397 SAMD9Q5K651 1589 aa22.75■■□□□ 1.23
NHP2-202ENST00000314397 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.75■■□□□ 1.23
NHP2-202ENST00000314397 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.72■■□□□ 1.23
NHP2-202ENST00000314397 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.71■■□□□ 1.23
NHP2-202ENST00000314397 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.71■■□□□ 1.23
NHP2-202ENST00000314397 NEO1Q92859 1461 aa22.65■■□□□ 1.22
NHP2-202ENST00000314397 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
NHP2-202ENST00000314397 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
NHP2-202ENST00000314397 RAPGEF3O95398 923 aa22.63■■□□□ 1.21
NHP2-202ENST00000314397 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
NHP2-202ENST00000314397 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.61■■□□□ 1.21
NHP2-202ENST00000314397 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.59■■□□□ 1.21
NHP2-202ENST00000314397 EEA1Q15075 1411 aa22.58■■□□□ 1.21
NHP2-202ENST00000314397 PTPRMP28827 1452 aa22.58■■□□□ 1.2
NHP2-202ENST00000314397 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.57■■□□□ 1.2
NHP2-202ENST00000314397 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
NHP2-202ENST00000314397 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.54■■□□□ 1.2
NHP2-202ENST00000314397 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.52■■□□□ 1.2
NHP2-202ENST00000314397 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
NHP2-202ENST00000314397 MADDQ8WXG6 1647 aa22.49■■□□□ 1.19
NHP2-202ENST00000314397 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
NHP2-202ENST00000314397 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.48■■□□□ 1.19
NHP2-202ENST00000314397 RICTORQ6R327 1708 aa22.48■■□□□ 1.19
NHP2-202ENST00000314397 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.47■■□□□ 1.19
NHP2-202ENST00000314397 AKNAQ7Z591 1439 aa22.47■■□□□ 1.19
NHP2-202ENST00000314397 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.199e-7■■■□□ 17.5
NHP2-202ENST00000314397 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.46■■□□□ 1.19
NHP2-202ENST00000314397 FANCAO15360 1455 aa22.46■■□□□ 1.19
NHP2-202ENST00000314397 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.43■■□□□ 1.18
NHP2-202ENST00000314397 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
NHP2-202ENST00000314397 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
NHP2-202ENST00000314397 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.4■■□□□ 1.18
NHP2-202ENST00000314397 FBXO41Q8TF61 875 aa22.39■■□□□ 1.17
NHP2-202ENST00000314397 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.39■■□□□ 1.17
NHP2-202ENST00000314397 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
NHP2-202ENST00000314397 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.36■■□□□ 1.17
NHP2-202ENST00000314397 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.34■■□□□ 1.17
NHP2-202ENST00000314397 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.34■■□□□ 1.17
NHP2-202ENST00000314397 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.34■■□□□ 1.17
NHP2-202ENST00000314397 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.34■■□□□ 1.17
NHP2-202ENST00000314397 HECW1Q76N89 1606 aa22.32■■□□□ 1.16
NHP2-202ENST00000314397 PLCH2O75038 1416 aa22.31■■□□□ 1.16
NHP2-202ENST00000314397 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.3■■□□□ 1.16
NHP2-202ENST00000314397 FMN1Q68DA7 1419 aa22.27■■□□□ 1.16
NHP2-202ENST00000314397 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms