RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312221.9

SLC22A18-201, Transcript of solute carrier family 22 member 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC22A18, Length 1,628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A18-201ENST00000312221 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.63■■■■□ 3.45
SLC22A18-201ENST00000312221 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.51■■■■□ 3.44
SLC22A18-201ENST00000312221 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.5■■■■□ 3.43
SLC22A18-201ENST00000312221 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
SLC22A18-201ENST00000312221 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
SLC22A18-201ENST00000312221 SAMD9Q5K651 1589 aa36.34■■■■□ 3.41
SLC22A18-201ENST00000312221 GRIN2AQ12879 1464 aa36.32■■■■□ 3.4
SLC22A18-201ENST00000312221 IQGAP2Q13576 1575 aa36.32■■■■□ 3.4
SLC22A18-201ENST00000312221 APLP2Q06481 763 aa36.3■■■■□ 3.4
SLC22A18-201ENST00000312221 SYNJ2O15056 1496 aa36.29■■■■□ 3.4
SLC22A18-201ENST00000312221 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.23■■■■□ 3.39
SLC22A18-201ENST00000312221 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
SLC22A18-201ENST00000312221 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
SLC22A18-201ENST00000312221 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.15■■■■□ 3.38
SLC22A18-201ENST00000312221 FMN1Q68DA7 1419 aa36.12■■■■□ 3.37
SLC22A18-201ENST00000312221 MAP3K1Q13233 1512 aa36.12■■■■□ 3.37
SLC22A18-201ENST00000312221 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.12■■■■□ 3.37
SLC22A18-201ENST00000312221 P3H3Q8IVL6 736 aa36.12■■■■□ 3.37
SLC22A18-201ENST00000312221 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.11■■■■□ 3.37
SLC22A18-201ENST00000312221 CEP170Q5SW79 1584 aa36.1■■■■□ 3.37
SLC22A18-201ENST00000312221 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
SLC22A18-201ENST00000312221 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.07■■■■□ 3.37
SLC22A18-201ENST00000312221 TIAM1Q13009 1591 aa36.07■■■■□ 3.36
SLC22A18-201ENST00000312221 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.05■■■■□ 3.36
SLC22A18-201ENST00000312221 NUP160Q12769 1436 aa36.03■■■■□ 3.36
SLC22A18-201ENST00000312221 KIAA0556O60303 1618 aa35.96■■■■□ 3.35
SLC22A18-201ENST00000312221 FBLN2P98095 1184 aa35.94■■■■□ 3.34
SLC22A18-201ENST00000312221 CHD1O14646 1710 aa35.94■■■■□ 3.34
SLC22A18-201ENST00000312221 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
SLC22A18-201ENST00000312221 DISP1Q96F81 1524 aa35.89■■■■□ 3.34
SLC22A18-201ENST00000312221 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.85■■■■□ 3.33
SLC22A18-201ENST00000312221 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.82■■■■□ 3.33
SLC22A18-201ENST00000312221 HECW1Q76N89 1606 aa35.8■■■■□ 3.32
SLC22A18-201ENST00000312221 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
SLC22A18-201ENST00000312221 HRCP23327 699 aa35.72■■■■□ 3.31
SLC22A18-201ENST00000312221 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.72■■■■□ 3.31
SLC22A18-201ENST00000312221 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.7■■■■□ 3.31
SLC22A18-201ENST00000312221 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
SLC22A18-201ENST00000312221 JPH4Q96JJ6 628 aa35.65■■■■□ 3.3
SLC22A18-201ENST00000312221 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.62■■■■□ 3.29
SLC22A18-201ENST00000312221 SHROOM2Q13796 1616 aa35.59■■■■□ 3.29
SLC22A18-201ENST00000312221 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.59■■■■□ 3.29
SLC22A18-201ENST00000312221 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
SLC22A18-201ENST00000312221 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.54■■■■□ 3.28
SLC22A18-201ENST00000312221 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.52■■■■□ 3.28
SLC22A18-201ENST00000312221 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
SLC22A18-201ENST00000312221 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.49■■■■□ 3.27
SLC22A18-201ENST00000312221 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
SLC22A18-201ENST00000312221 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.48■■■■□ 3.27
SLC22A18-201ENST00000312221 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
SLC22A18-201ENST00000312221 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
SLC22A18-201ENST00000312221 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.45■■■■□ 3.27
SLC22A18-201ENST00000312221 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.4■■■■□ 3.26
SLC22A18-201ENST00000312221 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
SLC22A18-201ENST00000312221 ABCA8O94911 1581 aa35.4■■■■□ 3.26
SLC22A18-201ENST00000312221 NCOA2Q15596 1464 aa35.38■■■■□ 3.25
SLC22A18-201ENST00000312221 ARHGEF11O15085 1522 aa35.36■■■■□ 3.25
SLC22A18-201ENST00000312221 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
SLC22A18-201ENST00000312221 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.28■■■■□ 3.24
SLC22A18-201ENST00000312221 PTPRGP23470 1445 aa35.27■■■■□ 3.24
SLC22A18-201ENST00000312221 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.26■■■■□ 3.24
SLC22A18-201ENST00000312221 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.26■■■■□ 3.232e-6■■□□□ 13.2
SLC22A18-201ENST00000312221 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
SLC22A18-201ENST00000312221 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.23■■■■□ 3.23
SLC22A18-201ENST00000312221 ARID3CA6NKF2 412 aa35.22■■■■□ 3.23
SLC22A18-201ENST00000312221 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
SLC22A18-201ENST00000312221 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
SLC22A18-201ENST00000312221 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.16■■■■□ 3.22
SLC22A18-201ENST00000312221 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
SLC22A18-201ENST00000312221 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
SLC22A18-201ENST00000312221 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.13■■■■□ 3.21
SLC22A18-201ENST00000312221 UACAQ9BZF9 1416 aa35.1■■■■□ 3.21
SLC22A18-201ENST00000312221 ATP10BO94823 1461 aa35.09■■■■□ 3.21
SLC22A18-201ENST00000312221 ABCC2Q92887 1545 aa35.06■■■■□ 3.2
SLC22A18-201ENST00000312221 MIA2Q96PC5 1412 aa35.05■■■■□ 3.2
SLC22A18-201ENST00000312221 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
SLC22A18-201ENST00000312221 ITGAEP38570 1179 aa35.05■■■■□ 3.2
SLC22A18-201ENST00000312221 KIF14Q15058 1648 aa35.02■■■■□ 3.2
SLC22A18-201ENST00000312221 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.02■■■■□ 3.2
SLC22A18-201ENST00000312221 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.94■■■■□ 3.18
SLC22A18-201ENST00000312221 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.91■■■■□ 3.18
SLC22A18-201ENST00000312221 OSCARQ8IYS5 282 aa34.9■■■■□ 3.18
SLC22A18-201ENST00000312221 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.88■■■■□ 3.17
SLC22A18-201ENST00000312221 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34.85■■■■□ 3.17
SLC22A18-201ENST00000312221 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.84■■■■□ 3.17
SLC22A18-201ENST00000312221 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.84■■■■□ 3.17
SLC22A18-201ENST00000312221 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
SLC22A18-201ENST00000312221 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
SLC22A18-201ENST00000312221 PTPRKQ15262 1439 aa34.81■■■■□ 3.16
SLC22A18-201ENST00000312221 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.8■■■■□ 3.16
SLC22A18-201ENST00000312221 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
SLC22A18-201ENST00000312221 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
SLC22A18-201ENST00000312221 HFM1A2PYH4 1435 aa34.76■■■■□ 3.15
SLC22A18-201ENST00000312221 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.74■■■■□ 3.15
SLC22A18-201ENST00000312221 CLSPNQ9HAW4 1339 aa34.72■■■■□ 3.15
SLC22A18-201ENST00000312221 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.72■■■■□ 3.15
SLC22A18-201ENST00000312221 AKNAQ7Z591 1439 aa34.72■■■■□ 3.15
SLC22A18-201ENST00000312221 PREX2Q70Z35 1606 aa34.69■■■■□ 3.14
SLC22A18-201ENST00000312221 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
SLC22A18-201ENST00000312221 DAPK1P53355 1430 aa34.67■■■■□ 3.14
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