RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301944.2

NXNL1-201, Transcript of nucleoredoxin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NXNL1, Length 946 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1-201ENST00000301944 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.23■■■■■ 4.99
NXNL1-201ENST00000301944 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP46.02■■■■■ 4.96
NXNL1-201ENST00000301944 IGF1RP08069 1367 aa45.98■■■■■ 4.95
NXNL1-201ENST00000301944 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.98■■■■■ 4.95
NXNL1-201ENST00000301944 ABCC10Q5T3U5 1492 aa45.96■■■■■ 4.95
NXNL1-201ENST00000301944 KIF27Q86VH2 1401 aa45.95■■■■■ 4.95
NXNL1-201ENST00000301944 MAPKBP1O60336 1514 aa45.94■■■■■ 4.95
NXNL1-201ENST00000301944 FAM69CQ0P6D2 419 aa45.94■■■■■ 4.94
NXNL1-201ENST00000301944 CUL7Q14999 1698 aa45.92■■■■■ 4.94
NXNL1-201ENST00000301944 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.92■■■■■ 4.94
NXNL1-201ENST00000301944 DIP2BQ9P265 1576 aa45.82■■■■■ 4.93
NXNL1-201ENST00000301944 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.68■■■■■ 4.9
NXNL1-201ENST00000301944 PTPRGP23470 1445 aa45.63■■■■■ 4.9
NXNL1-201ENST00000301944 TSPOAP1O95153 1857 aa45.56■■■■■ 4.88
NXNL1-201ENST00000301944 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.54■■■■■ 4.88
NXNL1-201ENST00000301944 KDM6BO15054 1643 aa45.54■■■■■ 4.88
NXNL1-201ENST00000301944 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.51■■■■■ 4.88
NXNL1-201ENST00000301944 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.5■■■■■ 4.87
NXNL1-201ENST00000301944 IQGAP2Q13576 1575 aa45.46■■■■■ 4.87
NXNL1-201ENST00000301944 ABCC2Q92887 1545 aa45.43■■■■■ 4.86
NXNL1-201ENST00000301944 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa45.32■■■■■ 4.85
NXNL1-201ENST00000301944 ASXL2Q76L83 1435 aa45.32■■■■■ 4.85
NXNL1-201ENST00000301944 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.31■■■■■ 4.84
NXNL1-201ENST00000301944 DISP1Q96F81 1524 aa45.27■■■■■ 4.84
NXNL1-201ENST00000301944 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa45.27■■■■■ 4.84
NXNL1-201ENST00000301944 UACAQ9BZF9 1416 aa45.26■■■■■ 4.84
NXNL1-201ENST00000301944 GLI2P10070 1586 aa45.25■■■■■ 4.83
NXNL1-201ENST00000301944 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.21■■■■■ 4.83
NXNL1-201ENST00000301944 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP45.18■■■■■ 4.82
NXNL1-201ENST00000301944 UGGT2Q9NYU1 1516 aa45.17■■■■■ 4.82
NXNL1-201ENST00000301944 KDM5BQ9UGL1 1544 aa45.11■■■■■ 4.81
NXNL1-201ENST00000301944 KIAA0556O60303 1618 aa45.05■■■■■ 4.8
NXNL1-201ENST00000301944 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP45.04■■■■■ 4.8
NXNL1-201ENST00000301944 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP45.01■■■■■ 4.8
NXNL1-201ENST00000301944 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.99■■■■■ 4.79
NXNL1-201ENST00000301944 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP44.91■■■■■ 4.78
NXNL1-201ENST00000301944 TEX14Q8IWB6 1497 aa44.9■■■■■ 4.78
NXNL1-201ENST00000301944 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.87■■■■■ 4.77
NXNL1-201ENST00000301944 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.81■■■■■ 4.76
NXNL1-201ENST00000301944 ADGRL1O94910 1474 aa44.8■■■■■ 4.76
NXNL1-201ENST00000301944 GOLGA3Q08378 1498 aa44.78■■■■■ 4.76
NXNL1-201ENST00000301944 ABCA8O94911 1581 aa44.68■■■■■ 4.74
NXNL1-201ENST00000301944 PRXQ9BXM0 1461 aa44.64■■■■■ 4.74
NXNL1-201ENST00000301944 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.6■■■■■ 4.73
NXNL1-201ENST00000301944 CD109Q6YHK3 1445 aa44.59■■■■■ 4.73
NXNL1-201ENST00000301944 KCNH8Q96L42 1107 aa44.58■■■■■ 4.73
NXNL1-201ENST00000301944 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa44.58■■■■■ 4.73
NXNL1-201ENST00000301944 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
NXNL1-201ENST00000301944 P3H3Q8IVL6 736 aa44.33■■■■■ 4.69
NXNL1-201ENST00000301944 ATP10BO94823 1461 aa44.32■■■■■ 4.69
NXNL1-201ENST00000301944 HECW2Q9P2P5 1572 aa44.31■■■■■ 4.68
NXNL1-201ENST00000301944 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP44.3■■■■■ 4.68
NXNL1-201ENST00000301944 ARID3CA6NKF2 412 aa44.29■■■■■ 4.68
NXNL1-201ENST00000301944 ARAP3Q8WWN8 1544 aa44.25■■■■■ 4.67
NXNL1-201ENST00000301944 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.2■■■■■ 4.67
NXNL1-201ENST00000301944 SAMD9Q5K651 1589 aa44.19■■■■■ 4.66
NXNL1-201ENST00000301944 KIF21BO75037 1637 aa44.19■■■■■ 4.66
NXNL1-201ENST00000301944 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44.17■■■■■ 4.66
NXNL1-201ENST00000301944 PHLDB1Q86UU1 1377 aa44.14■■■■■ 4.66
NXNL1-201ENST00000301944 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.12■■■■■ 4.65
NXNL1-201ENST00000301944 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.01■■■■■ 4.64
NXNL1-201ENST00000301944 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
NXNL1-201ENST00000301944 NEO1Q92859 1461 aa44■■■■■ 4.63
NXNL1-201ENST00000301944 RAPGEF3O95398 923 aa43.96■■■■■ 4.63
NXNL1-201ENST00000301944 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.95■■■■■ 4.63
NXNL1-201ENST00000301944 EEA1Q15075 1411 aa43.94■■■■■ 4.62
NXNL1-201ENST00000301944 ADAMTSL3P82987 1691 aa43.88■■■■■ 4.62
NXNL1-201ENST00000301944 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.88■■■■■ 4.62
NXNL1-201ENST00000301944 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.87■■■■■ 4.61
NXNL1-201ENST00000301944 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.83■■■■■ 4.61
NXNL1-201ENST00000301944 PTPRMP28827 1452 aa43.82■■■■■ 4.6
NXNL1-201ENST00000301944 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.79■■■■■ 4.6
NXNL1-201ENST00000301944 BCORL1Q5H9F3 1711 aa43.74■■■■■ 4.59
NXNL1-201ENST00000301944 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP43.71■■■■■ 4.59
NXNL1-201ENST00000301944 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.68■■■■■ 4.58
NXNL1-201ENST00000301944 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.68■■■■■ 4.58
NXNL1-201ENST00000301944 AKNAQ7Z591 1439 aa43.65■■■■■ 4.58
NXNL1-201ENST00000301944 RICTORQ6R327 1708 aa43.65■■■■■ 4.58
NXNL1-201ENST00000301944 MADDQ8WXG6 1647 aa43.64■■■■■ 4.58
NXNL1-201ENST00000301944 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.63■■■■■ 4.58
NXNL1-201ENST00000301944 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.63■■■■■ 4.58
NXNL1-201ENST00000301944 FANCAO15360 1455 aa43.63■■■■■ 4.57
NXNL1-201ENST00000301944 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa43.63■■■■■ 4.57
NXNL1-201ENST00000301944 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.55■■■■■ 4.56
NXNL1-201ENST00000301944 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa43.49■■■■■ 4.55
NXNL1-201ENST00000301944 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
NXNL1-201ENST00000301944 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP43.48■■■■■ 4.55
NXNL1-201ENST00000301944 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.48■■■■■ 4.55
NXNL1-201ENST00000301944 FBXO41Q8TF61 875 aa43.45■■■■■ 4.55
NXNL1-201ENST00000301944 LMTK3Q96Q04 1460 aa43.44■■■■■ 4.54
NXNL1-201ENST00000301944 POGZQ7Z3K3 1410 aa43.41■■■■■ 4.54
NXNL1-201ENST00000301944 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa43.41■■■■■ 4.54
NXNL1-201ENST00000301944 MAGI2Q86UL8 1455 aa43.39■■■■■ 4.54
NXNL1-201ENST00000301944 YEATS2Q9ULM3 1422 aa43.39■■■■■ 4.54
NXNL1-201ENST00000301944 PLCH2O75038 1416 aa43.37■■■■■ 4.53
NXNL1-201ENST00000301944 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa43.34■■■■■ 4.53
NXNL1-201ENST00000301944 HECW1Q76N89 1606 aa43.33■■■■■ 4.53
NXNL1-201ENST00000301944 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.32■■■■■ 4.53
NXNL1-201ENST00000301944 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.53
NXNL1-201ENST00000301944 FMN1Q68DA7 1419 aa43.31■■■■■ 4.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms