RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301944.2

NXNL1-201, Transcript of nucleoredoxin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NXNL1, Length 946 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1-201ENST00000301944 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.23■■■■■ 4.99
NXNL1-201ENST00000301944 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP46.02■■■■■ 4.96
NXNL1-201ENST00000301944 IGF1RP08069 1367 aa45.98■■■■■ 4.95
NXNL1-201ENST00000301944 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.98■■■■■ 4.95
NXNL1-201ENST00000301944 ABCC10Q5T3U5 1492 aa45.96■■■■■ 4.95
NXNL1-201ENST00000301944 KIF27Q86VH2 1401 aa45.95■■■■■ 4.95
NXNL1-201ENST00000301944 MAPKBP1O60336 1514 aa45.94■■■■■ 4.95
NXNL1-201ENST00000301944 FAM69CQ0P6D2 419 aa45.94■■■■■ 4.94
NXNL1-201ENST00000301944 CUL7Q14999 1698 aa45.92■■■■■ 4.94
NXNL1-201ENST00000301944 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.92■■■■■ 4.94
NXNL1-201ENST00000301944 DIP2BQ9P265 1576 aa45.82■■■■■ 4.93
NXNL1-201ENST00000301944 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.68■■■■■ 4.9
NXNL1-201ENST00000301944 PTPRGP23470 1445 aa45.63■■■■■ 4.9
NXNL1-201ENST00000301944 TSPOAP1O95153 1857 aa45.56■■■■■ 4.88
NXNL1-201ENST00000301944 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.54■■■■■ 4.88
NXNL1-201ENST00000301944 KDM6BO15054 1643 aa45.54■■■■■ 4.88
NXNL1-201ENST00000301944 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.51■■■■■ 4.88
NXNL1-201ENST00000301944 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.5■■■■■ 4.87
NXNL1-201ENST00000301944 IQGAP2Q13576 1575 aa45.46■■■■■ 4.87
NXNL1-201ENST00000301944 ABCC2Q92887 1545 aa45.43■■■■■ 4.86
NXNL1-201ENST00000301944 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa45.32■■■■■ 4.85
NXNL1-201ENST00000301944 ASXL2Q76L83 1435 aa45.32■■■■■ 4.85
NXNL1-201ENST00000301944 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.31■■■■■ 4.84
NXNL1-201ENST00000301944 DISP1Q96F81 1524 aa45.27■■■■■ 4.84
NXNL1-201ENST00000301944 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa45.27■■■■■ 4.84
NXNL1-201ENST00000301944 UACAQ9BZF9 1416 aa45.26■■■■■ 4.84
NXNL1-201ENST00000301944 GLI2P10070 1586 aa45.25■■■■■ 4.83
NXNL1-201ENST00000301944 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.21■■■■■ 4.83
NXNL1-201ENST00000301944 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP45.18■■■■■ 4.82
NXNL1-201ENST00000301944 UGGT2Q9NYU1 1516 aa45.17■■■■■ 4.82
NXNL1-201ENST00000301944 KDM5BQ9UGL1 1544 aa45.11■■■■■ 4.81
NXNL1-201ENST00000301944 KIAA0556O60303 1618 aa45.05■■■■■ 4.8
NXNL1-201ENST00000301944 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP45.04■■■■■ 4.8
NXNL1-201ENST00000301944 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP45.01■■■■■ 4.8
NXNL1-201ENST00000301944 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.99■■■■■ 4.79
NXNL1-201ENST00000301944 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP44.91■■■■■ 4.78
NXNL1-201ENST00000301944 TEX14Q8IWB6 1497 aa44.9■■■■■ 4.78
NXNL1-201ENST00000301944 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.87■■■■■ 4.77
NXNL1-201ENST00000301944 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.81■■■■■ 4.76
NXNL1-201ENST00000301944 ADGRL1O94910 1474 aa44.8■■■■■ 4.76
NXNL1-201ENST00000301944 GOLGA3Q08378 1498 aa44.78■■■■■ 4.76
NXNL1-201ENST00000301944 ABCA8O94911 1581 aa44.68■■■■■ 4.74
NXNL1-201ENST00000301944 PRXQ9BXM0 1461 aa44.64■■■■■ 4.74
NXNL1-201ENST00000301944 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.6■■■■■ 4.73
NXNL1-201ENST00000301944 CD109Q6YHK3 1445 aa44.59■■■■■ 4.73
NXNL1-201ENST00000301944 KCNH8Q96L42 1107 aa44.58■■■■■ 4.73
NXNL1-201ENST00000301944 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa44.58■■■■■ 4.73
NXNL1-201ENST00000301944 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
NXNL1-201ENST00000301944 P3H3Q8IVL6 736 aa44.33■■■■■ 4.69
NXNL1-201ENST00000301944 ATP10BO94823 1461 aa44.32■■■■■ 4.69
NXNL1-201ENST00000301944 HECW2Q9P2P5 1572 aa44.31■■■■■ 4.68
NXNL1-201ENST00000301944 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP44.3■■■■■ 4.68
NXNL1-201ENST00000301944 ARID3CA6NKF2 412 aa44.29■■■■■ 4.68
NXNL1-201ENST00000301944 ARAP3Q8WWN8 1544 aa44.25■■■■■ 4.67
NXNL1-201ENST00000301944 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.2■■■■■ 4.67
NXNL1-201ENST00000301944 SAMD9Q5K651 1589 aa44.19■■■■■ 4.66
NXNL1-201ENST00000301944 KIF21BO75037 1637 aa44.19■■■■■ 4.66
NXNL1-201ENST00000301944 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44.17■■■■■ 4.66
NXNL1-201ENST00000301944 PHLDB1Q86UU1 1377 aa44.14■■■■■ 4.66
NXNL1-201ENST00000301944 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.12■■■■■ 4.65
NXNL1-201ENST00000301944 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP44.01■■■■■ 4.64
NXNL1-201ENST00000301944 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
NXNL1-201ENST00000301944 NEO1Q92859 1461 aa44■■■■■ 4.63
NXNL1-201ENST00000301944 RAPGEF3O95398 923 aa43.96■■■■■ 4.63
NXNL1-201ENST00000301944 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.95■■■■■ 4.63
NXNL1-201ENST00000301944 EEA1Q15075 1411 aa43.94■■■■■ 4.62
NXNL1-201ENST00000301944 ADAMTSL3P82987 1691 aa43.88■■■■■ 4.62
NXNL1-201ENST00000301944 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.88■■■■■ 4.62
NXNL1-201ENST00000301944 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.87■■■■■ 4.61
NXNL1-201ENST00000301944 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.83■■■■■ 4.61
NXNL1-201ENST00000301944 PTPRMP28827 1452 aa43.82■■■■■ 4.6
NXNL1-201ENST00000301944 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.79■■■■■ 4.6
NXNL1-201ENST00000301944 BCORL1Q5H9F3 1711 aa43.74■■■■■ 4.59
NXNL1-201ENST00000301944 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP43.71■■■■■ 4.59
NXNL1-201ENST00000301944 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.68■■■■■ 4.58
NXNL1-201ENST00000301944 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.68■■■■■ 4.58
NXNL1-201ENST00000301944 AKNAQ7Z591 1439 aa43.65■■■■■ 4.58
NXNL1-201ENST00000301944 RICTORQ6R327 1708 aa43.65■■■■■ 4.58
NXNL1-201ENST00000301944 MADDQ8WXG6 1647 aa43.64■■■■■ 4.58
NXNL1-201ENST00000301944 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.63■■■■■ 4.58
NXNL1-201ENST00000301944 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.63■■■■■ 4.58
NXNL1-201ENST00000301944 FANCAO15360 1455 aa43.63■■■■■ 4.57
NXNL1-201ENST00000301944 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa43.63■■■■■ 4.57
NXNL1-201ENST00000301944 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.55■■■■■ 4.56
NXNL1-201ENST00000301944 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa43.49■■■■■ 4.55
NXNL1-201ENST00000301944 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
NXNL1-201ENST00000301944 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP43.48■■■■■ 4.55
NXNL1-201ENST00000301944 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.48■■■■■ 4.55
NXNL1-201ENST00000301944 FBXO41Q8TF61 875 aa43.45■■■■■ 4.55
NXNL1-201ENST00000301944 LMTK3Q96Q04 1460 aa43.44■■■■■ 4.54
NXNL1-201ENST00000301944 POGZQ7Z3K3 1410 aa43.41■■■■■ 4.54
NXNL1-201ENST00000301944 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa43.41■■■■■ 4.54
NXNL1-201ENST00000301944 MAGI2Q86UL8 1455 aa43.39■■■■■ 4.54
NXNL1-201ENST00000301944 YEATS2Q9ULM3 1422 aa43.39■■■■■ 4.54
NXNL1-201ENST00000301944 PLCH2O75038 1416 aa43.37■■■■■ 4.53
NXNL1-201ENST00000301944 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa43.34■■■■■ 4.53
NXNL1-201ENST00000301944 HECW1Q76N89 1606 aa43.33■■■■■ 4.53
NXNL1-201ENST00000301944 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.32■■■■■ 4.53
NXNL1-201ENST00000301944 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.53
NXNL1-201ENST00000301944 FMN1Q68DA7 1419 aa43.31■■■■■ 4.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms