RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
MESP1-201ENST00000300057 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.44■■■□□ 2.78
MESP1-201ENST00000300057 P3H3Q8IVL6 736 aa32.39■■■□□ 2.78
MESP1-201ENST00000300057 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.31■■■□□ 2.76
MESP1-201ENST00000300057 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.31■■■□□ 2.76
MESP1-201ENST00000300057 PBRM1Q86U86 1689 aa32.29■■■□□ 2.76
MESP1-201ENST00000300057 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.29■■■□□ 2.76
MESP1-201ENST00000300057 TIAM1Q13009 1591 aa32.28■■■□□ 2.76
MESP1-201ENST00000300057 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.27■■■□□ 2.76
MESP1-201ENST00000300057 WDR62O43379 1518 aa32.27■■■□□ 2.76
MESP1-201ENST00000300057 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.76
MESP1-201ENST00000300057 ERCC6Q03468 1493 aa32.22■■■□□ 2.75
MESP1-201ENST00000300057 MAP3K1Q13233 1512 aa32.22■■■□□ 2.75
MESP1-201ENST00000300057 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
MESP1-201ENST00000300057 IFT140Q96RY7 1462 aa32.18■■■□□ 2.74
MESP1-201ENST00000300057 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
MESP1-201ENST00000300057 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
MESP1-201ENST00000300057 ADAMTS12P58397 1594 aa32.14■■■□□ 2.74
MESP1-201ENST00000300057 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.14■■■□□ 2.73
MESP1-201ENST00000300057 GRIN2BQ13224 1484 aa32.13■■■□□ 2.73
MESP1-201ENST00000300057 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.13■■■□□ 2.73
MESP1-201ENST00000300057 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.11■■■□□ 2.73
MESP1-201ENST00000300057 SAMD9Q5K651 1589 aa32.11■■■□□ 2.73
MESP1-201ENST00000300057 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.09■■■□□ 2.73
MESP1-201ENST00000300057 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.07■■■□□ 2.72
MESP1-201ENST00000300057 FMN1Q68DA7 1419 aa32.07■■■□□ 2.72
MESP1-201ENST00000300057 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
MESP1-201ENST00000300057 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
MESP1-201ENST00000300057 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.99■■■□□ 2.71
MESP1-201ENST00000300057 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
MESP1-201ENST00000300057 IQGAP2Q13576 1575 aa31.95■■■□□ 2.71
MESP1-201ENST00000300057 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.95■■■□□ 2.71
MESP1-201ENST00000300057 ITGAEP38570 1179 aa31.93■■■□□ 2.7
MESP1-201ENST00000300057 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.85■■■□□ 2.69
MESP1-201ENST00000300057 NEUROD1Q13562 356 aa31.8■■■□□ 2.68
MESP1-201ENST00000300057 GRIN2AQ12879 1464 aa31.78■■■□□ 2.68
MESP1-201ENST00000300057 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
MESP1-201ENST00000300057 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.77■■■□□ 2.68
MESP1-201ENST00000300057 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.68
MESP1-201ENST00000300057 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.74■■■□□ 2.67
MESP1-201ENST00000300057 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
MESP1-201ENST00000300057 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.73■■■□□ 2.67
MESP1-201ENST00000300057 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
MESP1-201ENST00000300057 HECW1Q76N89 1606 aa31.67■■■□□ 2.66
MESP1-201ENST00000300057 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
MESP1-201ENST00000300057 SYNJ2O15056 1496 aa31.65■■■□□ 2.66
MESP1-201ENST00000300057 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa31.65■■■□□ 2.66
MESP1-201ENST00000300057 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.64■■■□□ 2.66
MESP1-201ENST00000300057 FBLN2P98095 1184 aa31.63■■■□□ 2.65
MESP1-201ENST00000300057 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.63■■■□□ 2.65
MESP1-201ENST00000300057 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.63■■■□□ 2.65
MESP1-201ENST00000300057 KIAA0556O60303 1618 aa31.62■■■□□ 2.65
MESP1-201ENST00000300057 CLSPNQ9HAW4 1339 aa31.62■■■□□ 2.65
MESP1-201ENST00000300057 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.62■■■□□ 2.65
MESP1-201ENST00000300057 DISP1Q96F81 1524 aa31.61■■■□□ 2.65
MESP1-201ENST00000300057 NCOA2Q15596 1464 aa31.61■■■□□ 2.65
MESP1-201ENST00000300057 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
MESP1-201ENST00000300057 CEP170Q5SW79 1584 aa31.59■■■□□ 2.65
MESP1-201ENST00000300057 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.59■■■□□ 2.65
MESP1-201ENST00000300057 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.57■■■□□ 2.64
MESP1-201ENST00000300057 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
MESP1-201ENST00000300057 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.55■■■□□ 2.64
MESP1-201ENST00000300057 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
MESP1-201ENST00000300057 ARID3CA6NKF2 412 aa31.54■■■□□ 2.64
MESP1-201ENST00000300057 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.51■■■□□ 2.63
MESP1-201ENST00000300057 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
MESP1-201ENST00000300057 ARHGEF11O15085 1522 aa31.45■■■□□ 2.63
MESP1-201ENST00000300057 NUP160Q12769 1436 aa31.45■■■□□ 2.62
MESP1-201ENST00000300057 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
MESP1-201ENST00000300057 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.41■■■□□ 2.62
MESP1-201ENST00000300057 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.38■■■□□ 2.61
MESP1-201ENST00000300057 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
MESP1-201ENST00000300057 MAPKBP1O60336 1514 aa31.36■■■□□ 2.61
MESP1-201ENST00000300057 PTPRKQ15262 1439 aa31.35■■■□□ 2.61
MESP1-201ENST00000300057 JPH4Q96JJ6 628 aa31.35■■■□□ 2.61
MESP1-201ENST00000300057 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.32■■■□□ 2.6
MESP1-201ENST00000300057 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.28■■■□□ 2.6
MESP1-201ENST00000300057 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
MESP1-201ENST00000300057 HFM1A2PYH4 1435 aa31.24■■■□□ 2.59
MESP1-201ENST00000300057 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.58
MESP1-201ENST00000300057 MIA2Q96PC5 1412 aa31.19■■■□□ 2.58
MESP1-201ENST00000300057 CHD1O14646 1710 aa31.18■■■□□ 2.58
MESP1-201ENST00000300057 NAIPQ13075 1403 aa31.16■■■□□ 2.58
MESP1-201ENST00000300057 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.13■■■□□ 2.57
MESP1-201ENST00000300057 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
MESP1-201ENST00000300057 SIN3AQ96ST3 1273 aa31.11■■■□□ 2.57
MESP1-201ENST00000300057 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
MESP1-201ENST00000300057 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.09■■■□□ 2.57
MESP1-201ENST00000300057 ABCA8O94911 1581 aa31.07■■■□□ 2.56
MESP1-201ENST00000300057 UACAQ9BZF9 1416 aa31.06■■■□□ 2.56
MESP1-201ENST00000300057 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.03■■■□□ 2.56
MESP1-201ENST00000300057 KIF14Q15058 1648 aa31.02■■■□□ 2.56
MESP1-201ENST00000300057 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
MESP1-201ENST00000300057 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.99■■■□□ 2.55
MESP1-201ENST00000300057 AKNAQ7Z591 1439 aa30.98■■■□□ 2.55
MESP1-201ENST00000300057 DAPK1P53355 1430 aa30.97■■■□□ 2.55
MESP1-201ENST00000300057 PTPRGP23470 1445 aa30.96■■■□□ 2.55
MESP1-201ENST00000300057 ATP10BO94823 1461 aa30.95■■■□□ 2.55
MESP1-201ENST00000300057 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
MESP1-201ENST00000300057 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.95■■■□□ 2.55
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