RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290541.6

PSMB4-201, Transcript of proteasome subunit beta 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PSMB4, Length 964 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4-201ENST00000290541 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.6■■□□□ 1.37
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PSMB4-201ENST00000290541 CUX1P39880 1505 aa23.53■■□□□ 1.36
PSMB4-201ENST00000290541 ADAMTS12P58397 1594 aa23.48■■□□□ 1.35
PSMB4-201ENST00000290541 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.46■■□□□ 1.35
PSMB4-201ENST00000290541 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.42■■□□□ 1.34
PSMB4-201ENST00000290541 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PSMB4-201ENST00000290541 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.4■■□□□ 1.34
PSMB4-201ENST00000290541 SOCS7O14512 581 aa23.4■■□□□ 1.34
PSMB4-201ENST00000290541 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PSMB4-201ENST00000290541 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
PSMB4-201ENST00000290541 ILDR2Q71H61 639 aa23.34■■□□□ 1.33
PSMB4-201ENST00000290541 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PSMB4-201ENST00000290541 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.24■■□□□ 1.31
PSMB4-201ENST00000290541 TOP2BQ02880 1626 aa23.22■■□□□ 1.31
PSMB4-201ENST00000290541 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.2■■□□□ 1.3
PSMB4-201ENST00000290541 JPH4Q96JJ6 628 aa23.2■■□□□ 1.3
PSMB4-201ENST00000290541 GLI2P10070 1586 aa23.18■■□□□ 1.3
PSMB4-201ENST00000290541 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.13■■□□□ 1.29
PSMB4-201ENST00000290541 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.08■■□□□ 1.28
PSMB4-201ENST00000290541 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.05■■□□□ 1.28
PSMB4-201ENST00000290541 ASXL2Q76L83 1435 aa23■■□□□ 1.27
PSMB4-201ENST00000290541 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.99■■□□□ 1.27
PSMB4-201ENST00000290541 ABCC2Q92887 1545 aa22.98■■□□□ 1.27
PSMB4-201ENST00000290541 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.96■■□□□ 1.27
PSMB4-201ENST00000290541 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.96■■□□□ 1.27
PSMB4-201ENST00000290541 CUL7Q14999 1698 aa22.94■■□□□ 1.26
PSMB4-201ENST00000290541 KIF21BO75037 1637 aa22.94■■□□□ 1.26
PSMB4-201ENST00000290541 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
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PSMB4-201ENST00000290541 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
PSMB4-201ENST00000290541 PTPRMP28827 1452 aa22.87■■□□□ 1.25
PSMB4-201ENST00000290541 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.85■■□□□ 1.25
PSMB4-201ENST00000290541 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.82■■□□□ 1.24
PSMB4-201ENST00000290541 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.82■■□□□ 1.24
PSMB4-201ENST00000290541 CERKQ8TCT0 537 aa22.81■■□□□ 1.24
PSMB4-201ENST00000290541 PTPRGP23470 1445 aa22.81■■□□□ 1.24
PSMB4-201ENST00000290541 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.78■■□□□ 1.24
PSMB4-201ENST00000290541 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.7■■□□□ 1.22
PSMB4-201ENST00000290541 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PSMB4-201ENST00000290541 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.67■■□□□ 1.22
PSMB4-201ENST00000290541 MADDQ8WXG6 1647 aa22.66■■□□□ 1.22
PSMB4-201ENST00000290541 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.65■■□□□ 1.22
PSMB4-201ENST00000290541 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.64■■□□□ 1.21
PSMB4-201ENST00000290541 UACAQ9BZF9 1416 aa22.63■■□□□ 1.21
PSMB4-201ENST00000290541 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PSMB4-201ENST00000290541 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.62■■□□□ 1.21
PSMB4-201ENST00000290541 HSPA2P54652 639 aa22.57■■□□□ 1.2
PSMB4-201ENST00000290541 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.57■■□□□ 1.2
PSMB4-201ENST00000290541 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.56■■□□□ 1.2
PSMB4-201ENST00000290541 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PSMB4-201ENST00000290541 CD109Q6YHK3 1445 aa22.52■■□□□ 1.2
PSMB4-201ENST00000290541 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.52■■□□□ 1.19
PSMB4-201ENST00000290541 DISP1Q96F81 1524 aa22.45■■□□□ 1.18
PSMB4-201ENST00000290541 IQGAP2Q13576 1575 aa22.43■■□□□ 1.18
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PSMB4-201ENST00000290541 KIF27Q86VH2 1401 aa22.35■■□□□ 1.17
PSMB4-201ENST00000290541 STRCQ7RTU9 1775 aa22.34■■□□□ 1.17
PSMB4-201ENST00000290541 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.33■■□□□ 1.17
PSMB4-201ENST00000290541 KIAA0556O60303 1618 aa22.28■■□□□ 1.16
PSMB4-201ENST00000290541 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.27■■□□□ 1.16
PSMB4-201ENST00000290541 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PSMB4-201ENST00000290541 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.26■■□□□ 1.15
PSMB4-201ENST00000290541 KCNH8Q96L42 1107 aa22.25■■□□□ 1.15
PSMB4-201ENST00000290541 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.25■■□□□ 1.15
PSMB4-201ENST00000290541 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.24■■□□□ 1.15
PSMB4-201ENST00000290541 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.23■■□□□ 1.15
PSMB4-201ENST00000290541 RAPGEF3O95398 923 aa22.23■■□□□ 1.15
PSMB4-201ENST00000290541 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.22■■□□□ 1.15
PSMB4-201ENST00000290541 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.22■■□□□ 1.15
PSMB4-201ENST00000290541 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.22■■□□□ 1.15
PSMB4-201ENST00000290541 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.22■■□□□ 1.15
PSMB4-201ENST00000290541 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PSMB4-201ENST00000290541 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.19■■□□□ 1.14
PSMB4-201ENST00000290541 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.18■■□□□ 1.14
PSMB4-201ENST00000290541 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.18■■□□□ 1.14
PSMB4-201ENST00000290541 ABCA8O94911 1581 aa22.16■■□□□ 1.14
PSMB4-201ENST00000290541 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.15■■□□□ 1.14
PSMB4-201ENST00000290541 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.15■■□□□ 1.14
PSMB4-201ENST00000290541 NEO1Q92859 1461 aa22.15■■□□□ 1.14
PSMB4-201ENST00000290541 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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PSMB4-201ENST00000290541 RICTORQ6R327 1708 aa22.11■■□□□ 1.13
PSMB4-201ENST00000290541 FANCAO15360 1455 aa22.1■■□□□ 1.13
PSMB4-201ENST00000290541 PTPRTO14522 1441 aa22.1■■□□□ 1.13
PSMB4-201ENST00000290541 EEA1Q15075 1411 aa22.09■■□□□ 1.13
PSMB4-201ENST00000290541 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.08■■□□□ 1.13
PSMB4-201ENST00000290541 PRXQ9BXM0 1461 aa22.04■■□□□ 1.12
PSMB4-201ENST00000290541 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.02■■□□□ 1.12
PSMB4-201ENST00000290541 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22■■□□□ 1.11
PSMB4-201ENST00000290541 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.99■■□□□ 1.11
PSMB4-201ENST00000290541 AKNAQ7Z591 1439 aa21.98■■□□□ 1.11
PSMB4-201ENST00000290541 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.96■■□□□ 1.11
PSMB4-201ENST00000290541 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.96■■□□□ 1.11
PSMB4-201ENST00000290541 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.95■■□□□ 1.1
PSMB4-201ENST00000290541 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PSMB4-201ENST00000290541 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.94■■□□□ 1.1
PSMB4-201ENST00000290541 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.93■■□□□ 1.1
PSMB4-201ENST00000290541 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PSMB4-201ENST00000290541 ATP10BO94823 1461 aa21.9■■□□□ 1.1
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