RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285896.10

CNOT8-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT8, Length 2,528 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8-201ENST00000285896 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
CNOT8-201ENST00000285896 APLP2Q06481 763 aa23.81■■□□□ 1.4
CNOT8-201ENST00000285896 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.81■■□□□ 1.4
CNOT8-201ENST00000285896 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.78■■□□□ 1.4
CNOT8-201ENST00000285896 ADAMTS12P58397 1594 aa23.77■■□□□ 1.4
CNOT8-201ENST00000285896 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CNOT8-201ENST00000285896 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CNOT8-201ENST00000285896 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.7■■□□□ 1.39
CNOT8-201ENST00000285896 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.68■■□□□ 1.38
CNOT8-201ENST00000285896 P3H3Q8IVL6 736 aa23.66■■□□□ 1.38
CNOT8-201ENST00000285896 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.63■■□□□ 1.37
CNOT8-201ENST00000285896 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CNOT8-201ENST00000285896 SAMD9Q5K651 1589 aa23.58■■□□□ 1.36
CNOT8-201ENST00000285896 GRIN2AQ12879 1464 aa23.56■■□□□ 1.36
CNOT8-201ENST00000285896 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CNOT8-201ENST00000285896 IQGAP2Q13576 1575 aa23.56■■□□□ 1.36
CNOT8-201ENST00000285896 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CNOT8-201ENST00000285896 SYNJ2O15056 1496 aa23.54■■□□□ 1.36
CNOT8-201ENST00000285896 FMN1Q68DA7 1419 aa23.53■■□□□ 1.36
CNOT8-201ENST00000285896 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CNOT8-201ENST00000285896 MAP3K1Q13233 1512 aa23.52■■□□□ 1.36
CNOT8-201ENST00000285896 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.35
CNOT8-201ENST00000285896 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.5■■□□□ 1.35
CNOT8-201ENST00000285896 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.49■■□□□ 1.35
CNOT8-201ENST00000285896 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.49■■□□□ 1.35
CNOT8-201ENST00000285896 TIAM1Q13009 1591 aa23.48■■□□□ 1.35
CNOT8-201ENST00000285896 FBLN2P98095 1184 aa23.45■■□□□ 1.34
CNOT8-201ENST00000285896 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CNOT8-201ENST00000285896 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.44■■□□□ 1.34
CNOT8-201ENST00000285896 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.4■■□□□ 1.34
CNOT8-201ENST00000285896 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.4■■□□□ 1.34
CNOT8-201ENST00000285896 CEP170Q5SW79 1584 aa23.39■■□□□ 1.34
CNOT8-201ENST00000285896 NUP160Q12769 1436 aa23.38■■□□□ 1.33
CNOT8-201ENST00000285896 DISP1Q96F81 1524 aa23.33■■□□□ 1.33
CNOT8-201ENST00000285896 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CNOT8-201ENST00000285896 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CNOT8-201ENST00000285896 KIAA0556O60303 1618 aa23.31■■□□□ 1.32
CNOT8-201ENST00000285896 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CNOT8-201ENST00000285896 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.25■■□□□ 1.31
CNOT8-201ENST00000285896 JPH4Q96JJ6 628 aa23.24■■□□□ 1.31
CNOT8-201ENST00000285896 HECW1Q76N89 1606 aa23.23■■□□□ 1.31
CNOT8-201ENST00000285896 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.23■■□□□ 1.31
CNOT8-201ENST00000285896 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.22■■□□□ 1.31
CNOT8-201ENST00000285896 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.22■■□□□ 1.31
CNOT8-201ENST00000285896 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.21■■□□□ 1.31
CNOT8-201ENST00000285896 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CNOT8-201ENST00000285896 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.2■■□□□ 1.3
CNOT8-201ENST00000285896 CHD1O14646 1710 aa23.17■■□□□ 1.3
CNOT8-201ENST00000285896 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CNOT8-201ENST00000285896 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.13■■□□□ 1.29
CNOT8-201ENST00000285896 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CNOT8-201ENST00000285896 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.1■■□□□ 1.29
CNOT8-201ENST00000285896 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CNOT8-201ENST00000285896 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.09■■□□□ 1.29
CNOT8-201ENST00000285896 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CNOT8-201ENST00000285896 ARID3CA6NKF2 412 aa23.08■■□□□ 1.28
CNOT8-201ENST00000285896 NEUROD1Q13562 356 aa23.08■■□□□ 1.28
CNOT8-201ENST00000285896 NCOA2Q15596 1464 aa23.07■■□□□ 1.28
CNOT8-201ENST00000285896 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CNOT8-201ENST00000285896 MYT1Q01538 1121 aa23.07■■□□□ 1.28
CNOT8-201ENST00000285896 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CNOT8-201ENST00000285896 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CNOT8-201ENST00000285896 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.05■■□□□ 1.28
CNOT8-201ENST00000285896 ITGAEP38570 1179 aa23.04■■□□□ 1.28
CNOT8-201ENST00000285896 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.03■■□□□ 1.28
CNOT8-201ENST00000285896 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.27
CNOT8-201ENST00000285896 ARHGEF11O15085 1522 aa23.01■■□□□ 1.27
CNOT8-201ENST00000285896 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23■■□□□ 1.27
CNOT8-201ENST00000285896 SHROOM2Q13796 1616 aa22.99■■□□□ 1.27
CNOT8-201ENST00000285896 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CNOT8-201ENST00000285896 PTPRGP23470 1445 aa22.96■■□□□ 1.27
CNOT8-201ENST00000285896 ABCA8O94911 1581 aa22.95■■□□□ 1.26
CNOT8-201ENST00000285896 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.93■■□□□ 1.26
CNOT8-201ENST00000285896 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.91■■□□□ 1.26
CNOT8-201ENST00000285896 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CNOT8-201ENST00000285896 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.86■■□□□ 1.25
CNOT8-201ENST00000285896 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.85■■□□□ 1.25
CNOT8-201ENST00000285896 MIA2Q96PC5 1412 aa22.85■■□□□ 1.25
CNOT8-201ENST00000285896 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.85■■□□□ 1.25
CNOT8-201ENST00000285896 ATP10BO94823 1461 aa22.85■■□□□ 1.25
CNOT8-201ENST00000285896 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.84■■□□□ 1.25
CNOT8-201ENST00000285896 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CNOT8-201ENST00000285896 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CNOT8-201ENST00000285896 UACAQ9BZF9 1416 aa22.82■■□□□ 1.24
CNOT8-201ENST00000285896 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.79■■□□□ 1.24
CNOT8-201ENST00000285896 PTPRKQ15262 1439 aa22.78■■□□□ 1.24
CNOT8-201ENST00000285896 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.78■■□□□ 1.24
CNOT8-201ENST00000285896 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.77■■□□□ 1.23
CNOT8-201ENST00000285896 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CNOT8-201ENST00000285896 KIF14Q15058 1648 aa22.74■■□□□ 1.23
CNOT8-201ENST00000285896 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CNOT8-201ENST00000285896 ABCC2Q92887 1545 aa22.72■■□□□ 1.23
CNOT8-201ENST00000285896 HFM1A2PYH4 1435 aa22.71■■□□□ 1.23
CNOT8-201ENST00000285896 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CNOT8-201ENST00000285896 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CNOT8-201ENST00000285896 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.67■■□□□ 1.22
CNOT8-201ENST00000285896 OSCARQ8IYS5 282 aa22.67■■□□□ 1.22
CNOT8-201ENST00000285896 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.66■■□□□ 1.22
CNOT8-201ENST00000285896 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CNOT8-201ENST00000285896 NAIPQ13075 1403 aa22.65■■□□□ 1.22
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