RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278829.6

FADS3-201, Transcript of fatty acid desaturase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FADS3, Length 1,779 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FADS3-201ENST00000278829 GRIN2BQ13224 1484 aa41.65■■■■■ 4.26
FADS3-201ENST00000278829 APLP2Q06481 763 aa41.65■■■■■ 4.26
FADS3-201ENST00000278829 ADAMTS12P58397 1594 aa41.62■■■■■ 4.25
FADS3-201ENST00000278829 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.61■■■■■ 4.25
FADS3-201ENST00000278829 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.61■■■■■ 4.25
FADS3-201ENST00000278829 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
FADS3-201ENST00000278829 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.55■■■■■ 4.24
FADS3-201ENST00000278829 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
FADS3-201ENST00000278829 SAMD9Q5K651 1589 aa41.4■■■■■ 4.22
FADS3-201ENST00000278829 MAP3K1Q13233 1512 aa41.38■■■■■ 4.22
FADS3-201ENST00000278829 CHD1O14646 1710 aa41.35■■■■■ 4.21
FADS3-201ENST00000278829 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.32■■■■■ 4.21
FADS3-201ENST00000278829 SYNJ2O15056 1496 aa41.31■■■■■ 4.2
FADS3-201ENST00000278829 FBLN2P98095 1184 aa41.3■■■■■ 4.2
FADS3-201ENST00000278829 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
FADS3-201ENST00000278829 TIAM1Q13009 1591 aa41.27■■■■■ 4.2
FADS3-201ENST00000278829 OSCARQ8IYS5 282 aa41.25■■■■■ 4.19
FADS3-201ENST00000278829 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
FADS3-201ENST00000278829 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.24■■■■■ 4.19
FADS3-201ENST00000278829 IQGAP2Q13576 1575 aa41.23■■■■■ 4.19
FADS3-201ENST00000278829 P3H3Q8IVL6 736 aa41.22■■■■■ 4.19
FADS3-201ENST00000278829 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
FADS3-201ENST00000278829 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.21■■■■■ 4.19
FADS3-201ENST00000278829 FMN1Q68DA7 1419 aa41.2■■■■■ 4.19
FADS3-201ENST00000278829 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.19■■■■■ 4.19
FADS3-201ENST00000278829 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.18■■■■■ 4.18
FADS3-201ENST00000278829 GRIN2AQ12879 1464 aa41.16■■■■■ 4.18
FADS3-201ENST00000278829 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
FADS3-201ENST00000278829 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.07■■■■■ 4.17
FADS3-201ENST00000278829 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.07■■■■■ 4.16
FADS3-201ENST00000278829 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.05■■■■■ 4.16
FADS3-201ENST00000278829 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
FADS3-201ENST00000278829 CEP170Q5SW79 1584 aa40.94■■■■■ 4.14
FADS3-201ENST00000278829 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.93■■■■■ 4.14
FADS3-201ENST00000278829 NUP160Q12769 1436 aa40.93■■■■■ 4.14
FADS3-201ENST00000278829 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.86■■■■■ 4.13
FADS3-201ENST00000278829 KIAA0556O60303 1618 aa40.83■■■■■ 4.13
FADS3-201ENST00000278829 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
FADS3-201ENST00000278829 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.13
FADS3-201ENST00000278829 DISP1Q96F81 1524 aa40.8■■■■■ 4.12
FADS3-201ENST00000278829 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
FADS3-201ENST00000278829 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.78■■■■■ 4.12
FADS3-201ENST00000278829 HECW1Q76N89 1606 aa40.75■■■■■ 4.11
FADS3-201ENST00000278829 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
FADS3-201ENST00000278829 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.71■■■■■ 4.11
FADS3-201ENST00000278829 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.68■■■■■ 4.1
FADS3-201ENST00000278829 ARHGEF11O15085 1522 aa40.64■■■■■ 4.1
FADS3-201ENST00000278829 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.6■■■■■ 4.09
FADS3-201ENST00000278829 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.6■■■■■ 4.09
FADS3-201ENST00000278829 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.6■■■■■ 4.09
FADS3-201ENST00000278829 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.6■■■■■ 4.09
FADS3-201ENST00000278829 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.58■■■■■ 4.09
FADS3-201ENST00000278829 SHROOM2Q13796 1616 aa40.57■■■■■ 4.08
FADS3-201ENST00000278829 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
FADS3-201ENST00000278829 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
FADS3-201ENST00000278829 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.5■■■■■ 4.07
FADS3-201ENST00000278829 JPH4Q96JJ6 628 aa40.5■■■■■ 4.07
FADS3-201ENST00000278829 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.49■■■■■ 4.07
FADS3-201ENST00000278829 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.49■■■■■ 4.07
FADS3-201ENST00000278829 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.47■■■■■ 4.07
FADS3-201ENST00000278829 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.46■■■■■ 4.075e-7■■■■■ 28.5
FADS3-201ENST00000278829 NCOA2Q15596 1464 aa40.43■■■■■ 4.06
FADS3-201ENST00000278829 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
FADS3-201ENST00000278829 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
FADS3-201ENST00000278829 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.06
FADS3-201ENST00000278829 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.37■■■■■ 4.05
FADS3-201ENST00000278829 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.32■■■■■ 4.04
FADS3-201ENST00000278829 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
FADS3-201ENST00000278829 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.24■■■■■ 4.03
FADS3-201ENST00000278829 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.24■■■■■ 4.03
FADS3-201ENST00000278829 ITGAEP38570 1179 aa40.22■■■■■ 4.03
FADS3-201ENST00000278829 ABCA8O94911 1581 aa40.21■■■■■ 4.03
FADS3-201ENST00000278829 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
FADS3-201ENST00000278829 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.15■■■■■ 4.02
FADS3-201ENST00000278829 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.12■■■■■ 4.01
FADS3-201ENST00000278829 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
FADS3-201ENST00000278829 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.1■■■■■ 4.01
FADS3-201ENST00000278829 ARID3CA6NKF2 412 aa40.1■■■■■ 4.01
FADS3-201ENST00000278829 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
FADS3-201ENST00000278829 MIA2Q96PC5 1412 aa40.07■■■■■ 4.01
FADS3-201ENST00000278829 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.07■■■■■ 4.01
FADS3-201ENST00000278829 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
FADS3-201ENST00000278829 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.02■■■■■ 4
FADS3-201ENST00000278829 PTPRGP23470 1445 aa40.01■■■■■ 4
FADS3-201ENST00000278829 PTPRKQ15262 1439 aa39.93■■■■□ 3.98
FADS3-201ENST00000278829 ATP10BO94823 1461 aa39.92■■■■□ 3.98
FADS3-201ENST00000278829 HFM1A2PYH4 1435 aa39.86■■■■□ 3.97
FADS3-201ENST00000278829 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.85■■■■□ 3.97
FADS3-201ENST00000278829 KIF14Q15058 1648 aa39.84■■■■□ 3.97
FADS3-201ENST00000278829 UACAQ9BZF9 1416 aa39.83■■■■□ 3.97
FADS3-201ENST00000278829 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.75■■■■□ 3.95
FADS3-201ENST00000278829 AKNAQ7Z591 1439 aa39.74■■■■□ 3.95
FADS3-201ENST00000278829 MAPKBP1O60336 1514 aa39.74■■■■□ 3.95
FADS3-201ENST00000278829 NAIPQ13075 1403 aa39.73■■■■□ 3.95
FADS3-201ENST00000278829 ABCC2Q92887 1545 aa39.73■■■■□ 3.95
FADS3-201ENST00000278829 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.73■■■■□ 3.95
FADS3-201ENST00000278829 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.71■■■■□ 3.95
FADS3-201ENST00000278829 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
FADS3-201ENST00000278829 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.69■■■■□ 3.95
FADS3-201ENST00000278829 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.64■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms