RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262498.7

CFAP20-201, Transcript of cilia and flagella associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CFAP20, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20-201ENST00000262498 MAPKBP1O60336 1514 aa21.83■■□□□ 1.09
CFAP20-201ENST00000262498 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.83■■□□□ 1.08
CFAP20-201ENST00000262498 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.8■■□□□ 1.08
CFAP20-201ENST00000262498 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.79■■□□□ 1.08
CFAP20-201ENST00000262498 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.78■■□□□ 1.08
CFAP20-201ENST00000262498 JPH4Q96JJ6 628 aa21.78■■□□□ 1.08
CFAP20-201ENST00000262498 KDM6BO15054 1643 aa21.75■■□□□ 1.07
CFAP20-201ENST00000262498 TSPOAP1O95153 1857 aa21.72■■□□□ 1.07
CFAP20-201ENST00000262498 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CFAP20-201ENST00000262498 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
CFAP20-201ENST00000262498 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
CFAP20-201ENST00000262498 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.54■■□□□ 1.04
CFAP20-201ENST00000262498 ADGRL1O94910 1474 aa21.48■■□□□ 1.03
CFAP20-201ENST00000262498 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CFAP20-201ENST00000262498 GLI2P10070 1586 aa21.46■■□□□ 1.03
CFAP20-201ENST00000262498 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CFAP20-201ENST00000262498 ABCC2Q92887 1545 aa21.44■■□□□ 1.02
CFAP20-201ENST00000262498 IGF1RP08069 1367 aa21.44■■□□□ 1.02
CFAP20-201ENST00000262498 CUL7Q14999 1698 aa21.42■■□□□ 1.02
CFAP20-201ENST00000262498 PTPRGP23470 1445 aa21.41■■□□□ 1.02
CFAP20-201ENST00000262498 ASXL2Q76L83 1435 aa21.41■■□□□ 1.02
CFAP20-201ENST00000262498 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.41■■□□□ 1.02
CFAP20-201ENST00000262498 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.37■■□□□ 1.01
CFAP20-201ENST00000262498 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.36■■□□□ 1.01
CFAP20-201ENST00000262498 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.34■■□□□ 1.01
CFAP20-201ENST00000262498 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.33■■□□□ 1.01
CFAP20-201ENST00000262498 KIF27Q86VH2 1401 aa21.3■■□□□ 1
CFAP20-201ENST00000262498 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CFAP20-201ENST00000262498 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
CFAP20-201ENST00000262498 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.27■■□□□ 1
CFAP20-201ENST00000262498 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.27■■□□□ 1
CFAP20-201ENST00000262498 IQGAP2Q13576 1575 aa21.27■□□□□ 0.99
CFAP20-201ENST00000262498 DISP1Q96F81 1524 aa21.27■□□□□ 0.99
CFAP20-201ENST00000262498 UACAQ9BZF9 1416 aa21.26■□□□□ 0.99
CFAP20-201ENST00000262498 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
CFAP20-201ENST00000262498 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.23■□□□□ 0.99
CFAP20-201ENST00000262498 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.21■□□□□ 0.99
CFAP20-201ENST00000262498 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.13■□□□□ 0.97
CFAP20-201ENST00000262498 KIAA0556O60303 1618 aa21.11■□□□□ 0.97
CFAP20-201ENST00000262498 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.1■□□□□ 0.97
CFAP20-201ENST00000262498 KIF21BO75037 1637 aa21.07■□□□□ 0.96
CFAP20-201ENST00000262498 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.07■□□□□ 0.96
CFAP20-201ENST00000262498 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.06■□□□□ 0.96
CFAP20-201ENST00000262498 FBXO41Q8TF61 875 aa21.04■□□□□ 0.96
CFAP20-201ENST00000262498 CD109Q6YHK3 1445 aa21.01■□□□□ 0.95
CFAP20-201ENST00000262498 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.98■□□□□ 0.95
CFAP20-201ENST00000262498 ABCA8O94911 1581 aa20.97■□□□□ 0.95
CFAP20-201ENST00000262498 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.96■□□□□ 0.95
CFAP20-201ENST00000262498 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.93■□□□□ 0.94
CFAP20-201ENST00000262498 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.92■□□□□ 0.94
CFAP20-201ENST00000262498 PTPRMP28827 1452 aa20.91■□□□□ 0.94
CFAP20-201ENST00000262498 KCNH8Q96L42 1107 aa20.9■□□□□ 0.94
CFAP20-201ENST00000262498 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.83■□□□□ 0.92
CFAP20-201ENST00000262498 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CFAP20-201ENST00000262498 GOLGA3Q08378 1498 aa20.82■□□□□ 0.92
CFAP20-201ENST00000262498 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.82■□□□□ 0.92
CFAP20-201ENST00000262498 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.82■□□□□ 0.92
CFAP20-201ENST00000262498 MADDQ8WXG6 1647 aa20.8■□□□□ 0.92
CFAP20-201ENST00000262498 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.79■□□□□ 0.92
CFAP20-201ENST00000262498 ATP10BO94823 1461 aa20.77■□□□□ 0.92
CFAP20-201ENST00000262498 RAPGEF3O95398 923 aa20.74■□□□□ 0.91
CFAP20-201ENST00000262498 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.74■□□□□ 0.91
CFAP20-201ENST00000262498 NEO1Q92859 1461 aa20.7■□□□□ 0.9
CFAP20-201ENST00000262498 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
CFAP20-201ENST00000262498 PRXQ9BXM0 1461 aa20.68■□□□□ 0.9
CFAP20-201ENST00000262498 ARID3CA6NKF2 412 aa20.68■□□□□ 0.9
CFAP20-201ENST00000262498 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.66■□□□□ 0.9
CFAP20-201ENST00000262498 RICTORQ6R327 1708 aa20.66■□□□□ 0.9
CFAP20-201ENST00000262498 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.66■□□□□ 0.9
CFAP20-201ENST00000262498 HSPA2P54652 639 aa20.61■□□□□ 0.89
CFAP20-201ENST00000262498 SAMD9Q5K651 1589 aa20.6■□□□□ 0.89
CFAP20-201ENST00000262498 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.6■□□□□ 0.89
CFAP20-201ENST00000262498 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CFAP20-201ENST00000262498 P3H3Q8IVL6 736 aa20.58■□□□□ 0.88
CFAP20-201ENST00000262498 CERKQ8TCT0 537 aa20.55■□□□□ 0.88
CFAP20-201ENST00000262498 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CFAP20-201ENST00000262498 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.54■□□□□ 0.88
CFAP20-201ENST00000262498 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.53■□□□□ 0.88
CFAP20-201ENST00000262498 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CFAP20-201ENST00000262498 ILDR2Q71H61 639 aa20.52■□□□□ 0.88
CFAP20-201ENST00000262498 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.5■□□□□ 0.87
CFAP20-201ENST00000262498 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.49■□□□□ 0.87
CFAP20-201ENST00000262498 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.49■□□□□ 0.87
CFAP20-201ENST00000262498 AKNAQ7Z591 1439 aa20.49■□□□□ 0.87
CFAP20-201ENST00000262498 FANCAO15360 1455 aa20.48■□□□□ 0.87
CFAP20-201ENST00000262498 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
CFAP20-201ENST00000262498 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.46■□□□□ 0.87
CFAP20-201ENST00000262498 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.46■□□□□ 0.87
CFAP20-201ENST00000262498 STRCQ7RTU9 1775 aa20.46■□□□□ 0.87
CFAP20-201ENST00000262498 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.44■□□□□ 0.86
CFAP20-201ENST00000262498 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.44■□□□□ 0.86
CFAP20-201ENST00000262498 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.44■□□□□ 0.86
CFAP20-201ENST00000262498 HECW1Q76N89 1606 aa20.43■□□□□ 0.86
CFAP20-201ENST00000262498 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.43■□□□□ 0.86
CFAP20-201ENST00000262498 SOCS7O14512 581 aa20.42■□□□□ 0.86
CFAP20-201ENST00000262498 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.42■□□□□ 0.86
CFAP20-201ENST00000262498 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CFAP20-201ENST00000262498 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CFAP20-201ENST00000262498 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CFAP20-201ENST00000262498 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms