RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261588.8

KIAA0556-201, Transcript of KIAA0556, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KIAA0556, Length 6,616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556-201ENST00000261588 BECN1Q14457 450 aa15.24■□□□□ 0.03
KIAA0556-201ENST00000261588 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
KIAA0556-201ENST00000261588 GOLGA6L22H0YM25 854 aa15.23■□□□□ 0.03
KIAA0556-201ENST00000261588 DDRGK1Q96HY6 314 aa15.23■□□□□ 0.03
KIAA0556-201ENST00000261588 TMC1Q8TDI8 760 aa15.23■□□□□ 0.03
KIAA0556-201ENST00000261588 PLCB2Q00722 1185 aa15.22■□□□□ 0.03
KIAA0556-201ENST00000261588 TAOK2Q9UL54 1235 aa15.22■□□□□ 0.03
KIAA0556-201ENST00000261588 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
KIAA0556-201ENST00000261588 SCRIBQ14160 1630 aa15.21■□□□□ 0.03
KIAA0556-201ENST00000261588 MYH16Q9H6N6 1097 aa15.21■□□□□ 0.03
KIAA0556-201ENST00000261588 ANP32EQ9BTT0 268 aa15.2■□□□□ 0.02
KIAA0556-201ENST00000261588 ERICH6BQ5W0A0 696 aa15.19■□□□□ 0.02
KIAA0556-201ENST00000261588 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
KIAA0556-201ENST00000261588 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.02
KIAA0556-201ENST00000261588 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
KIAA0556-201ENST00000261588 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
KIAA0556-201ENST00000261588 MRS2Q9HD23 443 aa15.15■□□□□ 0.02
KIAA0556-201ENST00000261588 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
KIAA0556-201ENST00000261588 ARID3AQ99856 593 aa15.14■□□□□ 0.01
KIAA0556-201ENST00000261588 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.11■□□□□ 0.01
KIAA0556-201ENST00000261588 MIER1Q8N108 512 aa15.09■□□□□ 0.01
KIAA0556-201ENST00000261588 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.08■□□□□ 0
KIAA0556-201ENST00000261588 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.08■□□□□ 0
KIAA0556-201ENST00000261588 TSPY4P0CV99 314 aa15.06■□□□□ 0
KIAA0556-201ENST00000261588 TSPY10P0CW01 314 aa15.06■□□□□ 0
KIAA0556-201ENST00000261588 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.05■□□□□ 0
KIAA0556-201ENST00000261588 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa15.05■□□□□ 0
KIAA0556-201ENST00000261588 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.05■□□□□ 0
KIAA0556-201ENST00000261588 CLIP1P30622 1438 aa15.05■□□□□ -0
KIAA0556-201ENST00000261588 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
KIAA0556-201ENST00000261588 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.03■□□□□ -0
KIAA0556-201ENST00000261588 NPHP1O15259 732 aa15.02□□□□□ -0.01
KIAA0556-201ENST00000261588 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
KIAA0556-201ENST00000261588 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
KIAA0556-201ENST00000261588 CASC1Q6TDU7 716 aa15□□□□□ -0.01
KIAA0556-201ENST00000261588 LMOD2Q6P5Q4 547 aa14.99□□□□□ -0.01
KIAA0556-201ENST00000261588 EEA1Q15075 1411 aa14.99□□□□□ -0.01
KIAA0556-201ENST00000261588 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
KIAA0556-201ENST00000261588 CLSTN1O94985 981 aa14.98□□□□□ -0.01
KIAA0556-201ENST00000261588 MSNP26038 577 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
KIAA0556-201ENST00000261588 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
KIAA0556-201ENST00000261588 GOLGA3Q08378 1498 aa14.97□□□□□ -0.01
KIAA0556-201ENST00000261588 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
KIAA0556-201ENST00000261588 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
KIAA0556-201ENST00000261588 DRC7Q8IY82 874 aa14.95□□□□□ -0.02
KIAA0556-201ENST00000261588 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
KIAA0556-201ENST00000261588 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa14.94□□□□□ -0.02
KIAA0556-201ENST00000261588 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
KIAA0556-201ENST00000261588 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
KIAA0556-201ENST00000261588 CEP162Q5TB80 1403 aa14.92□□□□□ -0.02
KIAA0556-201ENST00000261588 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.92□□□□□ -0.02
KIAA0556-201ENST00000261588 NRDCO43847 1150 aa14.91□□□□□ -0.02
KIAA0556-201ENST00000261588 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
KIAA0556-201ENST00000261588 RGS3P49796 1198 aa14.9□□□□□ -0.02
KIAA0556-201ENST00000261588 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.9□□□□□ -0.02
KIAA0556-201ENST00000261588 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
KIAA0556-201ENST00000261588 CDCA8Q53HL2 280 aa14.87□□□□□ -0.03
KIAA0556-201ENST00000261588 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
KIAA0556-201ENST00000261588 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
KIAA0556-201ENST00000261588 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
KIAA0556-201ENST00000261588 KCNH8Q96L42 1107 aa14.86□□□□□ -0.03
KIAA0556-201ENST00000261588 CFAP53Q96M91 514 aa14.86□□□□□ -0.03
KIAA0556-201ENST00000261588 FGD1P98174 961 aa14.85□□□□□ -0.03
KIAA0556-201ENST00000261588 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
KIAA0556-201ENST00000261588 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
KIAA0556-201ENST00000261588 MYO15BQ96JP2 1530 aa14.84□□□□□ -0.03
KIAA0556-201ENST00000261588 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa14.84□□□□□ -0.03
KIAA0556-201ENST00000261588 PDE4CQ08493 712 aa14.83□□□□□ -0.04
KIAA0556-201ENST00000261588 PRM3Q9NNZ6 103 aa14.83□□□□□ -0.04
KIAA0556-201ENST00000261588 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
KIAA0556-201ENST00000261588 KNSTRNQ9Y448 316 aa14.81□□□□□ -0.04
KIAA0556-201ENST00000261588 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.8□□□□□ -0.04
KIAA0556-201ENST00000261588 TNIKQ9UKE5 1360 aa14.8□□□□□ -0.04
KIAA0556-201ENST00000261588 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.79□□□□□ -0.04
KIAA0556-201ENST00000261588 KCNJ4P48050 445 aa14.79□□□□□ -0.04
KIAA0556-201ENST00000261588 CEP164Q9UPV0 1460 aa14.79□□□□□ -0.04
KIAA0556-201ENST00000261588 NEUROD2Q15784 382 aa14.77□□□□□ -0.05
KIAA0556-201ENST00000261588 HSCBQ8IWL3 235 aa14.77□□□□□ -0.05
KIAA0556-201ENST00000261588 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.77□□□□□ -0.05
KIAA0556-201ENST00000261588 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
KIAA0556-201ENST00000261588 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
KIAA0556-201ENST00000261588 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
KIAA0556-201ENST00000261588 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
KIAA0556-201ENST00000261588 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
KIAA0556-201ENST00000261588 SOX12O15370 315 aa14.75□□□□□ -0.05
KIAA0556-201ENST00000261588 RGL3Q3MIN7 710 aa14.75□□□□□ -0.05
KIAA0556-201ENST00000261588 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
KIAA0556-201ENST00000261588 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
KIAA0556-201ENST00000261588 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.75□□□□□ -0.05
KIAA0556-201ENST00000261588 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
KIAA0556-201ENST00000261588 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa14.74□□□□□ -0.05
KIAA0556-201ENST00000261588 KIF27Q86VH2 1401 aa14.74□□□□□ -0.05
KIAA0556-201ENST00000261588 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
KIAA0556-201ENST00000261588 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
KIAA0556-201ENST00000261588 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.71□□□□□ -0.05
KIAA0556-201ENST00000261588 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.71□□□□□ -0.06
KIAA0556-201ENST00000261588 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
KIAA0556-201ENST00000261588 MLECQ14165 292 aa14.7□□□□□ -0.06
KIAA0556-201ENST00000261588 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa14.7□□□□□ -0.06
KIAA0556-201ENST00000261588 NUDCQ9Y266 331 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms