RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258398.8

TTLL4-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TTLL4, Length 4,730 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL4-201ENST00000258398 FAM9BQ8IZU0 186 aa12.18□□□□□ -0.46
TTLL4-201ENST00000258398 KIF21BO75037 1637 aa12.16□□□□□ -0.46
TTLL4-201ENST00000258398 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
TTLL4-201ENST00000258398 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
TTLL4-201ENST00000258398 BCL11AQ9H165 835 aa12.13□□□□□ -0.47
TTLL4-201ENST00000258398 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa12.13□□□□□ -0.47
TTLL4-201ENST00000258398 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa12.12□□□□□ -0.47
TTLL4-201ENST00000258398 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa12.11□□□□□ -0.47
TTLL4-201ENST00000258398 TMC1Q8TDI8 760 aa12.11□□□□□ -0.47
TTLL4-201ENST00000258398 DDRGK1Q96HY6 314 aa12.1□□□□□ -0.47
TTLL4-201ENST00000258398 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
TTLL4-201ENST00000258398 SIN3AQ96ST3 1273 aa12.08□□□□□ -0.48
TTLL4-201ENST00000258398 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
TTLL4-201ENST00000258398 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa12.07□□□□□ -0.48
TTLL4-201ENST00000258398 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
TTLL4-201ENST00000258398 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
TTLL4-201ENST00000258398 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa12.07□□□□□ -0.48
TTLL4-201ENST00000258398 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
TTLL4-201ENST00000258398 NBR1Q14596 966 aa12.06□□□□□ -0.48
TTLL4-201ENST00000258398 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
TTLL4-201ENST00000258398 CUX2O14529 1486 aa12.05□□□□□ -0.48
TTLL4-201ENST00000258398 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
TTLL4-201ENST00000258398 ERICH3Q5RHP9 1530 aa12.04□□□□□ -0.48
TTLL4-201ENST00000258398 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
TTLL4-201ENST00000258398 CHIC2Q9UKJ5 165 aa12.02□□□□□ -0.48
TTLL4-201ENST00000258398 CANXP27824 592 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
TTLL4-201ENST00000258398 FMN1Q68DA7 1419 aa12.01□□□□□ -0.49
TTLL4-201ENST00000258398 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
TTLL4-201ENST00000258398 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
TTLL4-201ENST00000258398 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa11.99□□□□□ -0.49
TTLL4-201ENST00000258398 FANCIQ9NVI1 1328 aa11.99□□□□□ -0.49
TTLL4-201ENST00000258398 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
TTLL4-201ENST00000258398 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.99□□□□□ -0.49
TTLL4-201ENST00000258398 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa11.97□□□□□ -0.49
TTLL4-201ENST00000258398 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
TTLL4-201ENST00000258398 DEKP35659 375 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TTLL4-201ENST00000258398 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
TTLL4-201ENST00000258398 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.5
TTLL4-201ENST00000258398 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa11.92□□□□□ -0.5
TTLL4-201ENST00000258398 TSPY4P0CV99 314 aa11.91□□□□□ -0.5
TTLL4-201ENST00000258398 TSPY10P0CW01 314 aa11.91□□□□□ -0.5
TTLL4-201ENST00000258398 ARID3CA6NKF2 412 aa11.9□□□□□ -0.5
TTLL4-201ENST00000258398 BECN1Q14457 450 aa11.9□□□□□ -0.5
TTLL4-201ENST00000258398 SYNJ1O43426 1573 aa11.89□□□□□ -0.51
TTLL4-201ENST00000258398 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
TTLL4-201ENST00000258398 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TTLL4-201ENST00000258398 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TTLL4-201ENST00000258398 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TTLL4-201ENST00000258398 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.86□□□□□ -0.51
TTLL4-201ENST00000258398 NEFMP07197 916 aa11.86□□□□□ -0.51
TTLL4-201ENST00000258398 ZBED9Q6R2W3 1325 aa11.86□□□□□ -0.51
TTLL4-201ENST00000258398 ARAP1Q96P48 1450 aa11.86□□□□□ -0.51
TTLL4-201ENST00000258398 TOP2BQ02880 1626 aa11.86□□□□□ -0.51
TTLL4-201ENST00000258398 NUDCQ9Y266 331 aa11.86□□□□□ -0.51
TTLL4-201ENST00000258398 PRXQ9BXM0 1461 aa11.86□□□□□ -0.51
TTLL4-201ENST00000258398 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.85□□□□□ -0.51
TTLL4-201ENST00000258398 CARD11Q9BXL7 1154 aa11.85□□□□□ -0.51
TTLL4-201ENST00000258398 CUX1P39880 1505 aa11.85□□□□□ -0.51
TTLL4-201ENST00000258398 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TTLL4-201ENST00000258398 CDCA8Q53HL2 280 aa11.84□□□□□ -0.51
TTLL4-201ENST00000258398 UACAQ9BZF9 1416 aa11.83□□□□□ -0.52
TTLL4-201ENST00000258398 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
TTLL4-201ENST00000258398 KCNH8Q96L42 1107 aa11.83□□□□□ -0.52
TTLL4-201ENST00000258398 USP35Q9P2H5 1018 aa11.82□□□□□ -0.52
TTLL4-201ENST00000258398 RALBP1Q15311 655 aa11.82□□□□□ -0.52
TTLL4-201ENST00000258398 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
TTLL4-201ENST00000258398 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
TTLL4-201ENST00000258398 FHOD3Q2V2M9 1422 aa11.81□□□□□ -0.52
TTLL4-201ENST00000258398 MPHOSPH9Q99550 1183 aa11.81□□□□□ -0.52
TTLL4-201ENST00000258398 PDE3BQ13370 1112 aa11.8□□□□□ -0.52
TTLL4-201ENST00000258398 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa11.8□□□□□ -0.52
TTLL4-201ENST00000258398 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
TTLL4-201ENST00000258398 MAP3K1Q13233 1512 aa11.79□□□□□ -0.52
TTLL4-201ENST00000258398 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.79□□□□□ -0.521e-6■□□□□ 9.9
TTLL4-201ENST00000258398 FBLN2P98095 1184 aa11.79□□□□□ -0.52
TTLL4-201ENST00000258398 CADPSQ9ULU8 1353 aa11.79□□□□□ -0.52
TTLL4-201ENST00000258398 FGD6Q6ZV73 1430 aa11.79□□□□□ -0.52
TTLL4-201ENST00000258398 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.78□□□□□ -0.52
TTLL4-201ENST00000258398 CNTLNQ9NXG0 1405 aa11.78□□□□□ -0.52
TTLL4-201ENST00000258398 TIAM1Q13009 1591 aa11.78□□□□□ -0.52
TTLL4-201ENST00000258398 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
TTLL4-201ENST00000258398 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
TTLL4-201ENST00000258398 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
TTLL4-201ENST00000258398 SLC24A1O60721 1099 aa11.77□□□□□ -0.53
TTLL4-201ENST00000258398 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.76□□□□□ -0.53
TTLL4-201ENST00000258398 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.76□□□□□ -0.53
TTLL4-201ENST00000258398 PLEKHD1A6NEE1 506 aa11.76□□□□□ -0.53
TTLL4-201ENST00000258398 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.76□□□□□ -0.53
TTLL4-201ENST00000258398 IGF1RP08069 1367 aa11.76□□□□□ -0.53
TTLL4-201ENST00000258398 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
TTLL4-201ENST00000258398 RCAN3Q9UKA8 241 aa11.75□□□□□ -0.53
TTLL4-201ENST00000258398 KNSTRNQ9Y448 316 aa11.75□□□□□ -0.53
TTLL4-201ENST00000258398 L3MBTL2Q969R5 705 aa11.75□□□□□ -0.53
TTLL4-201ENST00000258398 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.74□□□□□ -0.53
TTLL4-201ENST00000258398 KIF15Q9NS87 1388 aa11.74□□□□□ -0.53
TTLL4-201ENST00000258398 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
TTLL4-201ENST00000258398 NCAPD3P42695 1498 aa11.73□□□□□ -0.53
TTLL4-201ENST00000258398 PEG3Q9GZU2 1588 aa11.72□□□□□ -0.53
TTLL4-201ENST00000258398 MS4A1P11836 297 aa11.72□□□□□ -0.53
TTLL4-201ENST00000258398 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128.2 ms