RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
TTL-201ENST00000233336 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
TTL-201ENST00000233336 FBLN2P98095 1184 aa13.47□□□□□ -0.25
TTL-201ENST00000233336 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
TTL-201ENST00000233336 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP13.46□□□□□ -0.26
TTL-201ENST00000233336 CHIC2Q9UKJ5 165 aa13.45□□□□□ -0.26
TTL-201ENST00000233336 DEKP35659 375 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
TTL-201ENST00000233336 GOLGA3Q08378 1498 aa13.45□□□□□ -0.26
TTL-201ENST00000233336 PPP4R2Q9NY27 417 aa13.44□□□□□ -0.26
TTL-201ENST00000233336 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
TTL-201ENST00000233336 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa13.4□□□□□ -0.26
TTL-201ENST00000233336 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
TTL-201ENST00000233336 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa13.39□□□□□ -0.27
TTL-201ENST00000233336 MTUS2Q5JR59 1369 aa13.38□□□□□ -0.27
TTL-201ENST00000233336 GOLGA6L22H0YM25 854 aa13.37□□□□□ -0.27
TTL-201ENST00000233336 MYH16Q9H6N6 1097 aa13.37□□□□□ -0.27
TTL-201ENST00000233336 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa13.36□□□□□ -0.27
TTL-201ENST00000233336 EEA1Q15075 1411 aa13.36□□□□□ -0.27
TTL-201ENST00000233336 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
TTL-201ENST00000233336 PTMAP06454 111 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
TTL-201ENST00000233336 NCLP19338 710 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
TTL-201ENST00000233336 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
TTL-201ENST00000233336 CHGAP10645 457 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
TTL-201ENST00000233336 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.3□□□□□ -0.28
TTL-201ENST00000233336 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa13.3□□□□□ -0.28
TTL-201ENST00000233336 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa13.29□□□□□ -0.28
TTL-201ENST00000233336 RGS3P49796 1198 aa13.28□□□□□ -0.28
TTL-201ENST00000233336 TNIKQ9UKE5 1360 aa13.27□□□□□ -0.28
TTL-201ENST00000233336 CEP164Q9UPV0 1460 aa13.27□□□□□ -0.28
TTL-201ENST00000233336 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa13.26□□□□□ -0.29
TTL-201ENST00000233336 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
TTL-201ENST00000233336 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
TTL-201ENST00000233336 SIN3AQ96ST3 1273 aa13.22□□□□□ -0.29
TTL-201ENST00000233336 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
TTL-201ENST00000233336 CCER2I3L3R5 266 aa13.2□□□□□ -0.3
TTL-201ENST00000233336 TPRNQ4KMQ1 711 aa13.19□□□□□ -0.3
TTL-201ENST00000233336 STAG3Q9UJ98 1225 aa13.19□□□□□ -0.3
TTL-201ENST00000233336 CASC1Q6TDU7 716 aa13.19□□□□□ -0.3
TTL-201ENST00000233336 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
TTL-201ENST00000233336 TSPY4P0CV99 314 aa13.18□□□□□ -0.3
TTL-201ENST00000233336 TSPY10P0CW01 314 aa13.18□□□□□ -0.3
TTL-201ENST00000233336 KNSTRNQ9Y448 316 aa13.18□□□□□ -0.3
TTL-201ENST00000233336 ARID3AQ99856 593 aa13.18□□□□□ -0.3
TTL-201ENST00000233336 CCNB3Q8WWL7 1395 aa13.17□□□□□ -0.3
TTL-201ENST00000233336 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP13.17□□□□□ -0.3
TTL-201ENST00000233336 MSNP26038 577 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TTL-201ENST00000233336 CARD11Q9BXL7 1154 aa13.13□□□□□ -0.31
TTL-201ENST00000233336 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TTL-201ENST00000233336 HSCBQ8IWL3 235 aa13.13□□□□□ -0.31
TTL-201ENST00000233336 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TTL-201ENST00000233336 CFAP53Q96M91 514 aa13.11□□□□□ -0.31
TTL-201ENST00000233336 RGL3Q3MIN7 710 aa13.1□□□□□ -0.31
TTL-201ENST00000233336 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
TTL-201ENST00000233336 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
TTL-201ENST00000233336 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa13.1□□□□□ -0.31
TTL-201ENST00000233336 PLCB2Q00722 1185 aa13.1□□□□□ -0.31
TTL-201ENST00000233336 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
TTL-201ENST00000233336 NEUROD2Q15784 382 aa13.09□□□□□ -0.31
TTL-201ENST00000233336 KIF27Q86VH2 1401 aa13.09□□□□□ -0.31
TTL-201ENST00000233336 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
TTL-201ENST00000233336 CDCA8Q53HL2 280 aa13.08□□□□□ -0.31
TTL-201ENST00000233336 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
TTL-201ENST00000233336 VSIG10Q8N0Z9 540 aa13.08□□□□□ -0.32
TTL-201ENST00000233336 SETD5Q9C0A6 1442 aa13.07□□□□□ -0.32
TTL-201ENST00000233336 ABCC8Q09428 1581 aa13.07□□□□□ -0.32
TTL-201ENST00000233336 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TTL-201ENST00000233336 VPS8Q8N3P4 1428 aa13.05□□□□□ -0.32
TTL-201ENST00000233336 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
TTL-201ENST00000233336 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
TTL-201ENST00000233336 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
TTL-201ENST00000233336 RSPH6AQ9H0K4 717 aa13.03□□□□□ -0.32
TTL-201ENST00000233336 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa13.03□□□□□ -0.32
TTL-201ENST00000233336 FHAD1B1AJZ9 1412 aa13.02□□□□□ -0.32
TTL-201ENST00000233336 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 SOGA1O94964 1423 aa13.02□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 MS4A1P11836 297 aa13.02□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 RCAN3Q9UKA8 241 aa13.01□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa13.01□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 ZBTB7CA1YPR0 619 aa13.01□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa13.01□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa13.01□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 NACADO15069 1562 aa13□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 GBP4Q96PP9 640 aa12.99□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa12.98□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 PTMSP20962 102 aa12.98□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 NRDCO43847 1150 aa12.97□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 DRC7Q8IY82 874 aa12.97□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa12.97□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 PLPPR3Q6T4P5 718 aa12.96□□□□□ -0.33
TTL-201ENST00000233336 WIZO95785 1651 aa12.95□□□□□ -0.34
TTL-201ENST00000233336 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa12.94□□□□□ -0.34
TTL-201ENST00000233336 KIAA2012Q0VF49 1180 aa12.94□□□□□ -0.34
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