RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000217351.1

Ccdc84-212, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Ccdc84, Length 888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Cep170Q6A065 1588 aa35,92■■■■□ 3,34
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Abcc1O35379 1528 aa35,85■■■■□ 3,33
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Npm2Q80W85 207 aa35,84■■■■□ 3,33
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Gm156Q58A37 223 aa35,79■■■■□ 3,32
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa35,78■■■■□ 3,32
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa35,75■■■■□ 3,31
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 CadpsQ80TJ1 1355 aa35,75■■■■□ 3,31
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Abca16E9PWJ7 1678 aa35,75■■■■□ 3,31
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Arhgap27A2AB59 869 aa35,74■■■■□ 3,31
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Chd1P40201 1711 aa35,74■■■■□ 3,31
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa35,73■■■■□ 3,31
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 WizO88286 1684 aaKnown RBP35,73■■■■□ 3,31
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa35,72■■■■□ 3,31
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP35,72■■■■□ 3,31
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP35,66■■■■□ 3,3
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP35,66■■■■□ 3,3
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Abcc2Q8VI47 1543 aa35,66■■■■□ 3,3
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 PxdnQ3UQ28 1475 aa35,64■■■■□ 3,3
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Adamts12Q811B3 1600 aa35,63■■■■□ 3,29
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Soga1E1U8D0 1418 aa35,63■■■■□ 3,29
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Neo1P97798 1493 aa35,62■■■■□ 3,29
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 PtprtQ99M80 1454 aa35,61■■■■□ 3,29
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Map3k4O08648 1597 aa35,59■■■■□ 3,29
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 BC005561E9Q5E2 1589 aa35,58■■■■□ 3,29
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa35,52■■■■□ 3,28
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa35,51■■■■□ 3,28
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Gab3Q8BSM5 595 aa35,5■■■■□ 3,27
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Gm14025A2AP89 1413 aa35,49■■■■□ 3,27
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Carmil1Q6EDY6 1374 aa35,48■■■■□ 3,27
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP35,43■■■■□ 3,26
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Rpap1Q80TE0 1409 aa35,43■■■■□ 3,26
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Pprc1Q6NZN1 1644 aa35,4■■■■□ 3,26
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Arhgap35Q91YM2 1499 aa35,39■■■■□ 3,26
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Slx4Q6P1D7 1565 aa35,38■■■■□ 3,25
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Map3k1P53349 1493 aa35,36■■■■□ 3,25
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa35,35■■■■□ 3,25
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 HrcG5E8J6 738 aa35,3■■■■□ 3,24
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP35,29■■■■□ 3,24
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Setbp1Q9Z180 1582 aa35,27■■■■□ 3,24
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Jph4Q80WT0 628 aa35,25■■■■□ 3,23
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 AI481877A2ALV5 1481 aa35,23■■■■□ 3,23
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP35,23■■■■□ 3,23
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa35,22■■■■□ 3,23
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ak9G3UYQ4 1894 aa35,22■■■■□ 3,23
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Abca5Q8K448 1642 aa35,2■■■■□ 3,23
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa35,17■■■■□ 3,22
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP35,16■■■■□ 3,22
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Clip1Q922J3 1391 aa35,14■■■■□ 3,22
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 WrnO09053 1401 aa35,11■■■■□ 3,21
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Cep162Q6ZQ06 1403 aa35,11■■■■□ 3,21
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Myt1lP97500 1187 aa35,09■■■■□ 3,21
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Cux1P53564 1515 aa35,08■■■■□ 3,21
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP34,99■■■■□ 3,19
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Fyco1Q8VDC1 1437 aa34,98■■■■□ 3,19
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Arid3cA6PWV5 409 aa34,89■■■■□ 3,18
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Igf1rQ60751 1373 aa34,88■■■■□ 3,17
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Kdm5bQ80Y84 1544 aa34,86■■■■□ 3,17
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP34,82■■■■□ 3,16
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa34,8■■■■□ 3,16
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa34,79■■■■□ 3,16
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ttc37F8VPK0 1563 aa34,75■■■■□ 3,15
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Znf608Q56A10 1511 aa34,75■■■■□ 3,15
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa34,74■■■■□ 3,15
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ankrd26Q811D2 1581 aa34,72■■■■□ 3,15
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 AdgbG3UZ78 1657 aa34,71■■■■□ 3,15
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Wdr7Q920I9 1489 aa34,71■■■■□ 3,15
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Cul7Q8VE73 1689 aa34,69■■■■□ 3,14
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 NhsB1AV60 1647 aa34,67■■■■□ 3,14
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Depdc5P61460 1591 aa34,66■■■■□ 3,14
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa34,66■■■■□ 3,14
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Aebp1Q640N1 1128 aa34,59■■■■□ 3,13
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Atp10dQ8K2X1 1416 aa34,56■■■■□ 3,12
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Zfyve16Q80U44 1528 aa34,55■■■■□ 3,12
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Mroh2aD3Z750 1679 aa34,55■■■■□ 3,12
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa34,54■■■■□ 3,12
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Gcc2Q8CHG3 1679 aa34,54■■■■□ 3,12
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ncoa2Q61026 1462 aa34,52■■■■□ 3,12
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Kif27Q7M6Z4 1394 aa34,51■■■■□ 3,12
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Setd5Q5XJV7 1441 aa34,49■■■■□ 3,11
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Arhgef11Q68FM7 1552 aa34,42■■■■□ 3,1
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Fancd2Q80V62 1450 aa34,42■■■■□ 3,1
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 BlmO88700 1416 aa34,42■■■■□ 3,1
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa34,42■■■■□ 3,1
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Erich3F6QRE9 1637 aa34,41■■■■□ 3,1
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Fndc1E9Q043 1732 aa34,41■■■■□ 3,1
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa34,38■■■■□ 3,09
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP34,37■■■■□ 3,09
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Arap1Q4LDD4 1452 aa34,36■■■■□ 3,09
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Magi1Q6RHR9 1471 aa34,34■■■■□ 3,09
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Plppr3Q7TPB0 716 aa34,34■■■■□ 3,09
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Abca8bQ8K440 1620 aa34,33■■■■□ 3,09
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa34,33■■■■□ 3,09
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Eea1Q8BL66 1411 aa34,33■■■■□ 3,09
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 AglF8VPN4 1532 aa34,33■■■■□ 3,09
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Pcf11G3X9Z4 1553 aa34,31■■■■□ 3,08
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Prex2Q3LAC4 1598 aa34,26■■■■□ 3,07
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 A2mQ6GQT1 1474 aa34,18■■■■□ 3,06
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Ncoa3O09000 1398 aa34,16■■■■□ 3,06
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Fam163aQ8CAA5 168 aa34,13■■■■□ 3,05
Ccdc84-212ENSMUST00000217351 Dnajc5gQ8C632 165 aa34,12■■■■□ 3,05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39,4 ms