RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000215462.1

Tmod2-207, Transcript of Tropomodulin-2, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Tmod2, Length 1,564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Abcc1O35379 1528 aa24.77■■□□□ 1.56
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Shroom4Q1W617 1475 aa24.76■■□□□ 1.55
Tmod2-207ENSMUST00000215462 SynmQ70IV5 1561 aa24.76■■□□□ 1.55
Tmod2-207ENSMUST00000215462 PtprtQ99M80 1454 aa24.76■■□□□ 1.55
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Gpatch8A2A6A1 1505 aa24.72■■□□□ 1.55
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Chic1Q8CBW7 227 aa24.71■■□□□ 1.55
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Chd1P40201 1711 aa24.68■■□□□ 1.54
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Zeb1Q64318 1117 aa24.66■■□□□ 1.54
Tmod2-207ENSMUST00000215462 CadpsQ80TJ1 1355 aa24.64■■□□□ 1.53
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Pprc1Q6NZN1 1644 aa24.61■■□□□ 1.53
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa24.6■■□□□ 1.53
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Abca16E9PWJ7 1678 aa24.59■■□□□ 1.53
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Arhgap27A2AB59 869 aa24.57■■□□□ 1.52
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Soga1E1U8D0 1418 aa24.57■■□□□ 1.52
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Abcc2Q8VI47 1543 aa24.56■■□□□ 1.52
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Neo1P97798 1493 aa24.56■■□□□ 1.52
Tmod2-207ENSMUST00000215462 BC005561E9Q5E2 1589 aa24.55■■□□□ 1.52
Tmod2-207ENSMUST00000215462 WizO88286 1684 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
Tmod2-207ENSMUST00000215462 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa24.54■■□□□ 1.52
Tmod2-207ENSMUST00000215462 PxdnQ3UQ28 1475 aa24.53■■□□□ 1.52
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Map3k4O08648 1597 aa24.5■■□□□ 1.51
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Adamts12Q811B3 1600 aa24.45■■□□□ 1.51
Tmod2-207ENSMUST00000215462 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Gm14025A2AP89 1413 aa24.45■■□□□ 1.51
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Setbp1Q9Z180 1582 aa24.44■■□□□ 1.5
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa24.41■■□□□ 1.5
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Npm2Q80W85 207 aa24.39■■□□□ 1.5
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Ak9G3UYQ4 1894 aa24.38■■□□□ 1.49
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa24.37■■□□□ 1.49
Tmod2-207ENSMUST00000215462 AI481877A2ALV5 1481 aa24.34■■□□□ 1.49
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa24.34■■□□□ 1.49
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Slx4Q6P1D7 1565 aa24.34■■□□□ 1.49
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Rpap1Q80TE0 1409 aa24.3■■□□□ 1.48
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Carmil1Q6EDY6 1374 aa24.24■■□□□ 1.47
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Jph4Q80WT0 628 aa24.24■■□□□ 1.47
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa24.22■■□□□ 1.47
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Map3k1P53349 1493 aa24.17■■□□□ 1.46
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Abca5Q8K448 1642 aa24.14■■□□□ 1.45
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Arhgap35Q91YM2 1499 aa24.13■■□□□ 1.45
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Arid3cA6PWV5 409 aa24.1■■□□□ 1.45
Tmod2-207ENSMUST00000215462 WrnO09053 1401 aa24.08■■□□□ 1.45
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Ttc37F8VPK0 1563 aa24.08■■□□□ 1.44
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Gab3Q8BSM5 595 aa24.08■■□□□ 1.44
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
Tmod2-207ENSMUST00000215462 AdgbG3UZ78 1657 aa24.06■■□□□ 1.44
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa24.03■■□□□ 1.44
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa24.03■■□□□ 1.44
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Depdc5P61460 1591 aa24.01■■□□□ 1.43
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Znf608Q56A10 1511 aa24.01■■□□□ 1.43
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Cux1P53564 1515 aa24■■□□□ 1.43
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Igf1rQ60751 1373 aa23.98■■□□□ 1.43
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Kdm5bQ80Y84 1544 aa23.98■■□□□ 1.43
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa23.97■■□□□ 1.43
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Clip1Q922J3 1391 aa23.93■■□□□ 1.42
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Wdr7Q920I9 1489 aa23.9■■□□□ 1.42
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Zfyve16Q80U44 1528 aa23.89■■□□□ 1.42
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Arhgef11Q68FM7 1552 aa23.89■■□□□ 1.41
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Cul7Q8VE73 1689 aa23.88■■□□□ 1.41
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Plppr3Q7TPB0 716 aa23.87■■□□□ 1.41
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa23.87■■□□□ 1.41
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Fyco1Q8VDC1 1437 aa23.87■■□□□ 1.41
Tmod2-207ENSMUST00000215462 NhsB1AV60 1647 aa23.86■■□□□ 1.41
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Fndc1E9Q043 1732 aa23.85■■□□□ 1.41
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Cep162Q6ZQ06 1403 aa23.84■■□□□ 1.41
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Myt1lP97500 1187 aa23.84■■□□□ 1.41
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa23.82■■□□□ 1.4
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Atp10dQ8K2X1 1416 aa23.79■■□□□ 1.4
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Alpk3Q924C5 1678 aa23.78■■□□□ 1.4
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Dnajc5gQ8C632 165 aa23.76■■□□□ 1.39
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Mroh2aD3Z750 1679 aa23.73■■□□□ 1.39
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Gcc2Q8CHG3 1679 aa23.71■■□□□ 1.39
Tmod2-207ENSMUST00000215462 AglF8VPN4 1532 aa23.7■■□□□ 1.38
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Ankrd26Q811D2 1581 aa23.68■■□□□ 1.38
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa23.65■■□□□ 1.38
Tmod2-207ENSMUST00000215462 HrcG5E8J6 738 aa23.64■■□□□ 1.37
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Ncoa2Q61026 1462 aa23.61■■□□□ 1.37
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Fancd2Q80V62 1450 aa23.61■■□□□ 1.37
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Abca8bQ8K440 1620 aa23.6■■□□□ 1.37
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Aebp1Q640N1 1128 aa23.6■■□□□ 1.37
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa23.59■■□□□ 1.37
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Kif27Q7M6Z4 1394 aa23.58■■□□□ 1.36
Tmod2-207ENSMUST00000215462 BlmO88700 1416 aa23.58■■□□□ 1.36
Tmod2-207ENSMUST00000215462 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Rnf17Q99MV7 1640 aa23.56■■□□□ 1.36
Tmod2-207ENSMUST00000215462 A2mQ6GQT1 1474 aa23.55■■□□□ 1.36
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Arap1Q4LDD4 1452 aa23.54■■□□□ 1.36
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Magi1Q6RHR9 1471 aa23.52■■□□□ 1.36
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Prex2Q3LAC4 1598 aa23.5■■□□□ 1.35
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa23.45■■□□□ 1.34
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Setd5Q5XJV7 1441 aa23.44■■□□□ 1.34
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa23.44■■□□□ 1.34
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa23.42■■□□□ 1.34
Tmod2-207ENSMUST00000215462 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.8 ms