RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000196264.4

Lmo4-207, Transcript of LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Lmo4, Length 1,263 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ak9G3UYQ4 1894 aa26.92■■□□□ 1.9
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Samd9lQ69Z37 1561 aa26.91■■□□□ 1.9
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa26.87■■□□□ 1.89
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Lmo4-207ENSMUST00000196264 CadpsQ80TJ1 1355 aa26.8■■□□□ 1.88
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Cyb5rlB1AS42 316 aa26.79■■□□□ 1.88
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Grin2aP35436 1464 aa26.77■■□□□ 1.88
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Rad54l2Q99NG0 1466 aa26.76■■□□□ 1.87
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Soga1E1U8D0 1418 aa26.73■■□□□ 1.87
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Arhgef11Q68FM7 1552 aa26.71■■□□□ 1.87
Lmo4-207ENSMUST00000196264 AdgbG3UZ78 1657 aa26.71■■□□□ 1.87
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Magi3Q9EQJ9 1476 aa26.71■■□□□ 1.87
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Plppr3Q7TPB0 716 aa26.68■■□□□ 1.86
Lmo4-207ENSMUST00000196264 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Grin2bQ01097 1482 aa26.68■■□□□ 1.86
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Fbxo41Q6NS60 873 aa26.64■■□□□ 1.86
Lmo4-207ENSMUST00000196264 AI481877A2ALV5 1481 aa26.63■■□□□ 1.85
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa26.59■■□□□ 1.85
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ttc37F8VPK0 1563 aa26.57■■□□□ 1.84
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa26.56■■□□□ 1.84
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa26.55■■□□□ 1.84
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Efcab5A0JP43 1406 aa26.55■■□□□ 1.84
Lmo4-207ENSMUST00000196264 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Hecw2Q6I6G8 1578 aa26.54■■□□□ 1.84
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Neo1P97798 1493 aa26.49■■□□□ 1.83
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Brwd3A2AHJ4 1799 aa26.48■■□□□ 1.83
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Gm14025A2AP89 1413 aa26.47■■□□□ 1.83
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Dnajc5gQ8C632 165 aa26.43■■□□□ 1.82
Lmo4-207ENSMUST00000196264 BC005561E9Q5E2 1589 aa26.41■■□□□ 1.82
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Pla2r1Q62028 1487 aa26.39■■□□□ 1.82
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Depdc5P61460 1591 aa26.37■■□□□ 1.81
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Fndc1E9Q043 1732 aa26.36■■□□□ 1.81
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Gpatch8A2A6A1 1505 aa26.35■■□□□ 1.81
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Arhgap27A2AB59 869 aa26.35■■□□□ 1.81
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Cngb1E1AZ71 1325 aa26.31■■□□□ 1.8
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Fmn1Q05860 1466 aa26.3■■□□□ 1.8
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Arid3cA6PWV5 409 aa26.29■■□□□ 1.8
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Abcc2Q8VI47 1543 aa26.29■■□□□ 1.8
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Map3k4O08648 1597 aa26.28■■□□□ 1.8
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Zfyve16Q80U44 1528 aa26.24■■□□□ 1.79
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Abca16E9PWJ7 1678 aa26.21■■□□□ 1.79
Lmo4-207ENSMUST00000196264 SynmQ70IV5 1561 aa26.13■■□□□ 1.77
Lmo4-207ENSMUST00000196264 PxdnQ3UQ28 1475 aa26.12■■□□□ 1.77
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa26.12■■□□□ 1.77
Lmo4-207ENSMUST00000196264 NrkQ9R0G8 1455 aa26.1■■□□□ 1.77
Lmo4-207ENSMUST00000196264 WizO88286 1684 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
Lmo4-207ENSMUST00000196264 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa26.09■■□□□ 1.77
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa26.06■■□□□ 1.76
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Slx4Q6P1D7 1565 aa26.04■■□□□ 1.76
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Jph4Q80WT0 628 aa26.02■■□□□ 1.76
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Znf608Q56A10 1511 aa25.97■■□□□ 1.75
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Igf1rQ60751 1373 aa25.95■■□□□ 1.74
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa25.94■■□□□ 1.74
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Adamts12Q811B3 1600 aa25.93■■□□□ 1.74
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Rnf17Q99MV7 1640 aa25.92■■□□□ 1.74
Lmo4-207ENSMUST00000196264 GapdhsQ64467 440 aa25.88■■□□□ 1.73
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Naip2Q9QUK4 1447 aa25.84■■□□□ 1.73
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Zeb1Q64318 1117 aa25.83■■□□□ 1.73
Lmo4-207ENSMUST00000196264 AglF8VPN4 1532 aa25.83■■□□□ 1.72
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ecm2Q5FW85 670 aa25.82■■□□□ 1.72
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Wdr7Q920I9 1489 aa25.8■■□□□ 1.72
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Shroom4Q1W617 1475 aa25.79■■□□□ 1.72
Lmo4-207ENSMUST00000196264 PtprmP28828 1452 aa25.76■■□□□ 1.71
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Kdm5bQ80Y84 1544 aa25.74■■□□□ 1.71
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Rpap1Q80TE0 1409 aa25.71■■□□□ 1.71
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Abca5Q8K448 1642 aa25.63■■□□□ 1.69
Lmo4-207ENSMUST00000196264 MyclP10166 368 aa25.55■■□□□ 1.68
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Cul7Q8VE73 1689 aa25.55■■□□□ 1.68
Lmo4-207ENSMUST00000196264 NhsB1AV60 1647 aa25.54■■□□□ 1.68
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa25.53■■□□□ 1.68
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Atp10dQ8K2X1 1416 aa25.53■■□□□ 1.68
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Neurl4Q5NCX5 1563 aa25.49■■□□□ 1.67
Lmo4-207ENSMUST00000196264 WrnO09053 1401 aa25.49■■□□□ 1.67
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Qser1A2BIE1 1698 aa25.48■■□□□ 1.67
Lmo4-207ENSMUST00000196264 A2mQ6GQT1 1474 aa25.47■■□□□ 1.67
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
Lmo4-207ENSMUST00000196264 SphkapQ6NSW3 1687 aa25.44■■□□□ 1.66
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa25.4■■□□□ 1.66
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa25.4■■□□□ 1.66
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Camsap2Q8C1B1 1461 aa25.4■■□□□ 1.66
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Abca8bQ8K440 1620 aa25.29■■□□□ 1.64
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Synj2Q9D2G5 1434 aa25.29■■□□□ 1.64
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa25.28■■□□□ 1.64
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Scn4aQ9ER60 1841 aa25.25■■□□□ 1.63
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Carmil1Q6EDY6 1374 aa25.22■■□□□ 1.63
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa25.21■■□□□ 1.63
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Map3k1P53349 1493 aa25.2■■□□□ 1.62
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Gcc2Q8CHG3 1679 aa25.19■■□□□ 1.62
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Atp10aO54827 1508 aa25.12■■□□□ 1.61
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Pip4k2bQ80XI4 416 aa25.1■■□□□ 1.61
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 8.1 ms