RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000180805.1

2210008F06Rik-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene 2210008F06Rik, Length 1,082 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 PtprtQ99M80 1454 aa44,52■■■■■ 4,72
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2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 Rpap1Q80TE0 1409 aa43,59■■■■■ 4,57
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2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 Carmil1Q6EDY6 1374 aa43,46■■■■■ 4,55
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2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP43,32■■■■■ 4,53
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2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 Arhgap35Q91YM2 1499 aa43,27■■■■■ 4,52
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2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa43,19■■■■■ 4,5
2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP43,17■■■■■ 4,5
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2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 Depdc5P61460 1591 aa43,14■■■■■ 4,5
2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP43,12■■■■■ 4,49
2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 Znf608Q56A10 1511 aa43,12■■■■■ 4,49
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2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 Gab3Q8BSM5 595 aa43,08■■■■■ 4,49
2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 Kdm5bQ80Y84 1544 aa43,07■■■■■ 4,48
2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 Cux1P53564 1515 aa43,06■■■■■ 4,48
2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 Igf1rQ60751 1373 aa43,05■■■■■ 4,48
2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 Zfyve16Q80U44 1528 aa42,93■■■■■ 4,46
2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 Arhgef11Q68FM7 1552 aa42,93■■■■■ 4,46
2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 Wdr7Q920I9 1489 aa42,92■■■■■ 4,46
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2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 Clip1Q922J3 1391 aa42,9■■■■■ 4,46
2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 Fndc1E9Q043 1732 aa42,85■■■■■ 4,45
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2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 Plppr3Q7TPB0 716 aa42,84■■■■■ 4,45
2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa42,81■■■■■ 4,44
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2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 Fyco1Q8VDC1 1437 aa42,78■■■■■ 4,44
2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa42,73■■■■■ 4,43
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2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 A2mQ6GQT1 1474 aa42,29■■■■■ 4,36
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2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa41,99■■■■■ 4,31
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